細胞内3ゲノムの遺伝子発現同時リアルタイム測定系の開発

• 研究課題/領域番号: 22657001
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 石浦 正寛 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (20132730)
• 連携研究者: 松尾 拓哉 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教 (00452201)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,420千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 420千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2010年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
• キーワード: ゲノム機能 / 発現 / レポーター遺伝子 / 生物発光 / ルシフェラーゼ / クラミドモナス / オルガネラ

研究概要

本研究では、単細胞性緑藻クラミドモナスを用いて核と葉緑体の遺伝子発現を同時に、且つリアルタイムに測定するための基盤技術の開発に成功した。この成果は、光合成やバイオエネルギーの研究への応用が期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Phase-dependent generation and transmission of time information by the KaiABC circadian clock oscillator through SasA-KaiC interaction in cyanobacteria (2012)
  • 著者名/発表者名: J Valencia S, Bitou K, Ishii K, Murakami R, Morishita M, Onai K, Furukawa Y, Imada K, Namba K, Ishiura M.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 17 ページ: 398-419
  • 査読あり
• [雑誌論文] N-terminal acetyltransferase 3 gene is essential for robustcircadian rhythm of bioluminescence reporter in Chlamydomonas reinhardtii (2012)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Iida T, Ishiura M
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 418 ページ: 342-346
  • 査読あり
• [雑誌論文] N-terminal acetyltransferase 3 gene is essential for robust circadian rhythm of bioluminescence reporter in Chlamydomonas reinhardtii (2012)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Iida T, Ishiura M
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 418 号: 2 ページ: 342-346
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.01.023
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nonselective excitation of pulsed ELDOR using multi-frequency microwaves (2011)
  • 著者名/発表者名: Asada Y, Mutoh R, Ishiura M, Mino H
  • 雑誌名: J Magnetic Resonance 巻: 213 ページ: 200-205
  • 査読あり
• [雑誌論文] Thermodynamically induced conformational changes of the cyanobacterial circadian clock protein KaiB (2011)
  • 著者名/発表者名: Mutoh R., Mino H., Murakami R., Uzumaki T., Ishiura M.
  • 雑誌名: Applied Magnetic Resonance 巻: 40 ページ: 525-534
  • 査読あり
• [雑誌論文] Plasma membrane aquaporin AqpZ protein is essential for glucose metabolism during photomixotrophicgrowth of Synechocystis sp. PCC 6803 (2011)
  • 著者名/発表者名: Akai M, Onai K, Kusano M, Sato M, Redestig H, Toyooka K, Morishita M, Miyake H, Hazama A, Checchetto V, Szabo I, Matsuoka K, Saito K, Yasui M, Ishiura M, Uozumi N
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 286 ページ: 25224-25235
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chlamydomonas reinhardtii as a new model system for studying the molecular basis of the circadian clock (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Ishiura M.
  • 雑誌名: FEBS lett 巻: 585 ページ: 1495-1502
  • 査読あり
• [雑誌論文] 生物発光リアルタイム測定解析システム=有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システム= (2011)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 雑誌名: 光アライアンス「特集:生物フォトン研究の最前線」(3月号) 巻: 22 ページ: 20-26
• [雑誌論文] Plasma membrane aquaporin AqpZ protein is essential for glucose metabolism during photomixotrophic growth of Synechocystis sp.PCC 6803 (2011)
  • 著者名/発表者名: Akai M, Onai K, Kusano M, Sato M, Redestig H, Toyooka K, Morishita M, Miyake H, Hazama A, Checchetto V, Szabo I, Matsuoka K, Saito K, Yasui M, Ishiura M, Uozumi N
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 286 ページ: 25224-25235
  • 査読あり
• [雑誌論文] Thermodynamically induced conformational changes of the cyanoba cterial circadian clock protein KaiB (2011)
  • 著者名/発表者名: Mutoh R., Mino H., Murakami R., Uzumaki T., Ishiura M
  • 雑誌名: Applied Magnetic Resonance 巻: 40 ページ: 525-534
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phase-dependent generation and transmission of time information by the KaiABC circadian clock oscillator through SasA-KaiC interaction in cyanobacteria (2011)
  • 著者名/発表者名: J Valencia S, Bitou K, Ishii K, Murakami R, Morishita M, Onai K, Furukawa Y, Imada K, Namba K, Ishiura M
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] 生物発光リアルタイム測定解析システム=有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システム= (2011)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 雑誌名: 光アライアンス「特集:生物フォトン研究の最前線」 巻: 3月号 ページ: 20-26
• [雑誌論文] 生物発光リアルタイム測定システムの歴史と展望～生物発光からゲノム学・生物物理学への潮流～ (2010)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 50 ページ: 141-145
  • NAID: 10026476989
  • 査読あり
• [雑誌論文] New insights into the circadian clock in Chlamydomonas (2010)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T., Ishiura M.
