• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

量子化学計算を用いたグルコース環構造変換過程の網羅的解明とセルラーゼの分子設計

研究課題

研究課題/領域番号 22500272
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体生命情報学
研究機関横浜国立大学

研究代表者

上田 一義  横浜国立大学, 大学院・工学研究院, 教授 (40223458)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2011年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2010年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードコンピューターシミュレーション / コンピュータシミュレーション / 環変換 / グルコース
研究概要

本研究の目的は、グルコースの環構造変換過程を量子化学的計算手法を用いて明らかにすることである。グルコースの環変換過程は地球儀上の緯度と経度の値を用いたClemer-Popleのパラメータにより表記することが出来る。本研究の成果として、Clemer-Pople図の北極部に相当するイス型4C1構造からねじれ配座を経て、南極部のイス型構造である1C4に至る多くの経路とその遷移状態を求めることが出来た。グルコースに関し、このような環変換経路の網羅的な解析はこれまでになく、今後のセルロース利用の基礎情報として重要な成果である。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (17件) (うち査読あり 17件) 学会発表 (25件)

  • [雑誌論文] Importance of the CH/? hydrogen bond in the enhancement of CD amplitude of exomethylene steroids2012

    • 著者名/発表者名
      Osamu Takahashi, Katsuyoshi Yamasaki, Yuji Kohno, Kazuyoshi Ueda, and Motohiro Nishio
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 2 ページ: 10891-10898

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Experimental and theoretical investigation of proton exchange reaction between protic ionic liquid diethylmethylammonium trifluoromethanesulfonate and H2O2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Mori, Takanori Kobayashi, Kazuhisa Sakakibara, and Kazuyoshi Ueda
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 552 ページ: 58-63

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and orientation of bovine lactoferrampin in the bacterial membrane as revealed by Solid-State NMR and molecular dynamics simulation.2012

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Tsutsumi, Namsrai Javkhlantugs, Atsushi Kira, Masako Umeyama, Izuru Kawamura, Kazuyoshi Ueda and Akira Naito
    • 雑誌名

      Biophys. J.

      巻: 103 ページ: 1735-1743

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gromacsのための計算支援ソフトGISPの開発2012

    • 著者名/発表者名
      森一樹、樺島智大、源聡、玉城哲平、上田一義
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem. Soc. Jpn

      巻: 11 ページ: 98-103

    • NAID

      130001908172

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational analysis of an extracellular polysaccharide produced by Sphaerotilus natans2012

    • 著者名/発表者名
      Keiko Kondo, Minoru Takeda, Masato Katahira, Jun-ichi Koizumi, and Kazuyoshi Ueda
    • 雑誌名

      Carbohydrate Research

      巻: 360 ページ: 102-108

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ab initio studies of the crystal structure of cellulose triacetate I.2012

    • 著者名/発表者名
      Takanori Kobayashi, Daichi Hayakawa, Tegshjargal Khishigjargal and Kazuyoshi Ueda
    • 雑誌名

      MRS Online Proceedings Library

      巻: 1470

    • DOI

      10.1557/opl.2012.1204

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rare gas bond property ofRg-Be2O2 and Rg-Be2O2-Rg (Rg = He, Ne, Ar, Kr and Xe) as a comparison withRg-BeO2012

    • 著者名/発表者名
      Takanori Kobayashi, Yuji Kohno, Toshiyuki Takayanagi, Kanekazu Seki, and Kazuyoshi Ueda
    • 雑誌名

      Computational and TheoreticalChemistry

      巻: 991 ページ: 48-55

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Twisted Coordination Mode of Bis(N-Heterocyclic carbine) Ligands in Octahedral Geometry of Group 6 Transition Metal Complexes : Synthesis, Structure, and Reactivity2012

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Ogata, Yoshitaka Yamaguchi, Youji Kurihara, Kazuyoshi Ueda, Hirotaka Nagao, Takashi Ito
    • 雑誌名

