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学習型AIセンサシステムによる迅速・網羅的細菌検出と同定

研究課題

研究課題/領域番号 22K14581
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分28050:ナノマイクロシステム関連
研究機関名古屋大学

研究代表者

嶋田 泰佑  名古屋大学, 工学研究科, 助教 (00850140)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2023年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2022年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
キーワード細菌 / 学習型AIセンサシステム / 単一細菌センシング / ポアセンサ / 機械学習 / マイクロポア / センサシステム / 細菌種識別 / 学習型センサ / 界面活性剤 / マイクロ流体 / ソーティング / 単一細菌検出 / 機械学習解析 / データ強化
研究開始時の研究の概要

細菌感染症は薬剤耐性化によりその脅威が加速しつつあり、種々の領域において迅速な細菌検出と同定が強く求められる。センサ技術はその要求を満たす候補であるが、多種多様な標的細菌をカバーするためには対応するレセプターを多数必要とする技術的な課題がある。本研究では、レセプターを必要としない学習型AIセンサシステムにより、迅速で網羅的な細菌検出とデータ駆動型の同定法を創出する。そのために、単一細菌のセンシングから機械学習によるビッグデータ解析・超高精度推定、ソーティングによる推定用データの蓄積までの一気通貫した革新的システムを創製し、多種多様な細菌をカバーできる迅速検出と同定を実現する。

研究成果の概要

細菌感染症は世界的に主要な死因の一つであり、加速する薬剤耐性化はその脅威を増大させる。マイクロ・ナノ構造体を利用したセンサは迅速な細菌検出と同定を実現することが可能な技術的な候補であるが、多種多様な標的細菌をカバーするためには対応するレセプターを多数必要とするという課題がある。本研究では、レセプターを必要としない学習型AIセンサシステムにより、迅速で網羅的な細菌検出とデータ駆動型の同定法を創出する。そのために、単一細菌のセンシングから機械学習によるビッグデータ解析・超高精度推定が可能な革新的システムを創製して、様々な細菌の迅速検出と同定を実現した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

単一細菌細胞の物理的な特性を反映したパルスセンシングを基軸とした、データ駆動的な細菌種の同定が可能な独自システムを開発する。本システムによりレセプターを必要としない学習型センサという新規概念を創造して、レセプターレスな細菌検出・同定技術を創出する。本研究成果は、レセプターに依存したセンサによる標的細菌の同定にパラダイムシフトを起こし、学習型センサによる迅速・網羅的検出とデータに基づく同定への大転換をもたらす。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 1件) 図書 (3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Nano-quantum sensors-based imaging and sensing for target-based drug discovery and development2024

    • 著者名/発表者名
      Shimada Taisuke、Ueda Yasuyuki、Takemaru Hikari、Baba Yoshinobu、Yukawa Hiroshi
    • 雑誌名

      TrAC Trends in Analytical Chemistry

      巻: 171 ページ: 117496-117496

    • DOI

      10.1016/j.trac.2023.117496

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Resistive Pulse Sensing on a Capillary-Assisted Microfluidic Platform for On-Site Single-Particle Analyses2023

    • 著者名/発表者名
      Shimada Taisuke、Fujino Keiko、Yasui Takao、Kaji Noritada、Ueda Yasuyuki、Fujii Kentaro、Yukawa Hiroshi、Baba Yoshinobu
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry

      巻: 95 号: 50 ページ: 18335-18343

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.3c02539

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PMMA 製ナノワイヤデバイスによる体液中細胞外小胞由来 microRNA 抽出2023

    • 著者名/発表者名
      嶋田 泰佑,竹下 大貴,伊藤 聡,安井 隆雄,馬場 嘉信
    • 雑誌名

      Bunseki Kagaku

      巻: 72 ページ: 105-110

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 単一細菌センシングによる尿中細菌の耐性識別2023

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会第48回研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] マイクロデバイスによる迅速耐性識別システムの構築2023

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      日本化学会秋季事業第13回CSJ化学フェスタ2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 単一細菌計測による薬剤耐性機能の解析2023

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      第34回生体機能関連化学部会サマースクール
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 単一細菌計測による迅速な耐性識別システムの構築2023

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会第47回研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 単一細菌センシングと抗菌薬刺激による耐性菌の迅速識別2023

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      日本化学会 第103春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ナノバイオデバイスを用いた生体内外の分子・微粒子解析法の開発2022

    • 著者名/発表者名
      嶋田泰佑
    • 学会等名
      第39回 分析化学中部夏季セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 単一細菌計測と薬剤刺激による菌種・耐性識別2022

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      第53 回 中部化学関係学協会支部連合秋季大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 単一細菌センシングによる迅速な菌種・耐性識別2022

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会 第46回研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] PEG 化PDMS を用いたポアセンサ保管と単一細菌計測への応用2022

    • 著者名/発表者名
      嶋田泰佑, 藤野慶子, 安井隆雄, 加地範匡, 馬場嘉信
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会 第46回研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] マイクロポアを用いた抗菌薬刺激応答の解析と耐性識別2022

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 学会等名
      化学とマイクロ・ナノシステム学会 第45回研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] 単一細菌センシングによる迅速な菌種・耐性識別法の創出2023

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 嶋田泰佑, 安井隆雄, 山崎聖司, 西野邦彦, 馬場嘉信
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      化学とマイクロ・ナノシステム学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] バイオエアロゾルの捕集と検出技術2022

    • 著者名/発表者名
      嶋田泰佑, 馬場嘉信
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      日本空気清浄協会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] センサ技術を用いた細菌の検出・同定2022

    • 著者名/発表者名
      嶋田 泰佑
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      化学とマイクロ・ナノシステム学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 名古屋大学大学院工学研究科 生命分子工学専攻 馬場研究室

    • URL

      https://www.chembio.nagoya-u.ac.jp/labhp/bioanal1/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/t.shimada

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2022-04-19   更新日: 2025-01-30  

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