バクテリアの生育に必須な「外来遺伝子群抑制システム」の解析

• 研究課題/領域番号: 22510204
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 首都大学東京
• 研究代表者: 加藤 潤一 首都大学東京, 大学院・理工学研究科, 教授 (10194820)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2012年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2011年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2010年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: ゲノム機能発現 / rRNA / プロセッシング / 大腸菌 / 必須遺伝子 / ゲノム / 染色体 / 外来遺伝子 / プロファージ

研究概要

大腸菌の転写終結に必須なRhoは外来遺伝子の発現を抑える働きをしていることが近年明らかにされた。転写終結に関与することを見出した機能未知必須遺伝子yqgFおよび機能未知必須遺伝子群yeaZ, ygjD, yjeEを解析した結果、yqgFは16S rRNAのプロセッシングに関与すること、またyeaZ, ygjD, yjeEが転写終結およびゲノムの安定性に関与することが明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] Mutations in the essential Escherichia coli gene, yqgF, and their effects on transcription. (2012)
  • 著者名/発表者名: Iwamoto, A., Osawa, A., Kawai, M., Honda, H., Yoshida, S., Furuya, N., and Kato, J.
  • 雑誌名: J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 巻: 22 ページ: 17-23
• [雑誌論文] Mutations in the essential Escherichia coli gene, yqgF, and their effects on transcription (2012)
  • 著者名/発表者名: Iwamoto, A.
  • 雑誌名: J.Mol.Microbiol.Biotechnol. 巻: 22 号: 1 ページ: 17-23
  • DOI: 10.1159/000336517
  • 査読あり
• [雑誌論文] Suppression of the temperature-sensitive mutation of the bamD gene required for the assembly of outer membrane proteins by multicopy of the yiaD gene in Escherichia coli. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tachikawa, T., and Kato, J.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 巻: 75 ページ: 162-164
• [雑誌論文] Oxidative stress sensitivity of engineered Escherichia coli cells with a reduced genome. (2011)
  • 著者名/発表者名: Iwadate, Y., Honda, H., Sato, H., Hashimoto, M. and Kato, J.
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Letter. 巻: 322 ページ: 25-33
• [雑誌論文] Effects on transcription of mutations in ygjD, yeaZ, and yjeE genes involved in a universal tRNA modification in Escherichia coli. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hashimoto, C., Sakaguchi, K., Taniguchi, Y., Honda, H., Oshima, T., Ogasawara, N., and Kato, J.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 巻: 193 ページ: 6075-6079
• [雑誌論文] Oxidative stress sensitivity of engineered Escherichia coli cells with a reduced genome (2011)
  • 著者名/発表者名: Iwadate, Y., et al
  • 雑誌名: FEMS Microbiology Letter 巻: 322 号: 1 ページ: 25-33
  • DOI: 10.1111/j.1574-6968.2011.02331.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects on transcription of mutations in ygjD, yeaZ, and yjeE genes involved in a universal tRNA modification in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: Hashimoto, C., et al
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 巻: 193 号: 21 ページ: 6075-6079
  • DOI: 10.1128/jb.05733-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Suppression of the temperature-sensitive mutation of the bamD gene required for the assembly of outer membrane proteins by multicopy of the yiaD gene in Escherichia coli. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tachikawa, T., Kato, J.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnol.Biochem. 巻: 75 ページ: 162-164
  • 査読あり
• [学会発表] 大腸菌の生育に必須な機能未知遺伝子yqgFの解析. (2013)
  • 著者名/発表者名: 中西忍、橋本昌征、古屋伸久、加藤潤一
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 大腸菌の生育に必須な機能未知遺伝子yqgFの解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中西忍
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株の解析とその利用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 高木光
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 大腸菌の定常期の生育に関わるユニバーサルストレスプロテインの機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 紅色硫黄光合成細菌Allochromatium vinosum の光合成関連遺伝子群の発現調節因子の同定と解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 藤原弘平
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 紅色光合成細菌Rubrivivax gelatinosusにおけるバクテリオクロロフィル合成を大腸菌で再構成する試み (2013)
  • 著者名/発表者名: 川口達也
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 紅色硫黄光合成細菌Allochromatium vinosumの光合成関連遺伝子制御因子の同定と解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 藤原弘平, 他4名
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-03-11
