ＴＡＭ受容体チロシンキナーゼのリガンド認識機構の解明と創薬に向けた分子基盤

• 研究課題/領域番号: 23570146
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 永田 崇 京都大学, エネルギー理工学研究所, 准教授 (10415250)
• 研究分担者: 高橋 栄夫 横浜市立大学, その他の研究科, 教授 (60265717)
• 研究期間 (年度): 2011-04-28 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2012年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2011年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
• キーワード: TAM受容体 / NMR / 糖鎖修飾

研究成果の概要

TAM受容体チロシンキナーゼは多様な細胞機能と疾患に関わっている。そのうちTyro3とMerについて、糖鎖修飾が施される酵母K.lactisを用いた各種試料調製方法、安定同位体標識化方法、糖鎖修飾の分析方法、相互作用解析法、各種NMR法の整備を行った。さらに、これらの方法を用いてTyro3とMerについて糖鎖修飾が構造と機能に与える影響を調べた。また、標的タンパク質に対して強く結合する分子の取得及び評価を行うための手段も得た。本研究成果をもとに、今後はTAM受容体の機能発現について立体構造ベースの知見と、TAM受容体とリガンドまたは薬剤候補分子の分子認識機構の解明に向けた研究を展開させていく。

研究成果

• [雑誌論文] Boosting of activity enhancement of K+-responsive quadruplex hammerhead ribozyme (2015)
  • 著者名/発表者名: Yudai Yamaoki, Tsukasa Mashima, Takashi Nagata and Masato Katahira
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 51 号: 27 ページ: 5898-5901
  • DOI: 10.1039/c5cc00961h
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Catalytic analysis of APOBEC3G involving real-time NMR spectroscopy reveals nucleic acid determinants for deamination (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Kamba, T. Nagata, M. Katahira
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 10 号: 4 ページ: e0124142-e0124142
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0124142
  • NAID: 120005668069
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Binding of an RNA aptamer and a partial peptide of a prion protein: crucial importance of water entropy in molecular recognition (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Hayashi, H. Oshima, T. Mashima, T. Nagata, M. Katahira, M. Kinoshita
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 42 号: 11 ページ: 6861-6875
  • DOI: 10.1093/nar/gku382
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural basis for inhibition of the MDM2:p53 interaction by an optimized MDM2-binding peptide selected with mRNA display (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Nagata, K. Shirakawa, N. Kobayashi, H. Shiheido, N. Tabata, Y. Sakuma-Yonemura, K. Horisawa, M. Katahira, N. Doi, H. Yanagawa
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9 号: 10 ページ: e109163-e109163
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0109163
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Quantitative analysis of location- and sequence-dependent deamination by APOBEC3G using real-time NMR spectroscopy (2014)
  • 著者名/発表者名: Furukawa, A., Sugase, K., Morishita, R., Nagata, T., Kodaki, T., Takaori-Kondo, A., Ryo, A., Katahira, M.
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 巻: 53 号: 9 ページ: 2349-2352
  • DOI: 10.1002/anie.201309940
  • NAID: 120005647511
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structure-based approach to improve a small-molecule inhibitor by the use of a competitive peptide ligand. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ono K, Takeuchi K, Ueda H, Morita Y, Tanimura R, Shimada I, Takahashi H.
  • 雑誌名: Angew Chem Int Ed Engl 巻: 53 号: 10 ページ: 2597-2597
  • DOI: 10.1002/anie.201310749
  • 査読あり
• [雑誌論文] 1H, 13C, and 15N resonance assignments of the dsRBDs of mouse RNA helicase A (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Nagata T, Kengo Tsuda, Naohiro Kobayashi, Peter Guntert, Shigeyuki Yokoyama, and Yutaka Muto
  • 雑誌名: Biomolecular NMR Assignment 巻: 7巻 号: 1 ページ: 69-72
  • DOI: 10.1007/s12104-012-9380-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid identification of ligand-binding sites by using an assignment-free NMR approach (2013)
  • 著者名/発表者名: Kodama Y, Takeuchi K, Shimba N, Ishikawa K, Suzuki E, Shimada I, Takahashi H.
