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ミトコンドリアをもたない真核微生物群フォルニカータの多様性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23405013
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 生物多様性・分類
研究機関筑波大学

研究代表者

橋本 哲男  筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451)

研究分担者 石田 健一郎  筑波大学, 生命環境系, 教授 (30282198)
稲垣 祐司  筑波大学, 生命環境系, 准教授 (50387958)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
19,240千円 (直接経費: 14,800千円、間接経費: 4,440千円)
2013年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
2011年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
キーワードフォルニカータ / 嫌気・微好気環境 / 退化型ミトコンドリア / 新奇真核微生物 / 培養株 / 多様性調査 / 嫌気環境 / 系統進化 / ミトコンドリア関連オルガネラ / 嫌気真核微生物 / ミトコンドリアをもたない真核微生物
研究概要

フォルニカータ生物群は嫌気環境に生育する鞭毛虫からなる系統群であり、環境DNA解析から多様な生物種の存在が示唆されている。これまでに調べられたいずれの生物も、酸素呼吸を行う典型的なミトコンドリアをもたず退化型のミトコンドリアをもっているため、ミトコンドリアの縮退進化を解明する上で適切なモデル系と考えられる。しかしながら、実際に単離・培養されているフォルニカータ生物の種類は必ずしも多くないため、自然環境中から新奇フォルニカータ生物を見出すことを目的として研究を行った。これまでに数種のフォルニカータ生物を含む10種以上の新規嫌気性真核微生物の単離・培養株化に成功し、一部については記載を行った。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (12件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Palpitomonas bilix presents a basal cryptist lineage : insight into the char acter evolution in Cryptista2014

    • 著者名/発表者名
      Yabuki A, Kamikawa R, Sohta A. Ishikawa, Kolisko M, Kim E, Tanabe AS, Kume K, Ishida K, Inagaki Y
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 第4巻 号: 1 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1038/srep04641

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Gene-content evolution in discobid mitochondria deduced from the phylogenetic position and complete mitochondrial genome of Tsukubamonas globosa2014

    • 著者名/発表者名
      Kamikawa R, Kolisko M, Nishimura Y, Yabuki A, Brown MW, Ishikawa SA, Ishida K, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 6 ページ: 306-315

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gene-content evolution in discobid mitochondria deduced from the phylogenetic position and complete mitochondrial genome of Tsukubamonas globosa.2014

    • 著者名/発表者名
      Kamikawa R, Kolisko M, Nishimura Y, Yabuki A, rown MW, Sohta A. Ishikawa, Ishida K, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 第6巻2号 号: 2 ページ: 306-315

    • DOI

      10.1093/gbe/evu015

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Parallel re-modeling of EF-la function in eukaryotic evolution : Divergent, low-expressed EF-1α genes co-occur with EFL genes in diverse distantly related eukaryotes.2013

    • 著者名/発表者名
      Kamikawa R, Brown MW, Nishimura Y, Sako Y, Heiss AA, Yubuki N, Gawryluk R, Simpson AGB, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y
    • 雑誌名

      BMC Evolutionary Biology

      巻: 13 号: 1 ページ: 131-131

    • DOI

      10.1186/1471-2148-13-131

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multigene phylogenies of diverse Carpediemonas-like organisms identify the closest relatives of 'amitochndriate' diplomonads and retortamonads2012

    • 著者名/発表者名
      Takishita K, Kolisko M, Komatsuzaki H, Yabuki A, Inagaki Y, Cepicka I, Smejkalova P, Silberman JD, Hashimoto T, Roger AJ, Simpson AGB
    • 雑誌名

      Protist

      巻: 163 ページ: 344-355

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Separate origins of group I introns in two mitochondrial genes of the katablepharid Leucocryptos marina.2012

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Y, Kamikawa R, Hashimoto T, Inagaki Y.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 7 号: 5 ページ: e37307-e37307

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0037307

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RY-coding and non-homogeneous models can ameliorate the maximum-likelihood inferences from nucleotide sequence data with parallel compositional heterogeneity2012

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa SA, Inagaki Y, Hashimoto T
    • 雑誌名

