ABC輸送体のX線結晶構造解析

• 研究課題/領域番号: 22790512
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用薬理学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 小段 篤史 京都大学, 物質.細胞統合システム拠点, 研究員 (80360543)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2010年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: 生体分子 / 蛋白質 / 薬学 / 癌 / ABC蛋白質 / X線結晶構造解析 / 創薬

研究概要

本研究では、X線結晶構造解析の手法を用い、真核生物のABC輸送体の3次元構造を高解像度で解明することを目的とした。種々の真核生物由来のABC輸送体について結晶化スクリーニングを行った結果、単細胞性紅藻由来のP糖蛋白質ホモログについて結晶を得ることに成功した。大型放射光施設SPring-8のシンクロトロン放射光を用いてX線回折実験を実施し、真核生物のABC蛋白質としては、これまでに報告された中で世界最高の解像度を得ることに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Deleting two C-terminalα-helices is effective to crystallize the bacterial ABC transporter Escherichia coli MsbA complexed with AMP-PNP (2010)
  • 著者名/発表者名: Kanako Terakado, Atsushi Kodan, Hiroaki Nakano, Yasuhisa Kimura, Kazumitsu Ueda, Toru Nakatsu, and Hiroaki Kato
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section D. Biological Crystallography 巻: D66 号: 3 ページ: 319-323
  • DOI: 10.1107/s0907444909055504
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deleting two C-terminal α-helices is effective to crystallize the bacterial ABC transporter Escherichia coli MsbA complexed with AMP-PNP. (2010)
  • 著者名/発表者名: Terakado, K., Kodan, A., Nakano, H., Kimura, Y., Ueda, K., Nakatsu, T., Kato, H.
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography 巻: D66 ページ: 319-323
  • 査読あり
• [学会発表] X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter (2012)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kodan
  • 学会等名: ABC2012, the 4th FEBS Special Meeting
  • 発表場所: オーストリア(インスブルク)
  • 年月日: 2012-02-29
• [学会発表] X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter (2012)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Akane Fujioka, Kazumitsu Ueda, and Hiroaki Kato
  • 学会等名: the 4th FEBSSpecial Meeting"ATP-Binding Cassette Proteins : From Multidrug Resistance to Genetic Disease
  • 発表場所: Innsuburuck, Austria
• [学会発表] 好熱性紅藻由来の基質排出型ABCトランスポーターの基質特異性の解析/Substrate specificity analysis of an exporter type ABC transporter from athermophilic eukaryote (2011)
  • 著者名/発表者名: 山口知宏、崎山慶太、佐藤友美、小段篤史、中津亨、植田和光、加藤博章
  • 学会等名: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 吹田
  • 年月日: 2011-06-09
• [学会発表] Characterization of multi-drugexporter activity of an ABC transporter from a thermophiliceukaryote (2011)
  • 著者名/発表者名: 山口知宏、崎山慶太、地主遼平、佐藤友美、小段篤史、中津亨、植田和光、加藤博章
  • 学会等名: Cyanidioschyzon merolae日本薬学会第131年会
  • 発表場所: 静岡
  • 年月日: 2011-03-30
• [学会発表] X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter (2011)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Akane Fujioka, Kazumitsu Ueda, and Hiroaki Kato
  • 学会等名: Joint International Symposium"ABC2011 in Kyoto-ABC Proteins/Membrane Meso-domains/ES-iPS cells"
  • 発表場所: Kyoto, Japan
• [学会発表] 好熱性紅藻由来ABCトランスポーターの多剤排出活性の特徴 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山口知宏、崎山慶太、池口圭司、地主遼平、佐藤友美、渡辺文太、小段篤史、中津亨、平竹潤、植田和光、加藤博章
  • 学会等名: 第32回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2010-11-29
• [学会発表] 好熱性紅藻由来ABCトランスポーターの多剤排出活性の特徴 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山口知宏、崎山慶太、池口圭司、地主遼平、佐藤友美、渡辺文太、小段篤史、中津亨、平竹潤、植田和光、加藤博章
  • 学会等名: 第32回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
  • 発表場所: 富山、富山国際会議場
  • 年月日: 2010-11-29
• [学会発表] 好熱性紅藻Cyanidioschyzonmerolae由来のABCトランスポーターの発現、精製、及び機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 崎山慶太、山口知宏、小段篤史、中津亨、佐藤友美、植田和光、加藤博章
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 好熱性紅藻Cyanidioschyzon merolae由来のABCトランスポーターの発現、精製、及び機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 崎山慶太、山口知宏、小段篤史、中津亨、佐藤友美、植田和光、加藤博章
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌、札幌コンベンションセンター
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] Functional role of the linker region in the mechanism of human multidrug efflux transporter P-glycoprotein (2010)
  • 著者名/発表者名: Tomomi Sato, Atsushi Kodan, YasuhisaKimura, Kazumitsu Ueda, Toru Nakatsu, and Hiroaki Kato
  • 学会等名: The 5th Seoul-Kyoto-Osaka(SKO) Joint Symposium on Pharmaceutical Sciences for Young Scientist
  • 発表場所: Osaka, Japan