  • 雑誌名: J Med Chem 巻: 56 号: 22 ページ: 9342-9350
  • DOI: 10.1021/jm4014357
  • 査読あり
• [雑誌論文] Perdeuteration and methyl-selective (1)H, (13)C-labeling by using a Kluyveromyces lactis expression system (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyazawa-Onami M, Takeuchi K, Takano T, Sugiki T, Shimada I, Takahashi H.
  • 雑誌名: J Biomol NMR 巻: 57 号: 3 ページ: 297-304
  • DOI: 10.1007/s10858-013-9789-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMRでリガンド分子の活性部位を探索する (2013)
  • 著者名/発表者名: 高橋栄夫
  • 雑誌名: 化学 巻: 68 ページ: 39-43
• [雑誌論文] Anti-prion activity of an RNA aptamer and its structural basis (2013)
  • 著者名/発表者名: Mashima, T., Nishikawa, F., Kamatari Y. O., Fujiwara, H., Saimura, M., Nagata, T., Kodaki, T., Nishikawa, S., Kuwata, K., Katahira, M.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 41 号: 2 ページ: 1355-1362
  • DOI: 10.1093/nar/gks1132
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR study of xenotropic murine leukemia virus-related virus protease in a complex with amprenavir (2012)
  • 著者名/発表者名: Ayako Furukawa, Hideyasu Okamura, Ryo Morishita, Satoko Matsunaga, Naohiro Kobayashi, Takahisa Ikegami, Tsutomu Kodaki, Akifumi Takaori-Kondo, Ryo Akihide, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: 24巻 号: 2 ページ: 284-289
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.07.083
  • NAID: 120004873605
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR study of ligand release from asialoglycoprotein receptor under solution conditions in early endosomes (2012)
  • 著者名/発表者名: Onizuka T, Shimizu H, Moriwaki Y, Nakano T, Kanai S, Shimada I, Takahashi H.
  • 雑誌名: FEBS J 巻: 279 号: 15 ページ: 2645-2656
  • DOI: 10.1111/j.1742-4658.2012.08643.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Basis for the Golgi Association by the Pleckstrin Homology Domain of the Ceramide Trafficking Protein (CERT) (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Sugiki, K. Takeuchi, T. Yamaji, T. Takano, Y. Tokunaga, K. Kumagai, K. Hanada, H. Takahashi, and I. Shimada
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 287 ページ: 33706-33718
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of Musashi1 in a complex with target RNA : The role of aromatic stacking interactions (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohyama, T., Nagata, T., Tsuda, K., Kobayashi, N., Imai, T., Okano, H., Yamazaki, T. and Katahira, M
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 10 号: 7 ページ: 3218-3231
  • DOI: 10.1093/nar/gkr1139
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intelligent ribozyme that switches its activity in response to K^+ through quadruplex formation (2012)
  • 著者名/発表者名: Nagata, T., Sakurai, Y., Hara, Y., Mashima, T., Kodaki, T., Katahira, M.
  • 雑誌名: FEBS Journal 巻: (印刷中) 号: 8 ページ: 1456-1463
  • DOI: 10.1111/j.1742-4658.2012.08538.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solution structures of the double-stranded RNA-binding domains from rna helicase A (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Nagata, Kengo Tsuda, Naohiro Kobayashi, Mikako Shirouzu, Takanori, Kigawa, Peter Guntert, Shigeyuki Yokoyama, and Yutaka Muto
  • 雑誌名: Proteins 巻: 80巻 号: 6 ページ: 1699-1706
  • DOI: 10.1002/prot.24059
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isotopic labeling of heterologous proteins in the yeast Pichia pastoris and Kluyveromyces lactis (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Sugiki, O. Ichikawa, M. Miyazawa-Onami, I. Shimada, and H. Takahashi
  • 雑誌名: Methods in Molecular Biology (Protein NMR techniques 3rd edit.) 巻: 831 ページ: 19-36
• [雑誌論文] An accurate pharmacophore mapping method by NMR spectroscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Mizukoshi, A. Abe, T. Takizawa, H. Hanzawa, Y. Fukunishi, I. Shimada, and H. Takahashi
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 51 巻: 51 ページ: 1362-1365
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid identification of protein?protein interfaces for the construction of a complex model based on multiple unassigned signals by using time-sharing NMR measurements (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Kodama, M. L. Reese, N. Shimba, K. Ono, E. Kanamori, V. Dotsch, S. Noguchi, Y. Fukunishi, E. Suzuki, I. Shimada and H. Takahashi