      Inorganica Chimica Acta

      巻: 390 ページ: 199-209

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and orientation of bovine lactoferrampin in the bacterial membrane as revealed by Solid-State NMR and molecular dynamics simulation.2012

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Tsutsumi, Namsrai Javkhlantugs, Atsushi Kira, Masako Umeyama, Izuru Kawamura, Kazuyoshi Ueda and Akira Naito
    • 雑誌名

      Biophycal. Journal

      巻: 103 号: 8 ページ: 1735-1743

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2012.09.010

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Influence of the CH/ hydrogen bond on the enhancement of circular dichroism (CD) amplitude of 1,3-cyclohexadiene compounds2012

    • 著者名/発表者名
      Osamu Takahashi, Katsuyoshi Yamasaki, Yuji Kohno, Kazuyoshi Ueda, and Motohiro Nishio
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 2 号: 29 ページ: 10891-10898

    • DOI

      10.1039/c2ra21446f

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Supermolecular Structure of Cellulose/Amylose Blends Prepared from Aqueous NaOH Solutions and Effects of Amylose on Structural Formation of Cellulose from Its Solution2011

    • 著者名/発表者名
      Hitomi Miyamoto, Mariko Ago, Chihiro Yamane, Masaharu Seguchi, Kazuyoshi Ueda, and Kunihiko Okajima
    • 雑誌名

      Carbohydr. Res.

      巻: 346 ページ: 807-814

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulation of Bombolitin II in the Dipalmitoylphosphatidylcholine Membrane biyaer2011

    • 著者名/発表者名
      Namsrai Javkhlantugs, Akira Naito, Kazuyoshi Ueda
    • 雑誌名

      Biophys. J.

      巻: 101 号: 5 ページ: 1212-1220

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2011.07.018

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular dynamics simulation of the dissolution process of cellulose triacetate-II nano-size crystal in DMSO2011

    • 著者名/発表者名
      Daichi Hayakawa, Kazuyoshi Ueda, Chihiro YAMANE, Hitomi MIYAMOTO and Fumitaka HORII
    • 雑誌名

      Carbohydr. Res

      巻: 346 号: 18 ページ: 2940-2947

    • DOI

      10.1016/j.carres.2011.10.019

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Supermolecular Structure of Cellulose/Amylose Blends Prepared from Aqueous NaOH Solutions and Effects of Amylose on Structural Formation of Cellulose from Its Solution2011

    • 著者名/発表者名
      Hitomi Miyamoto, Mariko Ago, Chihiro Yamane, Masaharu Seguchi, Kazuyoshi Ueda, Kunihiko Okajima
    • 雑誌名

      Carbohydrate Research

      巻: 346 ページ: 807-814

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic Structure of Bombolitin II Bound to Lipid Bilayers as Revealed by Solid-state NMR and Molecular-Dynamics Simulation2010

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Toraya, Namsrai Javkhlantugs, Daisuke Mishima, Katsuyuki Nishimura, Kazuyoshi Ueda, Akira Naito
    • 雑誌名

      Biophys. J.

      巻: 99 ページ: 3282-3289

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic Structure of Bombolitin II Bound to Lipid Bilayers as Revealed by Solid-state NMR and Molecular-Dynamics Simulation2010

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Toraya, Namsrai Javkhlantugs, Daisuke Mishima, Katsuyuki Nishimura, Kazuyoshi Ueda
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 99 ページ: 3282-3289

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational Study of Ionic Aggregate of Dodecylether Polyethoxylate with Ferric-Thiocyanate Anion through the Intermediary of Potassium Ion2010

    • 著者名/発表者名
      Yukio Yokoyama, Hidaka Atsumi, Sayaka Yoshida, Naoyuki Sone, Kazuyoshi Ueda
    • 雑誌名

      Analytical Science

      巻: 26 ページ: 1047-1052

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 計算化学によるセルロース系分子の特性と機能解析2012

