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蛍光検出振動分光によるタンパク質発色団構造揺らぎダイナミクスの解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K14651
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分32010:基礎物理化学関連
研究機関分子科学研究所

研究代表者

米田 勇祐  分子科学研究所, 協奏分子システム研究センター, 助教 (60903721)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード単一分子分光 / 蛍光相関分光法 / 光応答性タンパク質 / 振動分光 / 構造ダイナミクス / 蛍光相関分光
研究開始時の研究の概要

光応答性タンパク質の多くは発色団分子が構造を変化させることで機能を発現するため、その揺らぎのダイナミクスを捉えることは重要である。しかし、通常の振動分光ではタンパク質骨格のアミノ酸残基に由来するバックグラウンド信号が強く、発色団由来の信号を選択的に観測することは難しい。さらに、タンパク質は常に揺らいでいる周囲環境の中で複数の立体構造異性体あるいは化学種として統計的に存在するため、それらの遷移ダイナミクスを捉えることは困難である。本研究では電子共鳴を利用した振動分光と蛍光相関分光を組み合わせることで、マイクロ秒~ミリ秒で進行するタンパク質発色団の構造揺らぎダイナミクスを明らかにする。

研究成果の概要

単一分子分光法は個々の分子の物理的特性を研究するための強力な方法であるが、様々な化学的および生物学的過程が進行する室温溶液中で分子の高速な揺らぎダイナミクスを解明することは困難である。この研究では、励起スペクトルの自発的揺らぎを観測することのできる、室温溶液中のフーリエ変換に基づく蛍光励起相関分光法を開発した。この方法を用いることで、蛍光色素 ATTO647N の蛍光励起スペクトルを単一分子レベルで測定することに成功した。さらに、励起波長分解した蛍光自己相関関数がマイクロ秒からミリ秒の範囲で得られ、色素の拡散に対応する相関関数の減衰を捉えることに成功した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

蛍光相関分光法(FCS)は、凝縮相における単一分子レベルの光子統計の揺らぎを検出することで、分子の拡散や反応過程を明らかにすることのできる手法であり、蛍光強度や寿命に基づいた解析によってナノ秒からマイクロ秒で進行するタンパク質の構造揺らぎが明らかにされてきた。一方で、こうした揺らぎは電子・振動スペクトルにも反映されることが予測されるが、既存の手法ではこれらの相関を捉えることは困難であった。今回我々が開発した新規手法では、励起波長分解した蛍光自己相関関数の測定に成功した。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2024 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 3件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件、 招待講演 5件)

  • [国際共同研究] UC Berkeley(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Rapid-Scan Resonant Two-Dimensional Impulsive Stimulated Raman Spectroscopy of Excited States2023

    • 著者名/発表者名
      Yoneda Yusuke、Kuramochi Hikaru
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry A

      巻: 127 号: 24 ページ: 5276-5286

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.3c02489

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quasi-Reversible Photoinduced Displacement of Aromatic Ligands from Semiconductor Nanocrystals2023

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Yoshioka, Yusuke Yoneda, I-Ya Chang, Hikaru Kuramochi, Kim Hyeon-Deuk, Yoichi Kobayashi
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 17 号: 12 ページ: 11309-11317

    • DOI

      10.1021/acsnano.2c12578

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Environment-sensitive fluorescence of COT-fused perylene bisimide based on symmetry-breaking charge separation2023

    • 著者名/発表者名
      Kimura Ryo、Yoneda Yusuke、Kuramochi Hikaru、Saito Shohei
    • 雑誌名

      Photochemical & Photobiological Sciences

      巻: 22 号: 11 ページ: 2541-2552

    • DOI

      10.1007/s43630-023-00468-4

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 先端的非線形分光によって明らかにする光化学系IIの複雑なダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      米田 勇祐
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 63 号: 3 ページ: 171-172

    • DOI

      10.2142/biophys.63.171

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Energy transfer dynamics and the mechanism of biohybrid photosynthetic antenna complexes chemically linked with artificial chromophores2022

    • 著者名/発表者名
      Yoneda Yusuke、Noji Tomoyasu、Mizutani Naoto、Kato Daiji、Kondo Masaharu、Miyasaka Hiroshi、Nagasawa Yutaka、Dewa Takehisa
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 24 号: 40 ページ: 24714-24726

    • DOI

      10.1039/d2cp02465a

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The initial charge separation step in oxygenic photosynthesis2022

    • 著者名/発表者名
      Yoneda Yusuke、Arsenault Eric A.、Yang Shiun-Jr、Orcutt Kaydren、Iwai Masakazu、Fleming Graham R.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 2275-2275

    • DOI

      10.1038/s41467-022-29983-1

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ultrafast energy transfer between self-assembled fluorophore and photosynthetic light-harvesting complex 2 (LH2) in lipid bilayer2022

    • 著者名/発表者名
      Y. Yoneda, M. Kito, D. Mori, A. Goto, M. Kondo, H. Miyasaka, Y. Nagasawa, T. Dewa
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 156 号: 9 ページ: 095101-095101

    • DOI

      10.1063/5.0077910

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] フェムト秒時間分解時間領域ラマン分光による非平衡な励起状態平面化ダイナミクスの観測2024

    • 著者名/発表者名
      米田勇祐,小西智暉,齊藤尚平,倉持光
    • 学会等名
      日本化学会 第104春季年会 (2024)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Exploring complex reaction dynamics using multidimensional vibrational spectroscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Yoneda
    • 学会等名
      38th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 先端的非線形分光を用いた電子-構造ダイナミクスの解明2023

    • 著者名/発表者名
      米田勇祐
    • 学会等名
      第44回 光化学若手の会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 高速スキャンによる励起状態共鳴2次元ラマン分光法の開発と応用2023

    • 著者名/発表者名
      米田勇祐,倉持光
    • 学会等名
      2023年光化学討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 室温・溶液中における単一分子レベルの発光励起分光2023

    • 著者名/発表者名
      米田勇祐,倉持光
    • 学会等名
      第17回分子科学討論会2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 高速スキャンによる励起状態共鳴2次元ラマン分光2023

    • 著者名/発表者名
      米田勇祐,倉持光
    • 学会等名
      第17回分子科学討論会2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 先端的分光解析で解きほぐす光化学系 IIの複雑な励起状態ダイナミクス2022

    • 著者名/発表者名
      米田勇祐
    • 学会等名
      第29回 光合成セミナー2022:反応中心と色素系の多様性
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 二次元分光による非局在化した電子状態から繰り広げられる光合成初期過程の探究2022

    • 著者名/発表者名
      米田勇祐
    • 学会等名
      日本分光学会 関西支部 2022年度第2回(令和4年度)講演会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 励起子電荷分離混成が酸素発生型光合成を駆動する2022

    • 著者名/発表者名
      米田 勇祐, Arsenault Eric A, Yang Shiun-Jr, Orcutt Kaydren, Iwai Masakazu, Fleming Graham R
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2022-04-19   更新日: 2025-01-30  

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