  • 雑誌名: Int. Rev. Cell Mol. Biol 巻: 280 ページ: 281-314
  • 査読あり
• [雑誌論文] New insights into the circadian clock in Chlamydomonas (2010)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Ishiura M
  • 雑誌名: Int.Rev.Cell Mol.Biol. 巻: 280 ページ: 281-314
• [雑誌論文] Chlamydomonas reinhardtii as a new model system for studying the molecular basis of the circadian clock
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Ishiura M
  • 雑誌名: FEBS lett. 巻: 印刷中
  • 査読あり
• [学会発表] 緑藻の生物時計:起源、分子機構、時計研究モデルとしての可能性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾拓哉、石浦正寛
  • 学会等名: 第18回日本時間生物学会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流会館、名古屋
  • 年月日: 2011-11-25
• [学会発表] 緑藻の生物時計:起源、分子機構、時計研究モデルとしての可能性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾拓哉、石浦正寛
  • 学会等名: 第18回日本時間生物学会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流会館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-25
• [学会発表] クラミドモナスの時計タンパク質ROC55は約670kDaの複合体の一部である (2011)
  • 著者名/発表者名: 石黒彩由奈、石浦正寛
  • 学会等名: 第9回クラミドモナスワークショップ
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター
  • 年月日: 2011-11-25
• [学会発表] クラミドモナスの時計タンパク質ROC15は光依存的に減少する (2011)
  • 著者名/発表者名: 丹羽由実、石浦正寛
  • 学会等名: 第9回クラミドモナスワークショップ
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター
  • 年月日: 2011-11-25
• [学会発表] 時計遺伝子ROC75によるROC40の発現制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 飯田高広、石浦正寛
  • 学会等名: 第9回クラミドモナスワークショップ
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター
  • 年月日: 2011-11-25
• [学会発表] スピンラベル法による藍色細菌時計タンパク質間相互作用部位の同定と構造、変化の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 武藤梨沙、石浦正寛
  • 学会等名: 第50回電子スピンサイエンス学会年会
  • 発表場所: 仙台国際センター
  • 年月日: 2011-11-18
• [学会発表] 生物時計研究の新しいモデル生物:緑藻クラミドモナス、京都大学大学院薬学研究科、医薬創成情報科学講座 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾拓哉、石浦正寛
  • 学会等名: システムバイオロジーセミナー
  • 発表場所: 京都大学薬学部、京都
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] 生物時計研究の新しいモデル生物:緑藻クラミドモナス (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾拓哉、石浦正寛
  • 学会等名: 京都大学大学院薬学研究科、医薬創成情報科学講座、システムバイオロジーセミナー
  • 発表場所: 京都大学薬学部、京都(招待講演)
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] 藍色細菌と植物の生物時計の分子遺伝学的研究:時計分子装置のリアルタイム測定、構造、機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石浦正寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第83回大会
  • 発表場所: 京都大学、京都
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] 藍色細菌と植物の生物時計の分子遺伝学的研究:時計分子装置のリアルタイム測定、構造、機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石浦正寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第83回大会、日本遺伝学会木原賞受賞講演
  • 発表場所: 京都大学、京都(招待講演)
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] Structual change and direct interaction between KaiA and KaiB revealed by SDSL-ESR analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: 武藤梨沙、石浦正寛
  • 学会等名: 日本生物物理学会第49回年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学
  • 年月日: 2011-09-16
• [学会発表] Structual change of circadian clock protein KaiB (2011)
  • 著者名/発表者名: Mutoh R, Ishiura M
  • 学会等名: 53rd Rocky Mountain Conference Center
  • 発表場所: Snowmass, Colorado USA
  • 年月日: 2011-07-24