  • 雑誌名: J. Struct. Biol. 巻: 174 ページ: 434-442
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein-ligand docking guided by ligand pharmacophore-mapping experiment by NMR (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Fukunishi, Y. Mizukoshi, K. Takeuchi, I. Shimada, H. Takahashi, and H. Nakamura
  • 雑誌名: J. Mol. Graph. Mod. 巻: 31 ページ: 20-27
  • 査読あり
• [雑誌論文] Affinity transfer to a human protein by CDR3 grafting of camelid VHH (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Inoue, A. Iihara, H. Takahashi, I. Shimada, I. Ishida, and Y. Maeda
  • 雑誌名: Protein Sci. 巻: 20 ページ: 1971-1981
  • 査読あり
• [学会発表] CCND1転写抑制とテロメア短縮をもたらすTLS/FUSによる非コードRNAとDNA認識機構のNMR法による解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 近藤敬子，真嶋司，山置佑大，大吉崇文，黒川理樹，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 神経系幹細胞の未分化状態維持と発癌に関わるMusashi1タンパク質RBD2の構造機能解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩岡諒，小林直宏，津田健吾，今井貴雄，岡野栄之，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 実時間NMR法による抗HIV因子APOBEC3Gのスライディングにカップルした脱アミノ化機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] AML1 Runt domainとRNAアプタマーの相互作用のNMR解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 高田健多，天野亮，永田崇，片平正人，野村祐介，田中陽一郎，中村義一，神津知子，坂本泰一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Deamination mechanism of an anti-HIV APOBEC3G coupled with sliding on single-stranded DNA as analyzed by real-time NMR monitoring method (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Kanba, A. Furukawa, K. Sugase, T. Nagata, M. Katahira
  • 学会等名: The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 北九州国際会議場（北九州市）
  • 年月日: 2014-11-05 – 2014-11-07
• [学会発表] Creation of novel Tat-binding aptamer and ribozyme whose activities switch on in response to K+ via quadruplex formation (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamaoki, T. Mashima, T. Nagata, M. Katahira
  • 学会等名: The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 北九州国際会議場（北九州市）
  • 年月日: 2014-11-05 – 2014-11-07
• [学会発表] Characterization of RNA aptamer targeting the DNA binding domain of AML1 protein (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Takada, R. Amano, Y. Tanaka, T. Nagata, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu, T. Sakamoto
  • 学会等名: The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 北九州国際会議場（北九州市）
  • 年月日: 2014-11-05 – 2014-11-07
• [学会発表] 神経系幹細胞の未分化状態維持と発癌に関わるMusashi1タンパク質の構造基盤 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩岡諒，小林直宏，津田健吾，今井貴雄，岡野栄之，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第53回NMR討論会
  • 発表場所: 大阪大学コンベンションセンター（吹田市）
  • 年月日: 2014-11-04 – 2014-11-06
• [学会発表] MagRO-NMRView、FLYAによる高度に自動化されたＮＭＲデータ解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林直宏，Bikash Ranjan Sahoo，永田崇，服部良一，Elena Schmidt，Peter Güntert，児嶋長次郎，藤原敏道
  • 学会等名: 第53回NMR討論会
  • 発表場所: 大阪大学コンベンションセンター（吹田市）
  • 年月日: 2014-11-04 – 2014-11-06
• [学会発表] NMR study of the Interaction between MDM2 and a Peptide Selected by mRNA Display (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Nagata, K. Shirakawa, N. Kobayashi, H. Shiheido, N. Tabata, Y. Sakuma-Yonemura, K. Horisawa, M. Katahira, N. Doi, H. Yanagawa
  • 学会等名: Biophysical Society Thematic Meeting Disordered Motifs and Domains in Cell Control
  • 発表場所: Davenport Hotel Dublin (Ireland)
  • 年月日: 2014-10-11 – 2014-10-15
• [学会発表] NMR analysis of the interaction between an artificial RNA and a transcription factor (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Takada, R. Amano, T. Nagata, M. Katahira, Y. Nomura, Y. Tanaka, Y. Nakamura, T. Kozu, T. Sakamoto
  • 学会等名: The 5th International Symposium of Advanced Energy Science -Contribution to Zero-Emission Energy-
  • 発表場所: 京都大学（宇治市）
  • 年月日: 2014-09-30 – 2014-10-02
• [学会発表] Real-time NMR monitoring of enzymatic reaction of anti-HIV protein, structure of anti-prion RNA aptamer and wood biomass analysis (2014)
  • 著者名/発表者名: Kanba, K., Mashima, T., Okamura, H., Furukawa, A., Sugase, K., Nishimura, H., Watanabe, T., Nagata, T., and Katahira, M.
