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創薬へ向けた原虫トランスクリプトームの高解像度解析

研究課題

研究課題/領域番号 22780258
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 基礎獣医学・基礎畜産学
研究機関東北大学 (2012)
帯広畜産大学 (2010-2011)

研究代表者

山岸 潤也  東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教 (80535328)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2010年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワード原虫 / トキソプラズマ / トランスクリプトーム / 次世代シーケンサー / 転写開始点 / バイオインフォマティクス / TSS-seq / 転写制御
研究概要

RNA-seqやTSS-seqに代表される次世代型シークエンサーを用いた新しい技術によって種々の生物の遺伝子発現を網羅的に解析することが可能になっている。我々は当該技術を哺乳類一般を宿主とする原虫の1つであるトキソプラズマに適応し、その生活環を構成する代表的な3ステージの解析を行うことで、各ステージの遺伝子発現プロファイルを明らかにし、その制御に関わるDNAcis-elementを推定した。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Characterization of Toxoplasma gondii 5' UTR with encyclopedic TSS information2012

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi, et al
    • 雑誌名

      J.Parasitol.

      巻: 98 号: 2 ページ: 455-457

    • DOI

      10.1645/ge-2864.1

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Protective effect of a prime-boost strategy with plasmid DNA followed by recombinant adenovirus expressing TgAMA1 as vaccines against Toxoplasma gondii infection in mice.2012

    • 著者名/発表者名
      Yu L
    • 雑誌名

      Parasitol Int

      巻: Sep;61(3) 号: 3 ページ: 481-486

    • DOI

      10.1016/j.parint.2012.04.001

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Construction and analysis of full-length cDNA library of Cryptosporidium parvum2011

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi J, Wakaguri H, Sugano S, Kawano S, Fujisaki K, Sugimoto C, Watanabe J, Suzuki Y, Kimata I, Xuan X
    • 雑誌名

      Parasitol Int

      巻: 60(2) 号: 2 ページ: 199-202

    • DOI

      10.1016/j.parint.2011.03.001

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full-parasites: database of full-length cDNAs of apicomplexa parasites, 2010 update2011

    • 著者名/発表者名
      Tuda J, Mongan AE, Tolba ME,Imada M, Yamagishi J, Xuan X, Wakaguri H, Sugano S, Sugimoto C, Suzuki Y. Nucleic
    • 雑誌名

      Acids Res

      巻: 39(Database issue) 号: Database ページ: D625-D631

    • DOI

      10.1093/nar/gkq1111

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full-parasites : database of full-length cDNAs of apicomplexa parasites, 2010 update2011

    • 著者名/発表者名
      Tuda J, et al
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 39

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-resolution characterization ofToxoplasma gondii transcriptome with a massive parallel sequencing method2010

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi J, Wakaguri H, Ueno A, Goo YK, Tolba M, Igarashi M, Nishikawa Y, Sugimoto C, Sugano S, Suzuki Y,Watanabe J, Xuan X
    • 雑誌名

      DNA Res

      巻: 17(4) 号: 4 ページ: 233-43

    • DOI

      10.1093/dnares/dsq013

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-resolution characterization of Toxoplasma gondii transcriptome with a massive parallel sequencing method2010

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi J, et al
    • 雑誌名

      DNA research

      巻: 17 ページ: 233-243

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Advances in Tropical Genomics: Conservation and Sustainable Utilization of Tropical Biodiversity2011

    • 著者名/発表者名
      Junya Yamagishi, Hiroyuki Wakaguri,Junichi Watanabe, Kawazu Shin-ichiro, Yutaka Suzuki, Xuenan Xuan
    • 学会等名
      Transcriptomics of a Parasit Toxoplasma gondii from Next Generation Sequencing
    • 発表場所
      Bogor, Indonesia
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] XIII International Congress ofBacteriology and Applied Microbiology2011

    • 著者名/発表者名
      Junya Yamagishi, Hiroyuki Wakaguri, Akio Ueno, Makoto Igarashi, Junichi Watanabe, Yutaka Suzuki, Xuenan Xuan
    • 学会等名
      Comparative transcriptomics among tachyzoites, bradyzoites and sporozoites of Toxoplasma gondii using massive parallel sequencing method
    • 発表場所
      Sapporo, Japan
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [備考] Full-Toxoplasma

    • URL

      http://fullmal.hgc.jp/index_tg_ajax.html

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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