• [学会発表] 紅色光合成細菌におけるバクテリオクロロフィル合成を大腸菌で再構成する試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 川口達也, 他3名
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-03-11
• [学会発表] 大腸菌の生育に必須なtRNA修飾酵素遺伝子ygjDの遺伝学的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 橋本知佳、加藤潤一
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-03-11
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた定常期の生存に関与する遺伝子の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、加藤潤一
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-03-11
• [学会発表] 大腸菌の生育に必須なtRNA修飾酵素遺伝子ygjDの遺伝学的解析. (2012)
  • 著者名/発表者名: 橋本知佳、加藤潤一
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた定常期の生存に関与する遺伝子の探索. (2012)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、加藤潤一
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 大腸菌の生育に必須な機能未知遺伝子yqgFの解析. (2012)
  • 著者名/発表者名: 中西忍、橋本昌征、古屋伸久、加藤潤一
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた合成致死遺伝子群の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高木光、北村麻衣子、加藤潤一
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株の作製と利用. (2012)
  • 著者名/発表者名: 久保田希、橋本昌征、岩岡千晶、橋本知佳、加藤潤一
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株の解析とその利用. (2012)
  • 著者名/発表者名: 高木光、久保田希、加藤潤一
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 大腸菌の定常期の生育に関わるユニバーサルストレスプロテインの機能解析. (2012)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、加藤潤一
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜
• [学会発表] 大腸菌の生育に必須な機能未知遺伝子yqgFの解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中西忍
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株の作製と利用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 久保田希
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 紅色硫黄光合成細菌Allochromatium vinosumの光合成関連遺伝子群の発現調節因子の同定と解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 藤原弘平
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 紅色光合成細菌Rubrivivax gelatinosusにおけるバクテリオクロロフィル合成を大腸菌で再構成する試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 川口達也
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 大腸菌における光合成機能の再構成の試み (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤原弘平, 他6名
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] 大腸菌の機能未知必須遺伝子群の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 橋本知佳, 他3名
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] 大腸菌を用いた光合成機能の再構成 (2011)
  • 著者名/発表者名: 藤原弘平, 他7名
  • 学会等名: ゲノム微生物学会ワークショップ「ゲノムで繋がる微生物研究の新展開」
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2011-08-20
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた酸化ストレス耐性に関与する遺伝子の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、加藤潤一
  • 学会等名: ゲノム微生物学会ワークショップ「ゲノムで繋がる微生物研究の新展開」
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2011-08-20
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた酸化ストレス耐性に関与する遺伝子の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、加藤潤一
  • 学会等名: 第5回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2011-03-15
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた酸化ストレス耐性に関与する遺伝子の解析. (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、加藤潤一
  • 学会等名: 第5回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた酸化ストレス耐性に関与する遺伝子の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、高木光、岩岡千晶、久保田希、加藤潤一
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 大腸菌の機能未知必須遺伝子群の解析. (2011)
  • 著者名/発表者名: 橋本知佳、成田裕行、本多弘典、加藤潤一
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた酸化ストレス耐性に関与する遺伝子の解析. (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩舘佑未、加藤潤一
  • 学会等名: ゲノム微生物学会ワークショップ「ゲノムで繋がる微生物研究の新展開」
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] 大腸菌の機能未知必須遺伝子群の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤潤一, 他9名
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会 合同学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 大腸菌の機能未知必須遺伝子群の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤潤一、岩本明、橋本知佳、大澤睦、河井真紀子、本多弘典、吉田早織、成田裕行、古屋伸久、酒井彩
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会
  • 発表場所: 合同学会(神戸)
• [備考]
  • URL: http://www.biol.se.tmu.ac.jp/labo.asp?ID=molgen
• [備考]
  • URL: http://www.shigen.nig.ac.jp/ecoli/pec/index.jsp
• [備考]
  • URL: http://www.biol.se.tmu.ac.jp/labo.asp?ID=molgen