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多次元核磁気共鳴法によるメタローム解析を基盤とするイネの代謝解析研究

研究課題

研究課題/領域番号 22710230
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物分子科学
研究機関独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

関山 恭代  独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 食品総合研究所・食品分析研究領域, 任期付研究員 (60342804)

研究期間 (年度) 2010 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード機器分析 / メタボローム解析 / 核磁気共鳴法 / 安定同位体標識 / メタボローム / イネ
研究概要

本申請課題では、安定同位体標識と多次元核磁気共鳴(NMR)法を我が国の基幹作物であるイネのメタボローム解析に展開し、未同定代謝物のアノテーション(NMRシグナルに対し、化合物情報を付加すること)の情報を増加させることを目的とした。そのためには、イネを^<13> Cで高度に標識し、検出感度を上げ必要がある。そこでイネへの^<13> CO_2の投与条件を改良し、75%という高標識率を達成し、葉に含まれる水溶性代謝物135種類、メタノール可溶性代謝物として164種類の候補代謝物をリストアップした。

報告書

(3件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] NMR計測による生体代謝物情報の抽出2012

    • 著者名/発表者名
      関山恭代、近山英輔、菊地淳
    • 雑誌名

      ぶんせき

      巻: 2月号 ページ: 81-88

    • NAID

      10030723663

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Evaluation of a Semipolar Solvent System as a Step toward Heteronuclear Multidimensional NMR-Based Metabolomics for C^<13>-Labeled Bacteria2011

    • 著者名/発表者名
      Yasuyo Sekiyama, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi
    • 雑誌名

      Plants, and Animals, Analytical Chemistry

      巻: 83 ページ: 719-726

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] NMR法によるメタボローム解析の現状と農作物解析への応用2012

    • 著者名/発表者名
      関山恭代
    • 学会等名
      総合研究試験研究推進会議土壌肥料研究会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2012-02-21
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] NMR法によるメタボローム解析の現状と農作物解析への応用2012

    • 著者名/発表者名
      関山恭代
    • 学会等名
      総合研究試験研究推進会議土壌肥料研究会第1分科会「メタボローム解析技術の農業への展開」
    • 発表場所
      農林水産技術会議筑波事務所(茨城県)(招待講演)
    • 年月日
      2012-02-21
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] NMR-based metabolite profiling in potato and rice plants2012

    • 著者名/発表者名
      Yasuyo Sekiyama, Seishi Ikeda, Shogo Tsuda, Nobutaka Someya, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi, Hiroshi Ono
    • 学会等名
      8th Annual International Meeting of the Metabolomics Society
    • 発表場所
      Washington D. C
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2016-04-21  

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