| 研究課題/領域番号 |
22K16660
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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小区分56010:脳神経外科学関連
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| 研究機関 | 岡山大学 (2023)
国立研究開発法人国立がん研究センター (2022) |
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研究代表者 |
畝田 篤仁 岡山大学, 医学部, 客員研究員 (20865927)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2022年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
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| キーワード | 膠芽腫 / 微小環境 / YAP/TAZ / 幹細胞 / TEAD |
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| 研究開始時の研究の概要 |
膠芽腫は難治な腫瘍であり、新たな治療法が望まれている。膠芽腫の不均一性と間葉系微小環境は、治療抵抗性の主な要因として注目されている。膠芽腫幹細胞と、それが分化して生成される分化型膠芽腫細胞(DGC)の解析により、DGCはYAP/TAZ-TEAD-CCN1経路を介して腫瘍内へのマクロファージ浸潤を促進しており、YAP/TAZ-TEADが膠芽腫の間葉系微小環境構築における重要因子であることをわかった。本研究では、膠芽腫の微小環境改善を目指したYAP/TAZ-TEAD阻害剤による新たな治療戦略を開発する。さらにシングルセル解析により微小環境の変化を解析し、新たな治療戦略へと繋げることを目標とする
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| 研究実績の概要 |
マルチサンプリングにより採取したヒト膠芽腫手術検体を用いて、空間情報を追加した単一細胞マルチオミクスを行う。採取部の空間情報は、術中のナビゲーション画像、病理画像として保存する。さらに、DNAバーコード付き細胞表面マーカー抗体（Hashtag抗体）を用いたCITE-seqを行う。ハッシュタグ法およびCITE-seqを併用したシングルセル及びシングル核マルチオームライブラリー構築のプロトコール確立のため、本年度は膠芽腫20症例のサンプル調整の検討を行った。物理的及び酵素反応による一細胞化処理、Debris、赤血球除去、凝集細胞のフィルタリングの条件検討を行い、安定して生存率80%以上のサンプルを調整することが可能となった。これまでに4症例14箇所のサンプルからシングルセル及び核ライブラリーを作成しシークエンス解析を行った。シークエンスデータの解析の結果、腫瘍の中央部ではマクロファージ、深部ではoligodendrocyte precursor cell が多く含まれるといった採取部位による含有細胞組成の不均一性を確認した。Mesenchymal-like、Astrocyte-like、Oligodendrocyte precursor cell-like、Neural precursor cell-likeといった、これまでに報告されている膠芽腫細胞の遺伝子発現パターンについても、採取部位による不均一性を確認した。公開データとの統合解析を行い、inter tumoral heterogeneityについての解析、また、isoform解析が可能なsingle cell long read RNA-seqも進めており、スプライシング解析やRNAからの変異解析も行い進展形式を明らかにしていく。
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