  • 学会等名: The 5th Japan-Taiwan NMR symposium
  • 発表場所: 北海道大学（札幌市）
  • 年月日: 2014-09-29 – 2014-09-30
• [学会発表] Development of Tat-binding aptamer and ribozyme which switch their activities in response to K+ (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamaoki, T. Mashima, T. Nagata, M. Katahira
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Screening for novel aptamer against prion protein and its structural study (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Mashima, F. Nishikawa, Y.O. Kamatari, T. Nagata, S. Nishikawa, K. Kuwata, M. Katahira
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Substrate Recognition and Sliding Properities of an Anti-HIV Factor APOBEC3G analyzed by Real-time NMR Monitoring Strategy (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Kamba, T. Nagata, M. Katahira
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Functional mechanism of an anti-HIV protein, APOBEC3G, as revealed by real-time NMR monitoring of its enzymatic reaction (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Kanba, A. Furukawa, K. Sugase, R. Morishita, T. Nagata, M. Katahira
  • 学会等名: XXVIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Hyatt Regency - Dallas (USA)
  • 年月日: 2014-08-24 – 2014-08-29
• [学会発表] PROPERTIES OF RNA APTAMER BINDING TO AML1 RUNT DOMAIN (2014)
  • 著者名/発表者名: R. Amano, Y. Nomura, T. Nagata, N. Kobayashi, Y. Mori, K. Takada, J. Fukunaga, Y. Tanaka, M. Katahira, Y. Nakamura, T. Kozu, T. Sakamoto
  • 学会等名: XXI ROUND TABLE ON NUCLEOSIDES, NUCLEOTIDES AND NUCLEIC ACIDS
  • 発表場所: Conference Centre of Poznan University of Technology (Poland)
  • 年月日: 2014-08-24 – 2014-08-29
• [学会発表] カリウムイオンを感知して自らの活性をスイッチングするTat捕捉アプタマーおよびリボザイムの創製 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山置佑大，真嶋司，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ウインクあいち（名古屋市）
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
• [学会発表] Structural and functional analysis of Musashi, a neural and oncogenic RNA-binding protein (2014)
  • 著者名/発表者名: R. Iwaoka, T. Nagata, T. Imai, H, Okano, M. Katahira
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ウインクあいち（名古屋市）
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
• [学会発表] The structural and energetic basis for the high-potency inhibition of MDM2-p53 interaction by MDM2-binding peptide obtained with IVV method (2014)
  • 著者名/発表者名: T. Nagata, K. Shirakawa, B.R. Sahoo, H. Shiheido, K. Horisawa, M. Katahira, N. Kobayashi, N. Doi, H. Yanagawa
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] CCND1転写抑制とテロメア短縮に関与する天然変性蛋白質TLS/FUSによる非コードRNAとDNAの認識機構のNMR法による解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 近藤敬子，真嶋司，大吉崇文，黒川理樹，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] AML1タンパク質のRuntドメインに結合するRNAアプタマーの取得と解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 高田健多，天野亮，永田崇，片平正人，中村義一，神津知子，坂本泰一
  • 学会等名: 日本生化学会関東支部定例会
  • 発表場所: 茨木大学（水戸市）
  • 年月日: 2014-06-14
• [学会発表] Statistical Thermodynamics for Binding of an RNA Aptamer and a Partial Peptide of a Prion Protein (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomohiko HAYASHI, Hiraku OSHIMA, Tsukasa MASHIMA, Takashi NAGATA, Masato KATAHIRA, Masahiro KINOSHITA
  • 学会等名: 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of USA
  • 発表場所: Moscone Center (USA)
