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金属イオン結合およびレドックス制御における亜鉛フィンガータンパク質の構造と機能

研究課題

研究課題/領域番号 23510266
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生物分子科学
研究機関同志社女子大学

研究代表者

根木 滋  同志社女子大学, 薬学部, 助教 (50378866)

研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2011年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワード亜鉛フィンガー / 転写因子 / 金属結合 / DAN結合 / レドックス / SELEX法 / タンパク質工学 / 蛋白質 / DNA / 人工蛋白質 / 人工ヌクレアーゼ / 酸化還元 / 金属イオン / DNA結合 / シグナル伝達 / レドックスセンサー / 金属置換 / 細胞移行 / 分子進化実験 / レドックス挙動 / DNA結合 / 無細胞系タンパク質発現
研究概要

本研究では、GAGA亜鉛フィンガーを用いてCo(II)およびNi(II)金属置換体を作成し、構造、DNA結合能および酸化反応性について検討を行った。その結果、いずれの金属置換体も野生型に近い配位および二次構造を形成していることが分かった。また、金属置換体は野生型のDNA配列に結合することが明らかとなった。また、ジアミドを用いた酸化反応を行った結果、反応性がアポ体>Ni(II)≫Co(II)>Zn(II)となり、金属の種類に大きく反応性が依存することが明らかとなった。この反応性の違いは、配位結合の安定性やドメインの安定性の違いに依存すると考えられる。

報告書

(5件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果発表報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (10件) (うち招待講演 2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Zn(II) binding and DNA binding properties of ligand-substituted CXHH-type zinc finger proteins2012

    • 著者名/発表者名
      M. Imanishi, K. Matsumura , S. Tsuji , T. Nakaya, S. Negi, S. Futaki, Y. Sugiura
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: Vol.24 ページ: 3342-3348

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational design of DNA sequence-specific zinc fingers2012

    • 著者名/発表者名
      H. Kono, M. Imanishi, S. Negi, K. Tatsutani, Y. Sakaeda, A. Hashimoto, C. Nakayama, S. Futaki, Y. Sugiura
    • 雑誌名

      FEBS Lett

      巻: Vol.586 ページ: 918-923

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Zn(II) binding and DNA binding properties of ligand-substituted CXHH-type zinc finger proteins2012

    • 著者名/発表者名
      M.Imanishi
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 51 号: 16 ページ: 3342-3348

    • DOI

      10.1021/bi300236m

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational design of DNA sequence-specific zinc fingers.2012

    • 著者名/発表者名
      Kono H, Imanishi M, Negi S, Tatsutani K, Sakaeda Y, Hashimoto A, Nakayama C, Futaki S, Sugiura Y.
    • 雑誌名

      FEBS letters

      巻: 586 号: 6 ページ: 918-923

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2012.02.025

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An arginine residue instead of a conserved leucine residue in the recognition helix of the finger 3 of Zif268 stabilizes the domain structure and mediates DNA binding2011

    • 著者名/発表者名
      S. Negi, M. Imanishi, M. Sasaki, K. Tatsutani, S. Futaki, Y. Sugiura
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: Vol 50 ページ: 6266-6272

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational design of DNA sequence-specific zinc fingers2011

    • 著者名/発表者名
      Kono H, Imanishi M, Negi S, Tatsutani K, Sakaeda Y, Hashimoto A, Nakayama C, Futaki S, Sugiura Y.
    • 雑誌名

      FEBS letters.

      巻: 586巻 ページ: 918-923

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rational design of DNA sequence-specific zinc fingers2011

    • 著者名/発表者名
      SHIGERU NEGI
    • 雑誌名

      FEBS letters.

      巻: 586 ページ: 918-923

    • 関連する報告書
      研究成果発表報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] GAGA metallo finger peptides; Its metal-binding, DNA-binding and Redox properties2013

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Negi, Sugiura Yukio
    • 学会等名
      International conference on biological inorganic chemistry (ICBIC 16)
    • 発表場所
      Grenoble (France)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Control of DNA Binding of Transcription Factors by an Porphyrin-Cyclodextrin Supramolecular Complex2012

    • 著者名/発表者名
      S. Negi, T. Ogasawara, H. Iede, Y. Sugiura
    • 学会等名
      International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines (ICCP7)
    • 発表場所
      国際コンベンションセンター(ICC)済州(Jeju, Korea)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] GAGA Metallofinger Peptides: Its Metal-binding, DNA-binding and Redox Properties2012

    • 著者名/発表者名
      S. Negi, Y. Sugiura
    • 学会等名
      The 6th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC-VI)
    • 発表場所
      Polytechnic University(Hong Kong)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Study on cell penetrating of GAGA zinc finger protein2011

    • 著者名/発表者名
      SHIGERU NEGI
    • 学会等名
      22^<nd> American Peptide Symposium
    • 発表場所
      Sheraton San Diego Hotel and Marina San Diego, CA(米国)
    • 年月日
      2011-06-28
    • 関連する報告書
      研究成果発表報告書
  • [学会発表] Redesign strategy to create of artificial zinc finger proteins2011

    • 著者名/発表者名
      SHIGERU NEGI
    • 学会等名
      22^<nd> American Peptide Symposium
    • 発表場所
      Sheraton San Diego Hotel and Marina San Diego, CA(米国)
    • 年月日
      2011-06-26
    • 関連する報告書
      研究成果発表報告書
  • [学会発表] Redesign strategy to create of artificial zinc finger proteins2011

    • 著者名/発表者名
      Negi S, Sugiura Y.
    • 学会等名
      22nd American Peptide Symposium
    • 発表場所
      Sheraton San Diego Hoteland Marina (USA)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Study on cell penetrating of GAGA zinc finger protein2011

    • 著者名/発表者名
      Negi S, Terada Y. Negi S.
    • 学会等名
      22nd American Peptide Symposium
    • 発表場所
      Sheraton San Diego Hoteland Marina (USA)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] GAGA metallo finger peptides; Its metal-binding, DNA-binding and Redox properties

    • 著者名/発表者名
      Shigeru Negi, Yukio Sugiura
    • 学会等名
      International conference on biological inorganic chemistry (ICBIC 16)
    • 発表場所
      Grenoble
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 亜鉛フィンガータンパク質の新しい機能に関する研究

    • 著者名/発表者名
      根木 滋、 杉浦 幸雄
    • 学会等名
      第50回同志社大学理工学研究所研究発表会、2012年度学内研究センター合同シンポジウム
    • 発表場所
      同志社大学(京都府)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 亜鉛フィンガータンパク質の最近の研究動向および今後の展開

    • 著者名/発表者名
      根木 滋、 杉浦 幸雄
    • 学会等名
      ナノ・バイオサイエンス研究センターstart-up講演会
    • 発表場所
      同志社大学(京都府)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考]

    • URL

      http://research-bd.dwc.doshisha.ac.jp/rd/html/japanese/researchersHtml/2718/2718_Researcher.html

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 同志社女子大学 研究者データベース

    • URL

      http://research-db.dwc.doshisha.ac.jp/rd/html/japanese/index.html

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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