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蛋白質の構造機能要素の抽出と応用の為の基盤整備

研究課題

研究課題/領域番号 23370074
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

上久保 裕生  奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 准教授 (20311128)

研究分担者 片岡 幹雄  奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 教授 (30150254)
山崎 洋一  奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 助教 (40332770)
研究期間 (年度) 2011-11-18 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
2013年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワード蛋白質工学 / 分子設計 / フォールディング / 酵素
研究概要

蛋白質は最も多様性にとみ、高い機能性を示す分子である。ライフサイエンスの研究分野は言うに及ばず、近年では医薬品への応用などより身近な存在になりつつある。しかしながら、我々は未だ、蛋白質を自在に設計し、望みの機能を実現する手法を手にしていない。本研究では、蛋白質の基本部品(エレメント)の同定を試み、その応用可能性を検討してきた。その結果、エレメントの組み替えによって蛋白質の機能を自在に改変できる可能性を見いだすことに成功した。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (91件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (20件) (うち査読あり 18件) 学会発表 (70件) (うち招待講演 12件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Excited-State Proton Transfer in Fluorescent Photoactive Yellow Protein Containing 7-Hydroxycoumarin2014

    • 著者名/発表者名
      D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
    • 雑誌名

      Advanced Materials Research

      巻: 896 ページ: 85-88

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Theoretical analysis of the geometrical isotope effect on the hydrogen bonds in photoactive yellow protein with multi-component density functional theory2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Kita, H. Kamikubo, M. Kataoka, M. Tachikawa
    • 雑誌名

      Chem. Phys

      巻: 419 ページ: 50-53

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] (1)H, (13)C, and (15)N resonance assignment of photoactive yellow protein2013

    • 著者名/発表者名
      Pool TJ, Oktaviani NA, Kamikubo H, Kataoka M, Mulder FA
    • 雑誌名

      Biomol NMR Assign

      巻: 7(1) ページ: 97-100

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Preferential domain orientation of HMGB2 determined by the weak intramolecular interactions mediated by the interdomain linker2013

    • 著者名/発表者名
      J. Uewaki, H. Kamikubo, J. Kurita, N. Hiroguchi, H. Moriuchi, M. Yoshida, M. Kataoka, N. U.-Tate, S. Tate
    • 雑誌名

      Chem.Phys

      巻: 419 ページ: 212

    • DOI

      10.1016/j.chemphys.2013.02.004

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fingerprint signatures of lanthanide circularly polarized luminescence from proteins covalently labeled by a β -diketonate europium(III) chelate2013

    • 著者名/発表者名
      Junpei Yuasa
    • 雑誌名

      Chem. Commn.

      巻: 49 号: 41 ページ: 4604-4606

    • DOI

      10.1039/c3cc40331a

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular dissection of IZUMO1, a sperm protein essential for sperm-egg fusion2013

    • 著者名/発表者名
      Inoue N, Hamada D, Kamikubo H, Hirata K, Kataoka M, Yamamoto M, Ikawa M, Okabe M, Hagihara Y
    • 雑誌名

      Development

      巻: 140(15) 号: 15 ページ: 3221-3229

    • DOI

      10.1242/dev.094854

    • NAID

      120006957398

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Basis of α-Catenin Recognition by EspB from Enterohaemorrhagic E. coli Based on Hybrid Strategy Using Low-Resolution Structural and Protein Dissection2013

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhide Hamaguchi
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 8 ページ: 71618-71618

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0071618

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Excited-State Proton Transfer in Fluorescent Photoactive Yellow Protein Containing 7-Hydroxycoumarin2013

    • 著者名/発表者名
      Dian Novitasari
    • 雑誌名

      Advanced Materials Reserch

      巻: 896 ページ: 85-88

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Time-resolved observation of chiral-index-selective wrapping on single-walled carbon nanotube with non-aromatic polysilane2013

    • 著者名/発表者名
      Woojung Chung
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 135 ページ: 2374-2383

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 結晶構造解析と溶液散乱測定から見た光センサー蛋白質の局所構造と全体構造2013

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 55 ページ: 52-57

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] 働いているタンパク質の構造を実時間で見た!-次世代構造生物科学への期待2013

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 雑誌名

      化学

      巻: 68 ページ: 74-75

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Watching a signaling protein function in real time via 100-ps time-resolved Laue crystallography2012

