• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

DNAメチル化をマーカーとする環境DNAエピジェネティクス

研究課題

研究課題/領域番号 22K19346
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
研究機関神戸大学

研究代表者

源 利文  神戸大学, 人間発達環境学研究科, 教授 (50450656)

研究分担者 山中 裕樹  龍谷大学, 先端理工学部, 准教授 (60455227)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2023年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2022年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
キーワード環境DNA / DNAメチル化 / エピジェネティクス / バイサルファイトシーケンス / メチル化 / 繁殖活動
研究開始時の研究の概要

ここ10年ほどの間に「環境DNA分析」と呼ばれる技術が発展しているが、環境DNA分析には、採捕すればすぐに分かる、生物の状態に関わる情報(親か子か、オスかメスかなど)が得られないという弱点があった。本研究では、環境DNA分析によって、遺伝子の修飾状態を把握する手法開発に挑戦する。このように「水から」生物の状態を把握することができれば、繁殖地の探索などを通じて生物多様性の保護、水産養殖における飼育種のストレス状態の指標化などにも有用である。本研究はその第一段階としての概念実証を目指すものであるが、それに成功すれば、環境DNA分析が生物モニタリングに与えたインパクト以上の影響を与えることだろう。

研究成果の概要

簡便な生物モニタリング手法としての有用性が認識されている環境DNA分析手法を更に発展させ、親か子かなどの生物の状態を知るための手法として昇華させるため、DNAのメチル化状態を環境DNAで分析する「環境DNAエピジェネティクス」手法の開発に取り組んだ。ゼブラフィッシュを用いた実験の結果、適切な遺伝子マーカーを選択することで、生体のメチル化状態を環境DNAで明らかにする「環境DNAエピジェネティクス」分析が可能であることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生物モニタリングの新手法として有用な環境DNA分析手法を更に発展させ、フィールドの水を汲むだけで生物の生理状態などをモニタリングすることのできる新たな手法の開発に成功した。この手法を用いることで、野生生物がどのような生理状態でいるのか、いつどこで繁殖しているのかなど、従来の環境DNA分析では得ることのできなかった情報を簡便に得られる可能性がある。この手法が発展することで、生物多様性の保全や、水産有用魚種の持続的利用などに応用可能である。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2024 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うちオープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Stability of environmental DNA methylation and its utility in tracing reproductive activities of fish2024

    • 著者名/発表者名
      Hirayama Itsuki, Minamoto Toshifumi, Wu Luhan
    • 雑誌名

      AUTHOREA (プレプリント)

      巻: Preprint ページ: 1-57

    • DOI

      10.22541/au.171007239.91091562/v1

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] 環境DNAのメチル化解析に基づく魚類繁殖活動の検出2024

    • 著者名/発表者名
      平山一槻, 呉盧漢, 源利文
    • 学会等名
      第71回日本生態学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Application of DNA methylation analysis to eDNA studies2023

    • 著者名/発表者名
      Hirayama, I., Wu, L., Minamoto, T.
    • 学会等名
      The eDNA Society International Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Methylation analysis of environmental DNA for breeding monitoring of fish2023

    • 著者名/発表者名
      Hirayama, I., Wu, L., Minamoto, T.
    • 学会等名
      BES Annual Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Application of DNA methylation analysis to eDNA studies2023

    • 著者名/発表者名
      Itsuki Hirayama, Luhan Wu, Toshifumi Minamoto
    • 学会等名
      The eDNA Society International Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 環境DNAにおけるDNAメチル化解析とその生態学的利用に向けたアプローチ2022

    • 著者名/発表者名
      平山一槻, 源利文
    • 学会等名
      環境DNA学会「あなたが主役のワークショップ」
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2022-07-05   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi