海洋環境中におけるＤＮＡ／ＲＮＡ両ウイルスの宿主争奪戦に関する研究

• 研究課題/領域番号: 22688016
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 水産学一般
• 研究機関: 独立行政法人水産総合研究センター
• 研究代表者: 外丸 裕司 独立行政法人水産総合研究センター, 瀬戸内海区水産研究所, 主任研究員 (10416042)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 26,130千円 (直接経費: 20,100千円、間接経費: 6,030千円); 2013年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円); 2012年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円); 2011年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円); 2010年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
• キーワード: 珪藻 / ウイルス / 生態 / Chaetoceros / DNA / RNA / DNAウイルス / RNAウイルス / 現場動態 / 抗体 / ウイルス種判別 / 微細藻類

研究概要

近年、海洋における藻類ウイルス研究が注目されている。本研究は、タイプが異なるウイルスの共通宿主に対する感染・優占化戦略を、珪藻とそれに感染する2種のウイルスを材料として解明することを目的とした。現場調査ならびに室内実験の結果、2種のウイルスは水温に対して異なる増殖特性を持つことが明らかとなった。このことから異種のウイルス同士は宿主を争奪するのではなく、異なる環境条件下で宿主をシェアしているものと推察された。

研究成果

• [雑誌論文] Utilization of phosphate diesters by phosphodiesterase-producing marine diatoms (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi H, Arisaka H, Otsuka N, Tomaru Y
  • 雑誌名: J Plankton Res 巻: 36 ページ: 281-285
  • 査読あり
• [雑誌論文] Utilization of phosphate diesters by phosphodiesterase-producing marine diatoms. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi H, Arisaka H, Otsuka N, Tomaru Y.
  • 雑誌名: J Plankton Res 巻: 36 号: 1 ページ: 281-285
  • DOI: 10.1093/plankt/fbt091
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded RNA virus that infects the marine planktonic diatom Chaetoceros sp. (SS08-C03) (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Kimura K, Takao Y, Sakurada K, Nakayama N, Nagasaki K
  • 雑誌名: Phycol Res 巻: 61 ページ: 27-36
  • NAID: 40019561481
  • 査読あり
• [雑誌論文] A unique method for culturing diatoms on agar plates (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura K, Tomaru Y
  • 雑誌名: Plankton and Benthos Research 巻: 8 ページ: 46-48
  • NAID: 10031138466
  • 査読あり
• [雑誌論文] Co-occurrence of Heterocapsa circularisquama bloom and its lytic viruses in Lake Kamo, Japan, 2010 (2013)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A, Kondo S, Nakao R, Tomaru Y, Nagasaki K
  • 雑誌名: JARQ 巻: 47 ページ: 329-338
  • NAID: 130003377785
  • 査読あり
• [雑誌論文] New single-stranded DNA virus with a unique genomic structure that infects marine diatom Chaetoceros setoensis (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Suzuki H, Nagumo T, Kimura K & Takao Y
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 3 ページ: 3337-3337
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and Characterization of a Single-Stranded DNA Virus Infecting the Marine Diatom Chaetoceros sp. Strain SS628-11 Isolated from Western Japan (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura K, Tomaru Y
  • 雑誌名: Plos One 巻: 8
  • 査読あり
• [雑誌論文] New single-stranded DNA virus with a unique genomic structure that infects marine diatom Chaetoceros setoensis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomaru, Y., Toyoda, K., Suzuki, H., Nagumo, T., Kimura, K., Takao, Y.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: Vol.3 号: 1 ページ: 3337-3337
  • DOI: 10.1038/srep03337
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and Characterization of a Single-Stranded DNA Virus Infecting the Marine Diatom Chaetoceros sp. Strain SS628-11 Isolated from Western JAPAN (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura K, Tomaru Y
  • 雑誌名: Plos One 巻: 8 号: 12 ページ: e82013-e82013
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0082013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded RNA virus that infects the marine planktonic diatom Chaetoceros sp. (SS08-C03). (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y
  • 雑誌名: Phycol Res 巻: 61 号: 1 ページ: 27-36
  • DOI: 10.1111/j.1440-1835.2012.00670.x
  • NAID: 40019561481
  • 査読あり
• [雑誌論文] A unique method for culturing diatoms on agar plates (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura K
  • 雑誌名: Plankton Benthos Res 巻: 8(1) ページ: 46-48
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros sp (2012)
  • 著者名/発表者名: Toyoda, K., Kimura, K., Hata, N., Nakayama, N., Nagasaki, K., Tomaru, Y
  • 雑誌名: Plankton Benthos Res 巻: 7 ページ: 20-18
  • 査読あり
• [雑誌論文] First evidence for the existence of pennate diatom viruses (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru, Y., Toyoda, K., Kimura, K., Hata, N., Yoshida, M., Nagasaki K
  • 雑誌名: ISME Journal 巻: 6 号: 7 ページ: 1445-1448
  • DOI: 10.1038/ismej.2011.207
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros sp.(strain TG07-C28) (2012)
  • 著者名/発表者名: Toyoda, K., Kimura, K., Hata, N., Nakayama, N., Nagasaki, K., Tomaru, Y.