• [学会発表] Statistical Thermodynamics for The Molecular Recognition Accompanied by a Global Structural Change of a Molecule (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomohiko HAYASHI, Hiraku OSHIMA, Tsukasa MASHIMA, Takashi NAGATA, Masato KATAHIRA, Masahiro KINOSHITA
  • 学会等名: Nagoya Symposium on Deplection Forces: Celebrating the 60th Anniversary of the Asakura-Oosawa Theory
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋市）
• [学会発表] NMR実時間計測法により抗ウィルス因子APOBEC3Gのシチジン脱アミノ化反応の配列依存性を評価する (2013)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑、 小瀧努、 永田崇、 片平正人
  • 学会等名: 第13回日本蛋白質科学学会年会
  • 発表場所: とりぎん文化会館（鳥取市）
• [学会発表] プリオン蛋白質を標的とするＲＮＡアプタマーの認識メカニズムとその抗プリオン活性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 真嶋司，西川富美子，鎌足雄司，藤原弘道，遠藤美紗, 永田崇，小瀧努，西川諭，桑田一夫，片平正人
  • 学会等名: 第13回 日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: とりぎん文化会館（鳥取市）
• [学会発表] 転写因子AML1を標的としたRNAアプタマーによるDNAの擬態 (2013)
  • 著者名/発表者名: 天野亮，野村祐介，永田崇，森瑶子，福永淳一，田中陽一郎，片平正人，中村義一，神津知子，坂本泰一
  • 学会等名: 第8回日本ケミカルバイオロジー学会
  • 発表場所: 東京医科歯科大学M&Dタワー（東京都）
• [学会発表] The deamination of APOBEC3G is controlled by the sliding-direction-dependent catalytic activity, and anti-prion activity of an RNA aptamer and its structual basis (2013)
  • 著者名/発表者名: Ayako Furukawa, Kenji Sugase, Ryo Morishita, Takashi Nagata, Akifumi Takaori-Kondo, Akihide Ryo, Tsukasa Mashima, Fomiko Nishikawa, Satoshi Nishikawa, Yuji Kamatari, Kazuo Kuwata, Masato Katahira
  • 学会等名: The 10th Korea-Japan Bilateral Symposium on Biological NMR
  • 発表場所: Seoul Univ. (Korea)
• [学会発表] Ｍｅｃｈａｎｉｓｍ of high affinity and anti-prion activity of anti-prion aptamer (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukasa Mashima, Fomiko Nishikawa,Yuji O kamatari, Hiromichi Fujiwara, Masayuki Saimura, Takashi Nagata, Tsutomu Kodaki, Satoshi Nishikawa, Kazuo Kuwata, Masato Katahira
  • 学会等名: The 10th Korea-Japan Bilateral Symposium on Biological NMR
  • 発表場所: Seoul Univ. (Korea)
• [学会発表] カリウムイオンによって活性がスイッチングする四重鎖リボザイムの創製：四重鎖形成相補鎖によるスイッチング性能の向上 (2013)
  • 著者名/発表者名: 山置佑大、真嶋司、永田崇、片平正人
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ひめぎんホール（松山市）
• [学会発表] 脳の機能を妨害する天然変性蛋白質とそれを標的とするアプタマーの分子認識機構の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 永田 崇
  • 学会等名: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」平成24年度 第4回 領域会議
  • 発表場所: ひだホテルプラザ（高山市）
  • 招待講演
• [学会発表] NMR analysis of the interaction between an artificial RNA and atranscription factor (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryo Amano, Yusuke Nomura, Takashi Nagata, Naohiro Kobayashi, Yoko Mori, Junichi Fukunaga, Yoichiro Tanaka, Masato Katahira, Yoshikazu Nakamura, Tomoko Kozu, taiichi Sakamoto
  • 学会等名: The 4th International Symposium of Advanced Energy Science
  • 発表場所: 京都大学（宇治市）
• [学会発表] Aptamer that exerts anti-prion activity and intelligent ribozyme whose activity awitches in reponse to K+ (2013)
  • 著者名/発表者名: Masato Katahira, Tsukasa Mashima, Yudai Yamaoki, Takashi Nagata, Fomiko Nishikawa, Satoshi Nishikawa, Yuji Kamatari, Kazuo Kuwata
  • 学会等名: 日本生物物理学会第51回年会
  • 発表場所: 京都大学（京都市）
• [学会発表] Structual description for the strong binding of the peptide selected by mRNA display to MDM2 (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Nagata, Kie Shirakawa, Naohiro Kobayashi, Hirokazu Shiheido, Masato Katahira, Kenishi Horisawa, Nobuhide Doi, Hiroshi Yanagawa