    • 著者名/発表者名
      Schotte F, Cho HS, Kaila VR, Kamikubo H, Dashdorj N, Henry ER, Graber TJ, Henning R, Wulff M, Hummer G, Kataoka M, Anfinrud PA
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 109(47) ページ: 19256-61

    • NAID

      120005716810

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive determination of protein tyrosine pKa values for photoactive yellow protein using indirect 13C NMR spectroscopy2012

    • 著者名/発表者名
      Oktaviani NA, Pool TJ, Kamikubo H, Slager J, Scheek RM, Kataoka M, Mulder FA
    • 雑誌名

      Biophys J. 2012 Feb

      巻: 8 ページ: 579-86

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Theoretical analysis of the geometrical isotope effect on the hydrogen bonds in photoactive yellow protein with multi-component density functional theory2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Kita, H. Kamikubo, M. Kataoka, M. Tachikawa
    • 雑誌名

      Chem. Phys

      巻: 419 ページ: 50-53

    • DOI

      10.1016/j.chemphys.2012.11.022

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for Arf6–MKLP1 complex formation on the Flemming body responsible for cytokinesis2012

    • 著者名/発表者名
      Hisayoshi Makyio
    • 雑誌名

      EMBO J.

      巻: 31 ページ: 2590-2603

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Watching a signaling protein function in real time via 100-ps time-resolved Laue crystallography2012

    • 著者名/発表者名
      Friedrich Schotte
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 109 ページ: 19256-19261

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Maintenance of the secondary structure of horse cytochrome c during the conversion process of monomers to oligomers by addition of ethanol2012

    • 著者名/発表者名
      Shun Hirota
    • 雑誌名

      J. Biochem.

      巻: 152 ページ: 521-529

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Changes in the hydrogen-bond network around the chromophore of photoactive yellow protein in the ground and excited states2011

    • 著者名/発表者名
      Mizuno M, Kamikubo H, Kataoka M, Mizutani Y
    • 雑誌名

      J Phys Chem B

      巻: 115(29) ページ: 9306-10

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Changes in the hydrogen-bond network around the chromophore of photoactive yellow protein in the ground and excited states2011

    • 著者名/発表者名
      Misao Mizuno
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 115 ページ: 9306-9310

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive determination of protein tyrosine pKa values for photoactive yellow protein using indirect 13C NMR spectroscopy2011

    • 著者名/発表者名
      Nur Alia Oktaviani
    • 雑誌名

      Biophys. J.

      巻: 102 ページ: 579-586

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module2014

    • 著者名/発表者名
      Hironari Kamikubo
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Interaction sites analysis for the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsulatus2014

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Yamazaki
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Local disordered structure of staphylococcal nuclease studied by tryptophan triplet state lifetime measurement2014

    • 著者名/発表者名
      Mariko Yamaguchi
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Loop dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale2014

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Matsumoto
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Local flexibility around tryptophan140 and its relationship to non-local interaction in disordered staphylococcal nuclease2014

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Minemura
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Extraction of function elements from green fluorescent protein2014

    • 著者名/発表者名
      Toshio Morimoto
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Protonation state of R52 at the pypm intermediate state2014

    • 著者名/発表者名
      Masayoshi Noji
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of2014

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Matsumoto
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of Equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins2014

    • 著者名/発表者名
      Yoshiaki Matsumoto
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Statistical characteristics of unfolded staphylococcal nuclease studied by FRET analysis2014

    • 著者名/発表者名
      Emi Ohta
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme2014

    • 著者名/発表者名
      Mai Arakawa
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 溶液散乱を用いた多成分平衡系における構造解析2014

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      Spring-8ワークショップ「Spring-8とユーザーのさらなる連携をめざして」
    • 発表場所
      理化学研究所播磨事業所、兵庫県佐用町
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Functional modification of a protein by using element implantaion2013

    • 著者名/発表者名
      H. Kamikubo
    • 学会等名
      Sixth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences : Experiments and Simulations
    • 発表場所
      Okazaki, Japan
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] The mechanism of induced folding of Staphylococcal nuclease2013

    • 著者名/発表者名
      M. Kataoka
    • 学会等名
      Telluride Conference on Protein Dynamics 2013
    • 発表場所
      Telluride, USA
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Is tertiary structure required for a specific function?2013