  • 雑誌名: Plankton Benthos Res. 巻: Vol.7 ページ: 20-28
  • NAID: 10030123384
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterisation of a single-stranded DNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros tenuissimus Meunier (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Shirai Y, Toyoda K, Nagasaki K
  • 雑誌名: Aqatic Microbila Ecology 巻: 64 ページ: 175-185
  • 査読あり
• [雑誌論文] PCR-RFLP analysis for species-level distinction of the genus Chaetoceros Ehrenberg (Bacillariophyceae) (2011)
  • 著者名/発表者名: Toyoda K, Nagasaki K, Williams DM, Tomaru Y
  • 雑誌名: Hiyoshi Rev Natur Sci 巻: 50 ページ: 21-30
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting Chaetoceros lorenzianus Grunow (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Takao Y, Suzuki H, Nagumo T, Koike K, Nakgasaki K
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology 巻: 77 ページ: 5285-5293
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamics of diatom viruses on the western coast of Japan (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Fujii N, Nagasaki K
  • 雑誌名: Aquatic Microbial Ecology 巻: 63 ページ: 223-230
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterisation of a single-stranded DNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros tenuissimus Meunier (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Shirai Y, Toyoda K, Nagasaki K
  • 雑誌名: AQUATIC MICROBIAL ECOLOGY 巻: 64巻 号: 2 ページ: 175-185
  • DOI: 10.3354/ame01517
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting Chaetoceros lorenzianus Grunow (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Takao Y, Suzuki H, Nagumo T, Koike K, Nakgasaki K
  • 雑誌名: APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 巻: 77巻 号: 15 ページ: 5285-5293
  • DOI: 10.1128/aem.00202-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of real-time PCR assay for detection and quantification of Chaetoceros tenuissimus Meunier (Bacillariophyta) (2010)
  • 著者名/発表者名: Toyoda K, Nagasaki K, Tomaru Y
  • 雑誌名: Plankton Benthos Res 巻: 5 ページ: 56-61
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of a marine diatom-infecting singlestranded RNA virus (2010)
  • 著者名/発表者名: Naitow, H., Shirai, Y., Tomaru, Y., Nagasaki, K
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F : Structural Biology and Crystallization Communications 巻: 66 ページ: 1449-1452
  • 査読あり
• [雑誌論文] 原生生物の寄生, 共生者(ウイルスを中心に) (2010)
  • 著者名/発表者名: 長崎慶三, 外丸裕司
  • 雑誌名: 日本プランクトン学会報 巻: 58 ページ: 73-76
  • NAID: 10027957460
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of real-time PCR assay for detection and quantification of Chaetoceros tenuissimus Meunier(Bacillariophyta). (2010)
  • 著者名/発表者名: 豊田健介, 長崎慶三, 外丸裕司
  • 雑誌名: Plankton Benthos Res. 巻: Vol.5 ページ: 56-61
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of a marine diatom-infecting singlestranded RNA virus. (2010)
  • 著者名/発表者名: Naitow, H., Shirai, Y., Tomaru, Y, Nagasaki, K.