  • 学会等名: 5th Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Brisbane Convention and Exhibition Centre (Australia)
• [学会発表] Statistical Thermodynamics for Binding of an RNA Aptamer and a Partial Peptide of a Prion Protein (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomohiko HAYASHI, Hiraku OSHIMA, Tsukasa MASHIMA, Takashi NAGATA, Masato KATAHIRA, Masahiro KINOSHITA
  • 学会等名: 日本生物物理学会第51回年会
  • 発表場所: 京都大学（京都市）
• [学会発表] Origin of the anti-prion activity of quadruplex (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukasa Mashima, Fumiko Nishikawa, Yuji O. Kamatari, Masayuki Saimura, Takashi Nagata, Satoshi Nishikawa, Kazuo Kuwata, Masato Katahira
  • 学会等名: The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2013
  • 発表場所: 神奈川大学（横浜市）
• [学会発表] Dual-quadruplex forming ribozyme distinctly switches on its activity in response to K+ (2013)
  • 著者名/発表者名: Yudai Yamaoki, Tsukasa Mashima, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2013
  • 発表場所: 神奈川大学（横浜市）
• [学会発表] Multi-site binding of high affinity aptamer against AML1 Runt domain (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryo Amano, Yusuke Nomura, Takashi Nagata, Naohiro Kobayashi, Yoko Mori, Junichi Fukunaga, Yoichiro Tanaka, Masato Katahira, Yoshikazu Nakamura, Tomoko Kozu, Taiichi Sakamoto
  • 学会等名: The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2013
  • 発表場所: 神奈川大学（横浜市）
• [学会発表] Structural basis for the inhibition of MDM2:p53 interaction by highly selective MDM2-binding peptide obtained with IVV method (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Nagata, Kie Shirakawa, Naohiro Kobayashi, Hirokazu Shiheido, Masato Katahira, Kenishi Horisawa, Nobuhide Doi, Hiroshi Yanagawa
  • 学会等名: 第52回日本核磁気共鳴学会
  • 発表場所: 石川県立音楽堂（金沢市）
• [学会発表] 神経系幹細胞の未分化状態維持に関わる Musashi1 タンパク質の機能発現の分子メカニズム (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩岡諒、 櫻井悠子、 鍵矢悦久、 今井貴雄、 岡野栄之、 永田崇、 片平正人
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（神戸市）
• [学会発表] Development of quadruplex hammerhead ribozyme which switches on its ribozyme activity: introduction of quadruplex-forming complementary DNA to repress a basal activity (2013)
  • 著者名/発表者名: Yudai Yamaoki, Tsukasa Mashima, Takashi Nagata, Masato Katahira
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（神戸市）
• [学会発表] 四重鎖構造を形成する核酸の抗プリオン活性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 真嶋司、西川富美子、鎌足雄司、才村正幸、永田崇、西川諭、桑田一夫、片平正人
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（神戸市）
• [学会発表] ヒト抗ウィルス因子 APOBEC3G の基質認識機構及び Vif による APOBEC3G 阻害機構の解明に向けて (2013)
  • 著者名/発表者名: 神庭圭佑、永田崇、片平正人
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（神戸市）
• [学会発表] mRNA ディスプレイ法により選択された高親和性MDM2結合ペプチドＭＩＰに基づくＭＤＭ2－ｐ53相互作用阻害剤の開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 白川貴恵、永田崇、小林直弘、始平堂弘和、新倉啓介、片平正人、堀澤健一、土居信英、柳川弘志
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（神戸市）
• [学会発表] 転写因子AML1に対して複数の結合部位を持つ高親和性RNAアプタマーの解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 天野亮、野村祐介、永田崇、森瑶子、福永淳一、田中陽一郎、片平正人、中村義一、神津知子、坂本泰一
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（神戸市）
• [学会発表] 抗HIV宿主因子APOBE３Gの位置依存的デアミネーション反応機構の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 古川亜矢子，菅瀬謙治，森下了，粱明秀，高折晃史，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（名古屋市）
• [学会発表] RNAアプタマーの抗プリオン活性とその構造的基礎 (2012)
  • 著者名/発表者名: 真嶋司，西川富美子，鎌足雄司，藤原弘道，永田崇，小瀧努，西川諭，桑田一夫，片平正人
