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ニューロンの多階層エピジェネティクス情報の潜在変数モデルによる記憶の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K19823
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分62:応用情報学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

岸 雄介  東京大学, 定量生命科学研究所, 准教授 (00645236)

研究分担者 水野 忠快  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (90736050)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2023年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2022年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードニューロン / エピゲノム / 潜在変数モデル / 老化 / テンソル分解 / エピジェネティクス
研究開始時の研究の概要

記憶の実体は人類の最大の謎の1つである。本研究では、幼少期にストレスを与えたマウスをモデルとして、ニューロンのエピジェネティクス情報を潜在変数モデルにより解析することで、個体の記憶の実体を解明することを目指す。そのため、幼少期ストレスを与えたマウスの海馬から採取したニューロン核を用いて包括的にエピジェネティクス情報を取得する。そして、それを複数の解析手法にて因子構造を推定し、幼少期ストレスの有無を最も区別できる方法論を確立することで、幼少期ストレスの記憶を読み取る。これにより、将来的にはこの方法論を用いて個体の記憶の読み取りと、その分子生物学的操作により記憶の書き換えが可能になると期待される。

研究成果の概要

私を私たらしめるものは記憶であり、記憶の実体は人類の最大の謎の1つである。申請者は、ニューロンのエピジェネティクス情報に着目した。体中の細胞には全く同じ遺伝情報がゲノムにコードされているが、細胞ごとに異なる性質を獲得するためにはエピジェネティクスが重要である。細胞においてどの遺伝子を読み取れるか(転写できるか)を規定する「目印」となり、これが細胞ごとに異なるのである。
本研究ではニューロンのエピジェネティクス情報には、シナプス結合とは異なる階層の個体の記憶が格納されているという仮説を検証し老化などのマウスの経験が書き込まれていることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究の成果により、潜在変数モデルを用いた解析によりニューロンのエピジェネティクスに過去の経験が書き込まれていることが明らかとなった。そのため、エピゲノムを操作することにより、ストレスや疾患といった環境変化によるニューロンの状態を変化させ、脳機能を改善することができる可能性がある。今後は、ニューロンエピジェネティクスを用いた脳機能の回復について研究を進めていきたい。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2024 2023 2022 2020 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 4件、 招待講演 8件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Miyoshi G, Ueta Y, Yagasaki Y, Kishi Y, Fishell G, Machold RP, Miyata M2024

    • 著者名/発表者名
      Developmental trajectories of GABAergic cortical interneurons are sequentially modulated by dynamic FoxG1 expression level
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 121 号: 16

    • DOI

      10.1073/pnas.2317783121

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Frey T, Murakami T, Maki K, Kawaue T, Tani N, Sugai A, Nakazawa N, Ishiguro K, Adachi T, Kengaku M, Ohki K, Gotoh Y & Kishi Y2023

    • 著者名/発表者名
      Age-associated reduction of nuclear shape dynamics in excitatory neurons of the visual cortex
    • 雑誌名

      Aging Cell

      巻: 22 号: 9 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1111/acel.13925

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] HMGA2 directly mediates chromatin condensation in association with neuronal fate regulation2023

    • 著者名/発表者名
      Kuwayama Naohiro、Kujirai Tomoya、Kishi Yusuke、Hirano Rina、Echigoya Kenta、Fang Lingyan、Watanabe Sugiko、Nakao Mitsuyoshi、Suzuki Yutaka、Ishiguro Kei-ichiro、Kurumizaka Hitoshi、Gotoh Yukiko
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 6420-6420

    • DOI

      10.1038/s41467-023-42094-9

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] UTX deficiency in neural stem/progenitor cells results in impaired neural development, fetal ventriculomegaly, and postnatal death2022

    • 著者名/発表者名
      Koizumi M, Eto H, Saeki M, Seki M, Fukushima T, Mukai S, Ide H, Sera Y, Iwasaki M, Suzuki Y, Tohei A, Kishi Y, Honda H.
    • 雑誌名

      FASEB journal

      巻: 36(12) 号: 12 ページ: 22662-22662

    • DOI

      10.1096/fj.202201002rr

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Age-associated reduction of nuclear shape dynamics in excitatory neurons of the visual cortex2022

    • 著者名/発表者名
      Tanita Frey, Tomonari Murakami, Koichiro Maki, Takumi Kawaue, Ayaka Sugai, Naotaka Nakazawa, Taiji Adachi, Mineko Kengaku, Kenichi Ohki, Yukiko Gotoh, Yusuke Kishi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 504704-504704

    • DOI

      10.1101/2022.08.22.504704

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] In utero gene transfer system for embryos before neural tube closure reveals a role for Hmga2 in the onset of neurogenesis2020

    • 著者名/発表者名
      Naohiro Kuwayama, Yusuke Kishi*, Yurie Maeda, Yurie Nishiumi, Yutaka Suzuki, Haruhiko Koseki, Yusuke Hirabayashi, Yukiko Gotoh (*Correspondence)
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 086330-086330