      Evolutionary Bioinformatics

      巻: 8 ページ: 357-371

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multigene phylogenies of diverse Carpediemonas-like organisms identify the closest relatives of 'amitochndriate' diplomonads and retortamonads2012

    • 著者名/発表者名
      Takishita K, Kolisko M, Komatsuzaki H, Yabuki A, Inagaki Y, Cepicka I, Smejkalova P, Silberman JD, Hashimoto T, Roger AJ, Simpson AGB.
    • 雑誌名

      Protist

      巻: 163 号: 3 ページ: 344-355

    • DOI

      10.1016/j.protis.2011.12.007

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Separate origins of group I introns in two mitochondrial genes of the katablepharid Leucocryptos marina2012

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Y^*, Kamikawa R^*, Hashimoto T, Inagaki Y (* equalcontribution)
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: (In press)(印刷中)

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 生命の樹-昔と今2013

    • 著者名/発表者名
      橋本哲男
    • 学会等名
      日本進化学会第15回大会進化生物学夏の学校
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2013-08-31
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] A novel endomyxan amoeboflagellate isolated from Pasific ocean2013

    • 著者名/発表者名
      Shiratori T, Ishida K
    • 学会等名
      International Congress of Protistology (ICOP) XIV
    • 発表場所
      Vancouver, Canada
    • 年月日
      2013-07-28
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 嫌気性寄生原虫におけるエネルギー代謝関連酵素の分子進化2013

    • 著者名/発表者名
      橋本哲男, 神川龍馬, 林奈々子, 稲垣祐司
    • 学会等名
      第82回日本寄生虫学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2013-03-29
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] A novel endomyxan amoeboflagellate isolated from Pacific Ocean2013

    • 著者名/発表者名
      Shiratori T. and Ishida K
    • 学会等名
      International Congress of Protistology (ICOP) XIV
    • 発表場所
      Vancouver, Canada
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 嫌気環境に適応したフォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラのトランスクリプトーム比較解析2012

    • 著者名/発表者名
      神 川龍馬, Kolisko M, Andersson J, Simpson AGB, Roger AJ, 稲垣祐司, 橋本哲男
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラの縮退進化-ハイドロジェノソームからマイトソームへ.2012

    • 著者名/発表者名
      神 川龍馬, Kolisko M, Andersson J, Simpson AGB, Roger AJ, 稲垣祐司, 橋本哲男
    • 学会等名
      第72回日本寄生虫学会東日本支部会・第10回分子寄生虫マラリアフォーラム合同大会
    • 発表場所
      前橋
    • 年月日
      2012-10-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] A new strategy of organellar genome sequencing incorporating rolling circle amplification : protist mitochondria genomes2012

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Y, Kamikawa R, Inagaki Y, Hashimoto T
    • 学会等名
      Protist 2012
    • 発表場所
      Oslo
    • 年月日
      2012-07-29
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] A new strategy of organellar genome sequencing incorporating rolling circle amplification: protist mitochondria genomes2012

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Y
    • 学会等名
      Protist 2012
    • 発表場所
      Oslo (ノルウェー)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Molecular phylogeny of the amitochondriate lineage, Fornicata, based on multi-gene analysis (poster)2011

    • 著者名/発表者名
      Komatsuzaki H, Takishita K, Kolisko M, Yabuki A, Roger AJ, Simpson AGB, Inagaki Y, Hashimoto T
    • 学会等名
      SMBE2011
    • 発表場所
      京都大学,京都
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 新奇生物種の単離と大規模分子系統解析が解明(?)する真核生物の多様性と系統関係

    • 著者名/発表者名
      稲垣祐司
    • 学会等名
      お茶の水大学大学院生命情報学副専攻 公開セミナー 第39回バイオインフォマティックスへの招待
    • 発表場所
      東京, お茶の水女子大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生命の樹―昔と今

    • 著者名/発表者名
      橋本哲男
    • 学会等名
      日本進化学会 進化生物学夏の学校
    • 発表場所
      つくば, 筑波大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 嫌気性寄生原虫におけるエネルギー代謝関連タンパク質の分子進化

    • 著者名/発表者名
      橋本哲男
    • 学会等名
      第82回日本寄生虫学会大会
    • 発表場所
      東京医科歯科大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2019-07-29  

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