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ゲノムデータに対して有効性が高い多重検定法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22500269
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 統計科学
研究機関統計数理研究所

研究代表者

藤澤 洋徳  統計数理研究所, 数理・推論研究系, 准教授 (00301177)

連携研究者 二宮 嘉行  九州大学, 数理学研究院, 准教授 (50343330)
坂口 隆之  大分県立看護科学大学, 看護学部, 助教 (10436496)
高田 豊行  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教 (20356257)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード遺伝子発現差解析 / 有意性検定 / P値
研究概要

P値を推定する際に,標本数の少なさをカバーするために,他の遺伝子のデータを加えることがしばしば行われている.しかしながら,その妥当性は,必ずしも検証されていなかった.本申請研究では,その妥当性が保証されるP値推定の条件を数理的に整理できた.その条件のもとでの最適な検定も導出できた.数値実験でも実データ解析でも,劇的に優れていることが検証できた.平均の同等性だけでなく分散の同等性についても検討した.

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (16件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed2012

    • 著者名/発表者名
      Fujisawa, H. and Sakaguchi, T.
    • 雑誌名

      TEST

      巻: Vol.21 号: 2 ページ: 280-300

    • DOI

      10.1007/s11749-011-0243-5

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ゲノムデータのための統計的手法の開発2012

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      新領域融合プロジェクト外部レビュー
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-10-31
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ゲノムデータ解析のプロジェクトに携わって2012

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      統計サマーセミナー
    • 発表場所
      熱海
    • 年月日
      2012-08-05
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現差解析におけるP値推定と最適な有意性検定2012

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      統計科学セミナー
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-01-13
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現差解析におけるP値推定と最適な有意性検定2012

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      統計科学セミナー
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed2011

    • 著者名/発表者名
      Fujisawa, H.
    • 学会等名
      International Conference on Advances in Probability and Statistics
    • 発表場所
      Hong Kong, China
    • 年月日
      2011-12-30
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed2011

    • 著者名/発表者名
      Fujisawa, H.
    • 学会等名
      7th IASC-ARS Joint 2011 Taipei Symposium
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan,
    • 年月日
      2011-12-17
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP値推定,融合2011

    • 著者名/発表者名
      藤澤 洋徳
    • 学会等名
      「遺伝機能」プロジェクト会議
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      2011-10-20
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] マイクロアレイデータを利用した遺伝子発現差解析において帰無統計量が構成できる検定の中で最適な有意性検定2011

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      名古屋統計セミナー
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-05-20
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] 外れ値の割合が大きい場合にもバイアスが小さいロバスト推定2011

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      広島大学理学部数学教室談話会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2011-01-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP値推定2011

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      融合「遺伝機能」プロジェクト会議
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed2011

    • 著者名/発表者名
      Fujisawa, H.
    • 学会等名
      7th IASC-ARS Joint 2011 Taipei Symposium
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Optimal significance analysis of microarray data in a class of tests whose null statistic can be constructed2011

    • 著者名/発表者名
      Fujisawa, H.
    • 学会等名
      International Conference on Advances in Probability and Statistics
    • 発表場所
      Hong-Kong, China
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP 値推定と最適な有意性検定2010

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳,坂口隆之
    • 学会等名
      科研費研究集会「生物情報解析の理論的基礎とその応用」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP値推定と最適な有意性検定2010

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      研究集会「生物情報解析の理論的基礎とその応用」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ロバスト推測の基礎とダイバージェンス型メソッドへの発展2010

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳
    • 学会等名
      第13回情報論的学習理論ワークショップ
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-11-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子発現差解析における並べ替え技法によるP値の推定2010

    • 著者名/発表者名
      藤澤洋徳,坂口隆之
    • 学会等名
      統計関連学会連合大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-09-07
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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