生体内ncRNAの機能解明を目指した蛍光性RNAタグの開発

• 研究課題/領域番号: 22710217
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 萩原 正規 大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (40403000)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2011年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2010年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: RNAアプタマー / 蛍光タンパク質 / 蛍光性RNA

研究概要

本研究提案『生体内ncRNAの機能解明を目指した蛍光性RNAタグの開発』では、有機合成化学手法で作製したGFP発色団を構造的基盤とする発色団化合物ライブラリーを構築し、およびそれに結合する分子生物学手法により獲得したRNAアプタマーペアから形成されるRNA-発色団ペアライブラリーから、『蛍光性RNA発色団複合体』の探索を行った

研究成果

• [雑誌論文] A small molecule regulates hairpin structures in d(CGG) trinucleotide repeats (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Hanping He, Maki Kimura, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 巻: 22 ページ: 2000-2003
  • 査読あり
• [雑誌論文] Small Molecule Modulates Hairpin Structures in CAG Trinucleotide Repeats (2011)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, He Hanping, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: ChemBioChem 巻: 12 ページ: 1686-1689
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ligand-Assisted Complex of Two DNA Hairpin Loops (2011)
  • 著者名/発表者名: Changfeng Hong, Masaki Hagihara, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: Angewandte Chemie International Edition 巻: 50 ページ: 4390-4393
  • 査読あり
• [雑誌論文] Antisense-induced guanine quadruplexes inhibit reverse transcription by HIV-1 reverse transcriptase (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Lisa Yamauchi, Akiko Seo, Keisuke Yoneda, Mayo Senda, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: 132 ページ: 11171-11178
  • 査読あり
• [雑誌論文] A reverse transcriptase stop assay revealed diverse quadruplex formations in UTRs in mRNA (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Keisuke Yoneda, Hiroaki Yabuuchi, Yasushi Okuno, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 巻: 20 ページ: 2350-2353
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure-activity studies on the fluorescent indicator in the displacement assay for the screening of small molecules binding to RNA
  • 著者名/発表者名: Shiori Umemoto, Seongwang Im, Jinhua Zhang, Masaki Hagihara, Asako Murata, Yasue Harada, Takeo Fukuzumi, Takahiro Wazaki, Shin-ichi Sasaoka, and Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: Chemistry European Journal 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] グアニン修飾アンチセンス核酸を利用したグアニン四重鎖構造制御法 (2012)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶應義塾大学日吉キャンパス
  • 年月日: 2012-03-28
• [学会発表] 新奇アンチセンス核酸を利用したグアニン四重鎖構造制御法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場「エポカルつくば」
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 新奇アンチセンス核酸を利用したグアニン四重鎖構造制御法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: 第5回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場「エポカルつくば」(茨城)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 新奇アンチセンス核酸を利用したRNA中のグアニン四重鎖構造の制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: アンチセンス.遺伝子.デリバリーシンポジウム2011
  • 発表場所: 大阪大学コンベンションセンター
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] 新奇アンチセンス核酸を利用したRNA中のグアニン四重鎖構造の制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2011
  • 発表場所: 大阪大学コンベンションセンター(大阪)
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] Antisense-Induced G-Quadruplex Structures Interfere with Reverse Transcription by HIV-1 Reverse Transcriptase (2011)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Kazuhiko Nakatani
  • 学会等名: RNA 2011, the 16th Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)
  • 年月日: 2011-06-16
• [学会発表] Antisense-Induced G-Quadruplex Structures Interfere with Reverse Transcription by HIV-1 Reverse Transcriptase (2011)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Kazuhiko Nakatani
  • 学会等名: the 16th Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: 京都国際会議場
  • 年月日: 2011-06-15
• [学会発表] アンチセンス核酸を利用したグアニン四重鎖構造制御法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: 日本化学会第91春季年会
  • 発表場所: 神奈川大学
  • 年月日: 2011-03-26
• [学会発表] In vitro selection of RNA aptamers that can bind to GFP chromophore (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Keisuke Yoneda, and Kazuhiko Nakatani
  • 学会等名: PACIFICHEM 2010
  • 発表場所: ハワイコンベンションセンター
  • 年月日: 2010-12-19
• [学会発表] Reverse transcriptase stop assay revealed diverse quadruplex formations in mRNA (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara and Kazuhiko Nakatani
  • 学会等名: PACIFICHEM2010
  • 発表場所: 日ハワイコンベンションセンター
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] Kazuhiko Nakatani Antisense-induced guanine quadruplexes interfere with reverse transcription by HIV-1 reverse transcriptase (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Lisa Yamauchi, Akiko Seo, Keisuke Yoneda, Mayo Senda
  • 学会等名: ISNAC2010
  • 発表場所: 横浜はまぎんホール・ヴィアマーレ
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] Quadruplexes in Untranslated Regions in mRNA Modulates Translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara
  • 学会等名: The 4th HiPep-Okinawa International Workshop Program
  • 発表場所: 沖縄産業支援センター
  • 年月日: 2010-07-09
• [学会発表] RNA Quadruplexes in Untranslated Regions in mRNA Modulates Translation (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara
  • 学会等名: The 4th HiPep-Okinawa International Workshop Program
  • 発表場所: 沖縄産業支援センター(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-09
• [学会発表] Antisense-induced guanine quadruplexes interfere with reverse transcription by HIV-1 reverse transcriptase (2010)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hagihara, Lisa Yamauchi, Akiko Seo, Keisuke Yoneda, Mayo Senda, Kazuhiko Nakatani
  • 学会等名: 第37回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: 横浜・みなとみらい
• [備考]
  • URL: http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/rbc/member/hagihara.html