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学（仙台市）
• [学会発表] カリウムイオン濃度を感知して活性がオンになるインテリジェントリボザイムの創製 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山置雄大，真嶋司，櫻井佑，原ゆかり，永田崇，片平正人
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学（仙台市）
• [学会発表] RNAアプタマーとAML1 Runt domainの相互作用解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 天野亮，野村祐介，永田崇，福永淳一，田中陽一郎，片平正人，中村義一，神津知子，坂本泰一
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学（仙台市）
• [学会発表] Anti-prion activity of RNA aptamer and the structural basis of its high affinity to prion protein (2012)
  • 著者名/発表者名: Mashima,T,Nishikawa.F,Kamatari.Y,Fugiwara.H,Nagata.T,Kodaki.T,Nishikawa.S,Kuwata.K.Katahira.M
  • 学会等名: Asia Pacific Prion symposium
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
• [学会発表] Anti-prion activity and it strucural basis of RNAaptamer, and sliding-direction-dependent deaminase activity of anti-HIV enzyme (2012)
  • 著者名/発表者名: Mashima.T,Furukawa.A,Sugase.K,Fujiwara.H,Nishikawa.F,Morishita.R,Ryo.A,Kamatari.Y.Nagata.T,Nishikawa.S,Kuwata.K,Katahira.M
  • 学会等名: XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Lyon Convention Centre (France)
• [学会発表] Elucidation of the location-dependent deamination reaction mechanism of an anti-HIV factor,APOBEC3G (2012)
  • 著者名/発表者名: Furukawa.A,Sugase.K.Morishita.R,Ryo.A,akaori.A,Nagata.T,Katahira.M
  • 学会等名: XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Lyon Convention Centre (France)
• [学会発表] Sequence-specific RNA-recognition mechanism of Musashi1,neural and oncogenic RNA-binding protein (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohyama.t,Nagata.t,Tsuda.k,Kobayashi.N,Imai.T,Okano.H,Yamazaki.T,Katahira.M
  • 学会等名: XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Lyon Convention Centre (France)
• [学会発表] NMR analysis of the interaction between AML1 Runt domain and RNA aptamer (2012)
  • 著者名/発表者名: Amano.R,Nomura.Y,Nagata.T,Fukunaga.J.Tanaka.Y.Katahira.M,Nakamura.Y,Kozu.T.Sakamoto.T
  • 学会等名: XXV international Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Lyon Convention Centre (France)
• [学会発表] カリウムイオン依存的な四重鎖構造形成によって活性がオンになるインテリジェントリボザイムの創製 (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Yamaoki, T.Mashima, Y.sakurai, Y.hara, T.Nagata, M.katahira
  • 学会等名: 日本生物物理学会第50回年会
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋市）
• [学会発表] 抗HIV宿主因子 APOBEC3Gの位置依存的デアミネーション反応機構の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: A.Furukawa, K.Sugase, R.Morishita, T.Nagata, A.Takaori, A.Ryo, M.Katahira
  • 学会等名: 日本生物物理学会第50回年会
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋市）
• [学会発表] NMR法によるAPOBEC３Gデアミネース活性に関する研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: R.Iwaoka, S.Kitamura, K.Kanba, A.Furukawa, H.Okamura, W.Sugiura, T.Nagata, Y.Iwatani, M.Katahira
  • 学会等名: 日本生物物理学会第50回年会
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋市）
• [学会発表] プリオンタンパク質とRNAアプタマーの相互作用及び木質バイオマスの生分解のモニタリング (2012)
  • 著者名/発表者名: 真嶋司、西村裕志、岡村英保、西川富美子、鎌足雄司、永田崇、西村諭、桑田一夫、渡辺隆司、片平正人
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインクあいち（名古屋市）
• [学会発表] Strctural analysisi of RNA aptamer in complex with prion protein, and its anti-prion activity (2012)
  • 著者名/発表者名: T.Mashima, F,Nishikawa, Y.Kamatari, H.Fujiwara, T.Nagata, T.Kodaki, S.Nishikawa, K.Kuwata. M.Katahira
  • 学会等名: The 39th Internaional Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋市）