    • 著者名/発表者名
      M. Kataoka
    • 学会等名
      8th Asian Biophysics Association Symposium
    • 発表場所
      Jeju, Korea
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Photoactive Yellow Protein中の低障壁水素結合と近傍アルギニンの解離性2013

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館、鳥取県鳥取市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来核酸分解酵素におけるループの揺らぎと機能の関係2013

    • 著者名/発表者名
      芝るみ
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館、鳥取県鳥取市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X線溶液散乱法を用いたタンパク質構造の解析2013

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      分子・物質合成プラットフォーム技術研修会-先端施設の利用機会と高度な技術支援の提供-
    • 発表場所
      ホテル京阪 京都、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Excited-state proton transfer in fluorescent Photoactive Yellow Protein containing 7-hydroxycoumarin2013

    • 著者名/発表者名
      Dian Novitasari
    • 学会等名
      International Conference on Advanced Materials Science and Technology 2013
    • 発表場所
      University Gadjah Mada, Yogyakarta, Indonesia
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トリプトファン三重項寿命を用いたStaphylococcal nucleaseの主鎖の運動性評価2013

    • 著者名/発表者名
      松本昇紘
    • 学会等名
      日本物理学会 2013年秋季大会
    • 発表場所
      徳島大学、常三島キャンパス、徳島県徳島市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Time-resolved Laue crystallography of photoactive yellow protein with 150psec time resolution2013

    • 著者名/発表者名
      Mikio Kataoka
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Domain-Swapped Oligomerization and Molten Globule State of Cytochrome c2013

    • 著者名/発表者名
      Megha Deshpande
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus2013

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Yamazaki
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity2013

    • 著者名/発表者名
      Rumi Shiba
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Exited State Proton Transfer of Fluorescent Photoactive Yellow Protein Reconstituted with Hydroxycoumarin2013

    • 著者名/発表者名
      Dian Novitasari
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein2013

    • 著者名/発表者名
      Kento Yonezawa
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X-ray Solution Scattering Studies of PYP-Phytochrome Related Protein2013

    • 著者名/発表者名
      Keito Yoshida
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of unfolded structure of Staphylococcal nuclease mutants by using FRET2013

    • 著者名/発表者名
      Emi Ohta
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Main-chain dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale2013

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Matsumoto
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Local flexibility of denatured structure and its relationship to non-local interaction in staphylococcal nuclease2013

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Minemura
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme2013

    • 著者名/発表者名
      Mai Arakawa
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Matsumoto
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Yoshiaki Matsumoto
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Protonation state of R52 at the PYPM intermediate state2013

    • 著者名/発表者名
      Masayoshi Noji
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Functional modification of a protein by using element implantation2013

    • 著者名/発表者名
      Hironari Kamikubo
    • 学会等名
      Sixth Korea-Japan Seminars on Biomdecular Sciences; Experiments and Simulations
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンタ-、愛知県岡崎市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 弱い相互作用で関連づけられたタンパク質分子集団の構造学的解析

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」2013年度第1回研究会プログラム
    • 発表場所
      国際高等研究所、京都府木津川市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 光センサー蛋白質の局所状態変化と全体構造変化

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      第3回CIMoSセミナー
    • 発表場所
      分子科学研究所協奏分子システム研究センター、愛知県岡崎市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光センサー蛋白質からみた階層間の連続性

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」2013年度第2回研究会プログラム
    • 発表場所
      国際高等研究所、京都府木津川市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 折り畳み機構を踏まえた蛋白質分子設計方の開発

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      NAIST未来開発コロキウム-明日をつくる分子・人材ネットワーク
    • 発表場所
      奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科、奈良県生駒市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 機能を生み出す単位生体分子集団

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      生命システムにおける動的秩序形成と高次機能発現 第1回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンタ-、愛知県岡崎市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Extraction of Function Elements from Green Fluorescent Protein

    • 著者名/発表者名
      Toshio Morimoto
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館、京都府京都市
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Element-based molecular design can reproduce an artificial protein with an expected enzymatic activity

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 網羅的アラニン挿入変異解析法を用いたジヒドロ葉酸還元酵素の機能発現及び構造形成領域の抽出

