| 研究課題/領域番号 |
22K15661
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分52010:内科学一般関連
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| 研究機関 | 東北大学 |
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研究代表者 |
奥田 拓史 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 非常勤講師 (60868230)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2022年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
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| キーワード | GWAS / SNP / 尿中アルブミン |
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| 研究開始時の研究の概要 |
TMM67Kのテータを元に、尿中アルフミン排泄量を応答変数としたGWASを行い、尿中アルフミン排泄量に関連する新規SNPを探索する。
TMM10KテータとのメタGWASを行う。
要約統計量を元にpolygenicスコアを計算し、宮城センター型18Kのテータでリスク予測を行う。
新規S N P候補に関する基礎的検討を行う。特に、T S H Rをコードする遺伝子が候補となった場合は、腎生検標本をT S H R抗体で染色し、尿中アルブミン排泄量との関連を検討する。
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| 研究実績の概要 |
ToMMo67Kを用いたGWASにて、対象形質に関する候補SNPは検出された。
候補SNPはK代謝に関わるタンパク質をコードしていた。Ｋ代謝は、腎機能に大きく影響を受け、また、大きく影響を与えるため、腎不全指標になりうる蛋白尿に関しても、重要な関連があると思われる。
候補SNPは、全体のGWASでも、腎機能が正常群のみのGWASでも、ピークが現れたため、腎機能に関係なく尿中アルブミン排泄に関わっている可能性が示唆された。候補SNPの基礎的検討については、まだなされていないが、ノックアウトマウスなどを使っての実験なども考え、今後多角的な方面から、その意義について検討する必要がある。最終的には、腎不全に効果がある新規創薬につながる可能性もあり、候補SNPの同定は、大きな意義があった。
これらの成果は、The 29th Scientific Meeting of the International Society of Hypertension (ISH2022 Kyoto)にて発表した。非正規分布を示す形質を応答変数としたGWAS解析であったため、統計学的処理に関する指摘を受けたが、多くの研究者に興味を持ってもらえた。
ToMMo10KとのMeta-GWASを行い、要約統計量を元にpolygenic risk scoreを計算し、重複のないデータでリスク予測を行うところまでは、遂行できなかったため、今後の課題としたい。
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