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なぜマイクロサテライトは変化するのか?

研究課題

研究課題/領域番号 22570010
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 遺伝・ゲノム動態
研究機関独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター)

研究代表者

織田 信弥  独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他の部局等 (40333372)

連携研究者 倉岡 功  大阪大学, 大学院・基礎工学研究科, 准教授 (60335396)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2010年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードゲノム構築・再編・維持 / ゲノム不安定性 / 癌 / DNA 修復 / ゲノム / DNA修復
研究概要

本研究では、真核生物ゲノムで保存されてきたマイクロサテライト配列が、正常個体集団間で多様性を生む分子機序、さらには病的細胞機能下、とくに腫瘍において変化する分子機序を総合的に解明し、真核生物ゲノム編成のひとつの特徴であるショートタンデムリピートの動態とその病因論的意義を明らかにすることを目的とした。まず、正常細胞機能下におけるマイクロサテライト配列変化として、種間、個体間のマイクロサテライト配列多様性について、また、病的細胞機能下におけるマイクロサテライト配列変化としては、とくに、ミスマッチ修復異常およびDNAポリメラーゼ校正機能の異常下におけるマイクロサテライト変化について、重点的に解析を行った。このような解析の結果、とくに注目されたのが、1塩基繰り返し(mononucleotide)マイクロサテライト配列の動態であった。Mononucleotideマイクロサテライトがヒト集団間で著しく多型に乏しいことが見出されたのである。このことは、極めて多型に富む2塩基繰り返し(dinucleotide)マイクロサテライトと好対照をなしている。この結果を受け、ミスマッチ修復能およびポリメラーゼ校正機能に既知の異常をもつ株化培養細胞を用いて解析を進めた結果、2つの細胞機能の働きのちがいによる、それぞれのマイクロサテライトの固有の動態が明らかになった。現在、ミスマッチ修復能およびポリメラーゼ校正機能を欠くマウス胎児線維芽細胞を樹立し、その解析をおこなっている。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (9件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Efficient long DNA gap-filling in a mammalian cell-free system: A potential new in vitro DNA replication assay2013

    • 著者名/発表者名
      Nakao S, Zhang S, Vaara M, Syvaoja JE, Lee MY, Tsurimoto T, Karran P, Oda S
    • 雑誌名

      Biochimie

      巻: 95 号: 2 ページ: 320-328

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2012.09.031

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Concurrent genetic alterations in DNA polymerase proofreading and mismatch repair in human colorectal cancer.2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshida R, Miyashita K, Inoue M, Shimamoto A, Zhao Y, Egashira A, Oki E, Kakeji Y, Oda S, Maehara Y
    • 雑誌名

      Eur J Hum Genet

      巻: 19 号: 3 ページ: 320-325

    • DOI

      10.1038/ejhg.2010.216

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Concurrent genetic alterations in DNA polymerase proofreading and mis match repair in human colorectal cancer.2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshida R, et al.
    • 雑誌名

      Eur J Hum Genet

      巻: 19 ページ: 320-325

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞粗抽出液中で長い単鎖領域に誘導されるDNA 合成反応の性質とin vitro DNA 複製系としての可能性2012

    • 著者名/発表者名
      中尾精希、織田信弥
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-12-14
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 細胞粗抽出液中で長い単鎖領域に誘導されるDNA合成反応の性質とin vitro DNA複製系としての可能性2012

    • 著者名/発表者名
      中尾精希
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 2 本鎖環状DNA 基質と哺乳動物細胞粗抽出液をもちいたDNA 複製効率の定量化2011

    • 著者名/発表者名
      中尾精希、織田信弥
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 2本鎖環状DNA基質と哺乳動物細胞粗抽出液を用いたDNA複製効率の定量化2011

    • 著者名/発表者名
      中尾精希、織田信弥
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ヒトがんにみられるDNA ポリメラーゼ校正機変異2011

    • 著者名/発表者名
      織田信弥
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第56回大会
    • 発表場所
      千葉
    • 年月日
      2011-11-11
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ヒトがんにみられるDNAポリメラーゼ校正機能変異2011

    • 著者名/発表者名
      織田信弥
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第56回大
    • 発表場所
      千葉市
    • 年月日
      2011-11-11
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ヒト大腸癌におけるDNA ポリメラーゼ校正機能およびミスマッチ修復の遺伝学的並存変化2011

    • 著者名/発表者名
      吉田倫太郎、宮下要、井上真由子、島本章義、趙岩、掛地吉弘、織田信弥、前原喜彦
    • 学会等名
      第70回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-05
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ヒト大腸癌におけるDNAポリメラーゼ校正機能およびミスマッチ修復の遺伝学的並存変化2011

    • 著者名/発表者名
      吉田倫太郎, ら
    • 学会等名
      第70回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2011-10-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 定量的遺伝子発現調節と形質変化・薬剤感受性バイオマーカーを例に2010

    • 著者名/発表者名
      織田信弥、若狭健太郎
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.ia-nkcc.jp/rinsho/

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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