    • 著者名/発表者名
      芝るみ
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity

    • 著者名/発表者名
      Rumi Shiba
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Amyloid fibril inhibition mechanism of human calcitonin

    • 著者名/発表者名
      Naoharu Kouduki
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The role of hydrogen bonding network around the chromophore for the interaction of Rc-PYP

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Yamazaki
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Effect of N-terminal region to the structure formation of PYP

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Sakonji
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus with chimeric proteins

    • 著者名/発表者名
      Mayu Shimada
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Roles of hydrogen bonds around chromophore in Photoactive Yellow Protein studied by OH-deficient cinnamic acid

    • 著者名/発表者名
      Masatoshi Narumi
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Photoreaction of PYP domain regulates the structural change during the photoreaction of phytochrome domain of Ppr

    • 著者名/発表者名
      Keito Yoshida
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Protonation state of arginine 52 near the low barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein

    • 著者名/発表者名
      Kento Yonezawa
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity

    • 著者名/発表者名
      Rumi Shiba
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Fluorescence properties of chromophore fluorescence properties of chromophore modified photoactive yellow protein

    • 著者名/発表者名
      Dian Novitasari
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The comparison of fluorescent spectra between wild type staphylococcal nuclease and the mutants based on FRET

    • 著者名/発表者名
      Emi Ohta
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Amyloid fibril inhibition mechanism of human calcitonin

    • 著者名/発表者名
      Naoharu Kohzuki
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Extraction of the structure elements from PYP

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Sakonji
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus with chimeric proteins

    • 著者名/発表者名
      Mayu Shimada
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Roles of hydrogen bonds around chromophore in Photoactive Yellow Protein studied by OH-deficient cinnamic acid

    • 著者名/発表者名
      Masatoshi Narumi
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural analysis of PYP-Phytochrome Related Protein during its photoreaction by using small angle X-ray scattering

    • 著者名/発表者名
      Keito Yoshida
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] イェロープロテインの光反応中の構造変化を見る

    • 著者名/発表者名
      片岡幹雄
    • 学会等名
      日本物理学会第68回年次大会
    • 発表場所
      広島県東広島市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 変性剤がスタフィロコッカルヌクレアーゼの変性構造に与える影響

    • 著者名/発表者名
      山口真理子
    • 学会等名
      日本物理学会第68回年次大会
    • 発表場所
      広島県東広島市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 中性子小角中角散乱で観測した水溶液中のStaphylococcal Nucleaseの構造

    • 著者名/発表者名
      遠藤仁
    • 学会等名
      日本物理学会第68回年次大会
    • 発表場所
      広島県東広島市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Physicochemical properties of low barrier hydrogen bonds

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      特定領域研究「分子高次系機能解明のための分子科学」第5回国際公開シンポジウム
    • 発表場所
      北海道札幌市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 蛋白質中の低障壁水素結合と高次構造転移

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      九重分光関連夏期セミナー2011
    • 発表場所
      大分県玖珠郡九重町
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 構造生物学における放射光X線溶液散乱

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      合同PF研究会「PFにおけるマイクロビームを利用した XAFS, XRF, SAXS実験の展望」
    • 発表場所
      茨城県つくば市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 活性部位近傍に存在する水素結合と高次構造転移

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      特定領域研究「高次系分子科学」第12回ミニ公開シンポジウム「光受容蛋白質」
    • 発表場所
      愛知県蒲郡市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The roles of the low barrier hydrogen bond involved in Photoactive Yellow Protein

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      17th International Biophysics Congress (IUPAB)
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Physicochemical properties of low barrier hydrogen bonds involved in proteins

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      2011 GIST-NAIST-NCTU Joint Symposium on Advanced Materials
    • 発表場所
      Gwangju, Korea
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Physicochemical properties of low barrier hydrogen bonds involved in Photoactive Yellow Protein

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      1st Asia-Oceania Conference on Neutron Scattering
    • 発表場所
      茨城県つくば市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The Roles of the Low Barrier Hydrogen Bond Involved in the Light Sensor Protein, Photoactive Yellow Protein

    • 著者名/発表者名
      上久保裕生
    • 学会等名
      The 5th International Symposium on Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      奈良県奈良市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://mswebs.naist.jp/LABs/kataoka/

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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