• [学会発表] Development of intelligent ribozyme whose activity switches on in response to K＋ｖia quadruplex formation (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Yamaoki, T.Mashima, Y.sakurai, Y.hara, T.Nagata, M.katahira
  • 学会等名: The 39th Internaional Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋市）
• [学会発表] NMR Real-time Monitoring of the Deamination Reaction of Human Antiviral Factor APOBEC3G (2012)
  • 著者名/発表者名: K.Kamba, A.Furukawa, T.Kodaki, T.Nagata, M.Katahira
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡市）
• [学会発表] Creation of Novl Ribozyme whose Activity Switches on in Response to K+ via Quadruples Formation (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Yamaoki, T.Mashima, Y.Sakurai, Y.Hara, T.Kodaki, T.Nagata, M.Katahira
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡市）
• [学会発表] NMR approach for ligand-based drug discovery: DIRECTION approach for the pharmacophore mapping of drug candidates (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Takahashi
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
  • 発表場所: 理研横浜研究所（横浜市）
  • 招待講演
• [学会発表] Pharmaceutical NMR techniques: NMR approach for ligand-based drug discovery (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Takahashi
  • 学会等名: Pharmaceutical NMR lecture series in Osaka
  • 発表場所: 大阪大学（吹田市）
  • 招待講演
• [学会発表] NMRによるタンパク質相互作用とそのアロステリック阻害機構の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高橋栄夫
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会・ワークショップ「NMRで見る タンパク質の機能発現」
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡市）
• [学会発表] XMRV プロテアーゼのNMR による構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 古川亜矢子、松永智子、岩岡諒、永田崇、小林直宏、高折晃史、森下了、梁明秀、片平正人
  • 学会等名: 第１１回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク（吹田）
• [学会発表] リアルタイムモニタリングによって示されたAPBEC3GによるDNA上の極性を有したスライディン (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Katahira, A.Furukawa, T. Nagata, H. Takaku, R. Morishita, A. Takaori, A. Ryo
  • 学会等名: 日本生物物理学会第49回年会
  • 発表場所: 兵庫県立大学（姫路）
• [学会発表] r(GGA)4 chimeric ribozyme switches its activity in responseto K+ via quadruplex formation (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Nagata, Y. Sakurai, Y. Hara, T. Mashima, M. Katahira
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
  • 発表場所: 北海道大学（札幌）
• [学会発表] Real-time monitoring of the cytidine deamination along single-stranded DNA by an anti-HIV (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Furukawa, K. Sugase, R. Morishita, T. Nagata, A. Ryo, A. Takaori, M. Katahira
  • 学会等名: The International Symposium on Nuclear Magnetic Resonance 2011
  • 発表場所: 大桟橋ホール（横浜）
• [学会発表] Structural basis for the sequence-specific RNA-recognition mechanism of Musashi 1 (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Ohyama, T. Nagata, K. Tsuda, N. Kobayashi, T. Imai, H. Okano, T. Yamazaki, M. Katahira
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜）
• [学会発表] MagRO-Assign: a tool for automated sequence specific assignment of chemical shifts for NMR signals of protein backbone (2011)
  • 著者名/発表者名: N. Kobayashi, A. Furukawa, S. Kitazawa, T. Nagata, R. Kitahara, M. Katahira, T. Fujiwara
  • 学会等名: EUROMAR2011
  • 発表場所: Campus Westend (Frankfurt, Germany)
• [図書] 生体有機化学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高橋栄夫
  • 総ページ数: 220
  • 出版者: 東京化学同人