• [学会発表] Protein interactions in the vitro cyanobacterial Kai clock system revealed by ESR analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Mutoh R, Ishiura M
  • 学会等名: Regular Seminar of Prof.Lambeth's Lab
  • 発表場所: Atlanta, GA USA
  • 年月日: 2011-07-20
• [学会発表] 藍色細菌Kai生物時計分子装置の時間発振中の構造変化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 村上怜子、石浦正寛
  • 学会等名: 超異分野交流会
  • 発表場所: 東京、上智大学
  • 年月日: 2011-03-19
• [学会発表] Identification and analysis of circadian clock genes in Chlamydomonas reinhardtii (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Ishiura M
  • 学会等名: Chlamydomonas and Phaeodactylum Workshop "Specific Light Driven Reactions in Unicellular Model Algae"
  • 発表場所: Jena, Germany
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システムによる高等植物の油脂合成制御因子の網羅的探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河合都妙、小内清、石浦正寛、中村研三
  • 学会等名: 科学技術交流財団「ハイスループットスクリーニングシステムと次世代DNAシーケンサーの相乗的応用」第1回研究会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館、名古屋
  • 年月日: 2010-07-23
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システム-有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システムの開発- (2010)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 科学技術交流財団「ハイスループットスクリーニングシステムと次世代DNAシーケンサーの相乗的応用」第1回研究会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館、名古屋
  • 年月日: 2010-07-23
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定法の開発と生物時計研究への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浦正寛
  • 学会等名: 岩手生物工学研究センター第165回公開セミナー
  • 発表場所: (財)岩手生物工学研究センター、北上市
  • 年月日: 2010-05-28
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定法の開発と生物時計研究への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浦正寛
  • 学会等名: 岩手生物工学研究センター第165回公開セミナー
  • 発表場所: 岩手生物工学研究センター、北上市
  • 年月日: 2010-05-28
• [学会発表] Analysis of the circadian clock genes ROCs in Chlamydomonas reinhardtii (2010)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Iida T, Kunii Y, Kato D, Tachikawa M, Ishiura M
  • 学会等名: The 14th international Chlamydomonas conference
  • 発表場所: Wheaton College, Norton, Massachusetts, USA
• [学会発表] Masahiro Ishiura:Protein interactions in the in vitro cyanobacterial Kai clock system revealed by ESR analysis (2010)
  • 著者名/発表者名: Risa Mutoh, Hiroyuki Mino, Reiko Murakami, Yuki Asada, Tatsuya Uzumaki, Kentaro Ishii, Masahiro Ishiura
  • 学会等名: Asia-Pacific EPR/ESR Symposium
  • 発表場所: International Convention Center, Jeju, Republic of Korea, Poster
• [学会発表] Protein interactions in the in vitro cyanobacterial Kai clock system revealed by ESR analysis (2010)
  • 著者名/発表者名: Risa Mutoh, Hiroyuki Mino, Reiko Murakami, Yuki Asada, Tatsuya Uzumaki, Kentaro Ishii, Masahiro Ishiura
  • 学会等名: Asia-Pacific EPR/ESR Symposium
  • 発表場所: International Convention Center, Jeju, Republic of Korea
• [備考]
  • URL: http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~ishiura-g/
• [備考]
  • URL: http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~ishiura-g/
• [備考]
  • URL: http://www.gene.nagoya-u.ac.jp/~ishiura-g/
• [産業財産権] 分配装置、及び分配方法 (2010)
  • 発明者名: 小内清、石浦正寛、白木央、大久保充宏、神谷聡、八木良樹、岡悦男、戎晃司
  • 権利者名: 中立電機株式会社、椿本興業、マイクロニクス株式会社
  • 産業財産権番号: 2010-095985
  • 出願年月日: 2010-04-19