タンパク質間相互作用によるエピジェネティクス制御機構の構造生物学的基盤

• 研究課題/領域番号: 22687008
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 有田 恭平 京都大学, 工学研究科, 助教 (40549648)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 16,250千円 (直接経費: 12,500千円、間接経費: 3,750千円); 2011年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円); 2010年度: 8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
• キーワード: 構造生物学 / X線結晶構造解析 / エピジェネティクス / タンパク質相互作用 / タンパク質間相互作用 / UHRF1

研究概要

本研究ではエピジェネティクスに関与する重要な因子であるUHRF1/2タンパク質に注目し、UHRF1と相互作用するタンパク質との構造生物学的からエピジェネティクスの制御機構の解明を目指した。本申請の成果により、UHRF1と相互作用するタンパク質の同定、およびUHRF2によるDNAの認識機構の詳細を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Crystal structure of the ubiquitin-associated(UBA) domain of p62 and its interaction with ubiquitin (2011)
  • 著者名/発表者名: Isogai S, Morimoto D, Arita K, Unzai S, Tenno T, Hasegawa J, Sou YS, Komatsu M, Tanaka K, Shirakawa M, Tochio H
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry 巻: 286 ページ: 31864-3187
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the UBA domain of p62 and its interaction with ubiquitin (2011)
  • 著者名/発表者名: Isogai, S., Morimoto, D., Arita, K., Unzai, S., Tenno, T., Hasegawa, J., Sou, Y.S., Komatsu, M., Tanaka, K., Shirakawa, M., Tochio, H.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 巻: 286 号: 36 ページ: 31864-318674
  • DOI: 10.1074/jbc.m111.259630
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for recognition of poly-SUMO chain by a SUMO-like domain of Nip45 (2010)
  • 著者名/発表者名: Sekiyama N, Arita K, Ikeda Y, Hashiguchi K, Ariyoshi M, Tochio H, Saitoh H, Shirakawa M
  • 雑誌名: Proteins 巻: 78 ページ: 1491-1502
  • 査読あり
• [学会発表] Structural basis for maintenance of DNA methylation and recognition of histone modifications by UHRF1 (2011)
  • 著者名/発表者名: 有田恭平(白川昌宏代理)
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Structural basis for recognition of epigenetic marks by UHRF1 (2011)
  • 著者名/発表者名: Kyohei Arita, Kazya Sugita、Motoko Unoki、Ryuji Hamamoto、Shin Isogai、Mariko Ariyoshi、Hidehito Tochio、Masahiro Shirakawa.
  • 学会等名: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • 年月日: 2011-06-07
• [学会発表] Structural basis for recognition of epigenetic marks by UHRF1 (2011)
  • 著者名/発表者名: Kyohei Arita, Kazya Sugita、Motoko Unoki、Ryuji Hamamoto、Shin Isogai、Mariko Ariyoshi、Hidehito Tochio、Masahiro Shirakawa
  • 学会等名: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク
  • 年月日: 2011-06-07
• [学会発表] Structural basis for recognition of histone modifications by UHRF1 (2011)
  • 著者名/発表者名: Kyohei Arita.
  • 学会等名: 構造エピゲノム研究会第3回ワークショップ
  • 年月日: 2011-04-25
• [学会発表] Structural basis for recognition of histone modifications by UHRF1 (2011)
  • 著者名/発表者名: 有田恭平
  • 学会等名: 構造エピゲノム研究会第3回ワークショップ
  • 発表場所: 理研横浜研究所交流棟ホール
  • 年月日: 2011-04-25
• [学会発表] Structural basis for recognition of epigenetic modifications by UHRF1 (2011)
  • 著者名/発表者名: Kyohei Arita.
  • 学会等名: 新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第1回国際シンポジウム
  • 年月日: 2011-01-27
• [学会発表] Structural basis for recognition of epigenetic modifications by UHRF1 (2011)
  • 著者名/発表者名: Kyohei Arita
  • 学会等名: 新学術領域「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第1回国際シンポジウム
  • 発表場所: はまぎんホール・ヴィアマーレ
  • 年月日: 2011-01-27
• [学会発表] UHRF1によるエピジェネティックマークの読み取り機構の構造生物学的基盤 (2010)
  • 著者名/発表者名: 有田恭平, 杉田和也, 鵜木元香, 浜本隆二, 有吉真理子, 杤尾豪人, 白川昌宏
  • 学会等名: BMB2010
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] UHRF1によるエピジェネティックマークの読み取り機構の構造生物学的基盤 (2010)
  • 著者名/発表者名: 有田恭平, 杉田和也, 鵜木元香, 浜本隆二, 有吉真理子, 朽尾豪人, 白川昌宏
  • 学会等名: BMB2010
  • 発表場所: 神戸国際展示場
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] UHRF1タンパク質によるヘミメチル化DNAとヒストン修飾の認識機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 有田恭平, 杉田和也, 有吉真理子, 鵜木元香, 杤尾豪人, 中村祐輔, 白川昌宏
  • 学会等名: 第4回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 年月日: 2010-05-29
• [学会発表] UHRF1タンパク質によるヘミメチル化DNAとヒストン修飾の認識機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 有田恭平, 杉田和也, 有吉真理子, 鵜木元香, 朽尾豪人, 中村祐輪, 白川昌宏
  • 学会等名: 第4回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 米子市文化ホール
  • 年月日: 2010-05-29
• [図書] Non coding RNA in plants (2011)
  • 著者名/発表者名: Arita K., Kanno T., Yoshikawa M., and Habu Y.
  • 出版者: Springer
• [図書] Cytosine Methylation to Histone Modification in Arabidopsis thaliana (2011)
  • 著者名/発表者名: Arita K., Kanno T., Yoshikawa M., Habu Y
  • 総ページ数: 13
  • 出版者: Non coding RNA in plants (Springer出版)
• [備考]
  • URL: http://www.moleng.kyoto-u.ac.jp/~moleng_01/