    • 著者名/発表者名
      上田一義
    • 学会等名
      セルロース学会関西支部主催セルロース学会第17回ミクロシンポジウム
    • 発表場所
      京都大学化学研究所(招待講演)
    • 年月日
      2012-01-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 平成24年度神奈川県ものづくり技術交 流会予稿集、3PS-11,神奈川県産業技術セ ンター2012

    • 著者名/発表者名
      小林 正人、栗原 庸次、田一義
    • 学会等名
      糖α-L-イドピラノースにおける環配座 変換の計算による解析
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Ab initio Studies of the Crystal Structure of Cellulose Triacetate2012

    • 著者名/発表者名
      Takanori Kobayashi, Daich Hayakawa, Tegshjargal Khishigjargal, Kazuyoshi Ueda
    • 学会等名
      2012 MRS Spring Meeting
    • 発表場所
      San Francisco, CA, USA
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Computational Study of Optical Properties of Cellulose Triacetate Film2012

    • 著者名/発表者名
      Daich Hayakawa, Kazuyoshi UEDA
    • 学会等名
      2012 MRS Fall Meeting
    • 発表場所
      Boston, MA, USA
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 量子化学計算によるグルコース環配座変換経路の検討2012

    • 著者名/発表者名
      上田一義、栗原庸次、高橋絵理歌
    • 学会等名
      セルロース学会第19回年次大会
    • 発表場所
      名古屋大学 野依記念学術交流館
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 量子化学計算による1C4グルコース環配座変換経路の探索2012

    • 著者名/発表者名
      栗原庸次、上田一義、高橋絵理歌
    • 学会等名
      セルロース学会第19回年次大会
    • 発表場所
      名古屋大学 野依記念学術交流館
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 超臨界状態におけるセルロース I beta結晶クラスターモデルの溶解機構に関する分子動力学シミュレーション2012

    • 著者名/発表者名
      早川大地、上田一義、宮本ひとみ、山根千弘、堀井文敬
    • 学会等名
      セルロース学会第19回年次大会
    • 発表場所
      名古屋大学 野依記念学術交流館
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] セルロース誘導体によるキラル分割機構の自由エネルギー計算による計算化学的考察2012

    • 著者名/発表者名
      玉城哲平、上田一義、柴田 徹
    • 学会等名
      セルロース学会第19回年次大会
    • 発表場所
      名古屋大学 野依記念学術交流館
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションを用いた水和セルロースの脱水過程2012

    • 著者名/発表者名
      宮本ひとみ、上田一義、 神戸女子大院家政 山根千弘
    • 学会等名
      平成24年度神奈川県ものづくり技術交流会
    • 発表場所
      神奈川県産業技術センター
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 糖α-L-イドピラノースにおける環配座変換の計算による解析2012

    • 著者名/発表者名
      小林 正人、栗原 庸次、上田 一義
    • 学会等名
      平成24年度神奈川県ものづくり技術交流会
    • 発表場所
      神奈川県産業技術センター
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] セルローストリアセテートナノサイズ結晶の溶解過程に関する分子動力学シミュレーション2011

    • 著者名/発表者名
      早川大地・上田一義・山根千弘・宮本ひとみ・堀井文敬
    • 学会等名
      セルロース学会第18回年次大会
    • 発表場所
      信州大学工学部
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] セルロース誘導体の光学分割機構に対する計算化学的解析2011

    • 著者名/発表者名
      西村俊秀・上田一義・柴田徹・大西敦・奥山直人
    • 学会等名
      セルロース学会第18回年次大会
    • 発表場所
      信州大学工学部
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structure and Orientation of Bovine Lactoferrampin in Membranes : Molecular Dynamics Simulation2011