    • DOI

      10.1101/2020.05.14.086330

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] ALTERATIONS IN TRANSCRIPTOME AND CHROMATIN ACCESSIBILITY OF NEURONAL SUBTYPES IN AGED HIPPOCAMPUS.2024

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic, Yukiko Gotoh, Yusuke Kishi
    • 学会等名
      第41回 染色体ワークショップ・第22回 核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 老齢脳における遺伝子発現の単一細胞プロファイルで明らかにするミクログリアの不均一 性2024

    • 著者名/発表者名
      菅井 彩香, Merve Bilgic, 後藤 由季子, 岸 雄介
    • 学会等名
      第41回 染色体ワークショップ・第22回 核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ニューロンにおけるエピゲノムの役割2024

    • 著者名/発表者名
      岸 雄介
    • 学会等名
      学術変革3領域(グリアデコード・臨界期生物学・適応回路センサス)合同シンポジウム「細胞多様性-回路多様性-機能多様性」
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The role of the epigenome in neuronal aging2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kishi, Mai Saeki, YukikoGotoh
    • 学会等名
      第46回日本神経科学大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ALTERATIONS IN TRANSCRIPTOME AND CHROMATIN ACCESSIBILITY OF NEURONAL SUBTYPES IN AGED HIPPOCAMPUS.2023

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic, Yukiko Gotoh, Yusuke Kishi
    • 学会等名
      第46回日本神経科学大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 老化脳における遺伝子発現の単一細胞プロファイルで明らかにするミクログリアの不均一性2023

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sugai, Merve Bilgic, Yukiko Gotoh, Yusuke Kishi
    • 学会等名
      第46回日本神経科学大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ニューロンの老化における抑制性エピゲノム変化の解析2023

    • 著者名/発表者名
      岸 雄介, 佐伯 麻衣, Merve Bilgic, 後藤 由季子
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ニューロンにおける核ダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      岸 雄介, Tanita Frey, 長田 侑, 牧 功一郎, 安達 泰治, 後藤 由季子
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 老化脳における遺伝子発現の単一細胞プロファイルで明らかにするミクログリアの不均一性2023

    • 著者名/発表者名
      菅井 彩香, Merve Bilgic, 後藤 由季子, 岸 雄介
    • 学会等名
      BioUT
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] The role of epigenome in neuronal aging2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Kishi, Mai Saeki, Yukiko Gotoh
    • 学会等名
      The 16th Annual Meeting and Korea-Japan Joint Meeting for Developmental Neuroscientists
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Analysis of complex brain development by single-cell transcriptome profiling of ferret neural progenitors2023

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic、Fumio Matsuzaki
    • 学会等名
      The 16th Annual Meeting and Korea-Japan Joint Meeting for Developmental Neuroscientists
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ニューロン老化におけるエピゲノムの役割の解明2022

    • 著者名/発表者名
      岸雄介、佐伯麻衣、Merve Bilgic、後藤由季子
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ニューロン老化におけるエピゲノムの役割2022

    • 著者名/発表者名
      岸雄介、佐伯麻衣、Merve Bilgic、後藤由季子
    • 学会等名
      新学術・学術変革領域合同若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ALTERATIONS IN TRANSCRIPTOME AND CHROMATIN ACCESSIBILITY OF NEURONAL SUBTYPES IN AGED HIPPOCAMPUS2022

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic、後藤由季子、岸雄介
    • 学会等名
      新学術・学術変革領域合同若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 老齢マイクログリアにおける転写プロファイルの不均一性の解析2022

    • 著者名/発表者名
      菅井彩香、Merve Bilgic、後藤由季子、岸雄介
    • 学会等名
      新学術・学術変革領域合同若手の会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Alterations in transcriptome and chromatin accessibility of neuronal subtypes in aged hippocampus2022

    • 著者名/発表者名
      Merve Bilgic、後藤由季子、岸雄介
    • 学会等名
      The Transcription, Chromatin, and Epigenetics in Aging Conference
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Dynamic changes in the chromatin and nuclear state during neuronal differentiation ニューロン分化過程におけるクロマチンと核の変化2022

    • 著者名/発表者名
      岸雄介、佐伯麻衣、後藤由季子
    • 学会等名
      55th Annual Meeting of the Japanese Society of Developomental Biologists
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nuclear morphology of cortical excitatory neurons is regulated by visual experience and aging2022

    • 著者名/発表者名
      Tanita M. Frey, Tomonari Murakami, Kenichi Ohki, Yukiko Gotoh, Yusuke Kishi
    • 学会等名
      Society for Neuroscience 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [備考] ニューロンの核は老化するとシワシワになり、かたくなる

    • URL

      https://www.iqb.u-tokyo.ac.jp/pressrelease/230725/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2022-07-05   更新日: 2025-01-30  

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