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F : Structural Biology and Crystallization Communications 巻: VOL.66 ページ: 1449-1452
  • 査読あり
• [雑誌論文] 原生生物の寄生,共生者(ウイルスを中心に) (2010)
  • 著者名/発表者名: 長崎慶三, 外丸裕司
  • 雑誌名: 日本プランクトン学会報 巻: 58巻 ページ: 73-76
  • NAID: 10027957460
  • 査読あり
• [学会発表] 珪藻DNA/RNA ウイルスの増殖と水温の関係 (2013)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 木村圭
  • 学会等名: 第29回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学(鹿児島市)
  • 年月日: 2013-11-23
• [学会発表] 珪 藻Chaetoceros tenuissimus に感染するDNA/RNA ウイルスの増殖に与える水温の影響 (2013)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 木村圭
  • 学会等名: 2013年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
  • 発表場所: 東北大学農学部(仙台市)
  • 年月日: 2013-09-28
• [学会発表] 珪藻DNA/RNAウイルスの増殖と水温の関係 (2013)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司、木村圭
  • 学会等名: 第29回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学
  • 招待講演
• [学会発表] 珪藻Chaetoceros tenuissimusに感染するDNA/RNAウイルスの増殖に与える水温の影響 (2013)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司、木村圭
  • 学会等名: 2013年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
  • 発表場所: 東北大学農学部
  • 招待講演
• [学会発表] 珪藻ブルーム期間中のDNA/RNAウイルスの出現 (2013)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司
  • 学会等名: 2013年日本海洋学会春季大会
  • 発表場所: 東京海洋大学
• [学会発表] 海産珪藻 Chaetoceros tenuissimusのブルーム期間に おけるDNA/RNA ウイルスの出現パターン (2013)
  • 著者名/発表者名: 木村圭
  • 学会等名: 日本藻類学会第３７回大会
  • 発表場所: 山梨大学
• [学会発表] 珪藻ウイルス研究の最前線と今後の展望 (2012)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司
  • 学会等名: 2012年度日本プランクトン学会春季シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学柏キャンパス(千葉県柏市)
  • 年月日: 2012-03-30
  • 招待講演
• [学会発表] 珪藻ウイルス研究の最前線と今後の展望 (2012)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司
  • 学会等名: 2012年度日本プランクトン学会春季シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学柏キャンパス(千葉県柏市)(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-30
• [学会発表] 海産珪藻Chaetoceros tenuissimusの挙動に影響をおよぼすDNA/RNAウイルス (2012)
  • 著者名/発表者名: 木村圭, 外丸裕司
  • 学会等名: 平成24年度日本水産学会春季大会
  • 発表場所: 東京海洋大学(東京)
  • 年月日: 2012-03-27
• [学会発表] 海産珪藻に感染するウイルスの性状と宿主動態への影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 木村圭
  • 学会等名: 第59回日本生態学会大津大会
  • 発表場所: 龍谷大学瀬田キャンパス(滋賀県大津市)
  • 年月日: 2012-03-21
• [学会発表] 海産珪藻Chaetoceros tenuissimusの挙動に影響をおよぼすDNA/RNAウイルス (2012)
  • 著者名/発表者名: 木村圭, 外丸裕司
  • 学会等名: 第59回日本生態学会大津大会
  • 発表場所: 龍谷大学瀬田キャンパス(滋賀県大津市)
  • 年月日: 2012-03-21
• [学会発表] Viral impacts on population dynamics of a bloom-forming diatom Chaetoceros tenuissimus (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Kimura K
  • 学会等名: 15th International Conference on Harmful Algae
  • 発表場所: Changwon Cyeongam, Korea
• [学会発表] Pennate diatom viruses are similar to centric diatom viruses (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Kimura K and Takao Y
  • 学会等名: 22nd International diatom symposium
  • 発表場所: Gent, Belugium
• [学会発表] Bacterial communities help survivals of diatom populations from viral attacks (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Kimura K
  • 学会等名: 22nd International diatom symposium
  • 発表場所: Gent, Belugium
• [学会発表] Dynamics of Chaetoceros tenuissimus and its viruses in Hiroshima Bay, Japan (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Kimura K
  • 学会等名: 22nd International diatom symposium
  • 発表場所: Gent, Belugium
• [学会発表] Diatom viruses isolated from Japanese coastal waters (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuji Tomaru
  • 学会等名: 22nd International diatom symposium
  • 発表場所: Gent, Belugium
• [学会発表] 赤潮原因プランクトンの挙動におよぼすウイルスの影響と、宿主側のウイルス感染回避戦略 (2011)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司
  • 学会等名: 日本植物学会第75回大会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス(東京)(招待講演)
  • 年月日: 2011-09-18
• [学会発表] 珪藻Chaetoceros sp.SS08-C03株に感染する新奇RNAウイルスの性状 (2011)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 豊田健介, 高尾祥丈, 櫻田清成, 中山奈津子, 木村圭, 長崎慶三
  • 学会等名: 2011年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
  • 発表場所: 高知大学(高知市)
  • 年月日: 2011-09-18
• [学会発表] 急速凍結置換固定法を用いた現場プランクトンの「スナップショット」雷子顕微鏡解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 木村圭, 外丸裕司, 長崎慶三
  • 学会等名: 2011年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
  • 発表場所: 高知大学(高知市)
  • 年月日: 2011-09-17
• [学会発表] Newly-established groups for algal viruses (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki K, Tomaru Y
  • 学会等名: XV International Congress of Virology
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(札幌)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 海産珪藻Chaetoceros setoensisに感染する新奇一本鎖DNAウイルスの性状 (2011)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 豊田健介, 南雲保, 鈴木秀和, 長崎慶三
  • 学会等名: 日本藻類学会35回大会
  • 発表場所: 富山大学(富山市)
  • 年月日: 2011-03-27
• [学会発表] 藻類学ワークショップ1,藻類・藻類ウイルス・原生動物等の分離・培養法(藻類ウイルス) (2011)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司
  • 学会等名: 日本藻類学会35回大会
  • 発表場所: 富山大学(富山市)
  • 年月日: 2011-03-27
• [学会発表] Viruses as harmful algal bloom eliminator. (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki, K., Nakayama, N., Tomaru, Y.
  • 学会等名: International Conference on Viruses of the Environment : Challenges in Viral Ecology and Evolution
  • 発表場所: ISGホテル(ドイツ,ハイデルベルグ)
  • 年月日: 2011-03-22
• [学会発表] Ecological relationships between diatom blooms and viruses (2010)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Nagasaki K
  • 学会等名: 14th International Conference on Harmful Algae
  • 発表場所: ギリシャ(ポスター)
  • 年月日: 2010-11-01
• [学会発表] Ecological relationships between diatom blooms and viruses. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Nagasaki, K
  • 学会等名: 14th International Conference on Harmful Algae
  • 発表場所: ギリシャ・クレタマリスコンベンションセンター
  • 年月日: 2010-11-01
• [学会発表] 海産珪藻のリン酸ジエステル利用能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山口晴生, 大塚直樹, 有坂大志, 外丸裕司, 足立真佐雄
  • 学会等名: 平成22年度日本水産学会秋季大会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス(京都市)
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] 藻類ウイルス由来プロモーターを用いた海産珪藻の形質転換系の開発. (2010)
  • 著者名/発表者名: 岡見卓馬, 山口亜利沙, 外丸裕司, 長崎慶三, 山口晴生, 足立真佐雄
  • 学会等名: 平成22年度日本水産学会秋季大会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス(京都市)
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] 赤潮珪藻Chaetoceros cf.affinisの増殖における鉄利用能の検討 (2010)
  • 著者名/発表者名: 内藤佳奈子, 中村健一, 外丸裕司, 山口峰生, 今井一郎
  • 学会等名: 平成22年度日本水産学会秋季大会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス(京都市)
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 浮遊性珪藻とウイルスの生態学的挙動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 藤井直幹, 尾田成幸, 豊田健介, 長崎慶三
  • 学会等名: 2010年度日本海洋学会秋季大会
  • 発表場所: 東京農業大学オホーツクキャンパス(北海道網走市)
  • 年月日: 2010-09-07
• [学会発表] 広島湾産Chaetoceros sp.(TG07-C28)に感染する新規DNAウイルス. (2010)
  • 著者名/発表者名: 豊田健介, 長崎慶三, 外丸裕司
  • 学会等名: 日本珪藻学会第31回大会
  • 発表場所: 東京学芸大学(東京都調布市)
  • 年月日: 2010-05-08
• [図書] Diatom Virus. The Diatom World, Cellular Origin, Life in Extreme Habitats and Astrobiology (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Nagasaki K
  • 総ページ数: 533
  • 出版者: Springer
• [図書] The Diatom World, Cellular Origin, life in Extreme Habitats and Astrobiology 19 (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Nagasaki K
  • 総ページ数: 533
  • 出版者: Springer
• [備考] ホームページ等珪藻ウイルスの生態学的研究
  • URL: http://feis.fra.affrc.go.jp/keisou_Virus/index.html
• [備考] 珪藻ウイルスの生態学的研究
  • URL: http://feis.fra.affrc.go.jp/keisou_Virus/index.html
• [備考] 珪藻ウイルスの生態学的研究
  • URL: http://feis.fra.affrc.go.jp/keisou_Virus/members_tomaru.html
• [備考]
  • URL: http://feis.fra.affrc.go.jp/cgi-bin/htmlgen/htmllab.cgi?seigyo
• [備考]
  • URL: http://feis.fra.affrc.go.jp/cgi-bin/htmlgen/htmllab.cgi?seigyo