    • 著者名/発表者名
      Namsrai JAVKHLANTUGS・内藤晶・上田一義
    • 学会等名
      日本化学会第5回関東支部大会
    • 発表場所
      東京農工大学小金井キャンパス
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] セルローストリアセテートの溶解性向上を目指した計算化学的アプローチ2011

    • 著者名/発表者名
      早川大地・上田一義・山根千弘・宮本ひとみ・堀井文敬
    • 学会等名
      平成23年度神奈川県ものづくり技術交流会
    • 発表場所
      神奈川県産業技術センター
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] セルロース誘導体を用いた光学分割機構の計算化学による解析2011

    • 著者名/発表者名
      西村俊秀・上田一義・柴田徹・大西敦・奥山直人
    • 学会等名
      平成23年度神奈川県ものづくり技術交流会
    • 発表場所
      神奈川県産業技術センター
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 無加湿中温形燃料電池用電解質に適したプロトン伝導性イオン液体の分子設計2011

    • 著者名/発表者名
      森一樹・小林孝徳・上田一義、榊原和久
    • 学会等名
      平成23年度神奈川県ものづくり技術交流会
    • 発表場所
      神奈川県産業技術センター
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Molecular dynamics simulation of the dissolution process of cellulose triacetate nano-size crystal2011

    • 著者名/発表者名
      Daichi HAYAKAWA, Kazuyoshi UEDA, Chihiro YAMANE, Hitomi MIYAMOTO, Fumitaka HORII
    • 学会等名
      Fall 2011 ACS National Meeting
    • 発表場所
      Denver, Colorado, USA
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] The simulation of FC-domain binding on the polystyrene surface2011

    • 著者名/発表者名
      Namsrai JAVKHLANTUGS, Bayarsaikhan Urangoo, Bayar Hexig, Kazuyoshi UEDA
    • 学会等名
      ISSS-6 International Symposium on Surface Science
    • 発表場所
      Funabori, Tokyo Japan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Orientation and interaction of bovine Lactoferrampin in bacterial mimic membrane as performed by molecular dynamics simulation2010

    • 著者名/発表者名
      Namsrai Javkhlantugs, AkiraNaito, Kazuyoshi Ueda
    • 学会等名
      5^<th> International Peptide Symposium
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Structure and orientation of bovine Lactoferrampin in bacterial mimic membrane as investigated by molecular dynamics simulation2010

    • 著者名/発表者名
      Namsrai Javkhlantugs, AkiraNaito, Kazuyoshi Ueda
    • 学会等名
      Mongolian-German Workshop on Advanced Materials
    • 発表場所
      Ulaanbaatar, Mongol
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Molecular dynamics simulation of Bombolitin II in the DPPC bilayer2010

    • 著者名/発表者名
      Namsrai Javkhlantugs, AkiraNaito, Kazuyoshi Ueda
    • 学会等名
      2010MRS Spring Meeting
    • 発表場所
      San Francisco, CA
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Cellulose triacetateII型ナノサイズ結晶の溶解過程に関する分子動力学シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      早川大地・上田一義、山根千弘・宮本ひとみ 堀井文敬
    • 学会等名
      セルロース学会第17回年次大会
    • 発表場所
      徳島文理大学香川キャンパス
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] セルロース誘導体オリゴマーモデルを用いた計算機化学による光学分割機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      西村俊秀、上田一義、柴田徹、大西敦、奥山直人
    • 学会等名
      セルロース学会第17回年次大会
    • 発表場所
      徳島文理大学香川キャンパス
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] セルローストリアセテートーII型ナノサイズ結晶の溶解過程に関する分子動力学シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      早川大地・上田一義、山根千弘・宮本ひとみ 堀井文敬
    • 学会等名
      第59回高分子学会年次大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] セルロース誘導体オリゴマーモデルを用いた計算機化学による光学異性体分離機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      西村俊秀、上田一義、柴田徹、大西敦、奥山直人
    • 学会等名
      第59回高分子学会年次大会
    • 発表場所
      パシブイコ横浜
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi