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脊椎動物の発生調節に頑健性を与える機構とその進化的起源

研究課題

研究課題/領域番号 23570256
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 発生生物学
研究機関長浜バイオ大学 (2013)
奈良先端科学技術大学院大学 (2011-2012)

研究代表者

荻野 肇  長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授 (10273856)

連携研究者 越智 陽城  山形大学, 医学部教育研究支援センター, 助教 (00505787)
研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2012年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2011年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワード発生・分化 / 進化 / ゲノム / 発現制御 / 遺伝子 / 国際情報交換 / フランス
研究概要

本研究では、脊椎動物の祖先種で起きたゲノム倍化により生じた重複遺伝子(パラログ)に注目して、脊椎動物の発生調節に頑健性を与える機構とその進化的起源の解明を試みた。Nr2fパラログ群については、Nr2f1とNr2f2、Nr2f5、Nr2f6の4つが眼や脳で部分的に重複して発現し、特にNr2f1とNr2f2の間では、ゲノム倍化前の祖先遺伝子に由来する3ペアのエンハンサーが未だに保存されていることを発見した。Pax2とPax5のパラログペアについては、両者の間で発現補完に働くエンハンサーの祖先型配列を、脊椎動物の祖先種に近縁なナメクジウオに同定した。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (46件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (32件) (うち招待講演 5件) 図書 (4件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Essential roles of epithelial bone morphogenetic protein signaling during prostatic development2014

    • 著者名/発表者名
      A. Omori, S. Miyagawa, Y. Ogino, M. Harada, K. Ishii, Y. Sugimura, H. Ogino, N. Nakagata and G. Yamada
    • 雑誌名

      Endocrinology

      巻: 155 号: 7 ページ: 2534-44

    • DOI

      10.1210/en.2013-2054

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Loss of cell-extracellular matrix interaction triggers retinal regeneration accompanied by Rax and Pax6 activation.2013

    • 著者名/発表者名
      Nabeshima A, Nishibayashi C, Ueda Y, Ogino H, Araki M
    • 雑誌名

      Genesis.

      巻: 51 号: 6 ページ: 410-419

    • DOI

      10.1002/dvg.22378

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of pax2 and pax8 paralogues.2012

    • 著者名/発表者名
      Ochi, Haruki
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 3 号: 1 ページ: 848-848

    • DOI

      10.1038/ncomms1851

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparative expression analysis of the H3K27 demethylases, JMJD3 and UTX, with the H3K27 methylase, EZH2, in Xenopus.2012

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, Akane
    • 雑誌名

      International Journal of Developmental Biology

      巻: 56 号: 4 ページ: 295-300

    • DOI

      10.1387/ijdb.113360ak

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcription factors involved in lens development from the preplacodal ectoderm.2012

    • 著者名/発表者名
      Ogino, Hajime
    • 雑誌名

      Developm ental Biology

      巻: 363 号: 2 ページ: 333-347

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2012.01.006

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Different requirement for Wnt/β-catenin signaling in limb regeneration of larval and adult Xenopus.2011

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama Hitoshi
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 6(7) 号: 7 ページ: e21721-e21721

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0021721

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of paralogues2014

    • 著者名/発表者名
      Ogino H
    • 学会等名
      International symposium:Frontiers in Amphibian biology:Endangered species conservation and genome editing
    • 発表場所
      東広島市広島大学
    • 年月日
      2014-03-27
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Six2とLhx1の腎幹細胞での発現を調節するシス配列の探索2013

    • 著者名/発表者名
      佐々木裕子
    • 学会等名
      第7回日本ツメガエル研究集会
    • 発表場所
      山口県美祢市
    • 年月日
      2013-09-24
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] パラログ形成に伴うシス調節配列の進化2013

    • 著者名/発表者名
      荻野肇
    • 学会等名
      国立遺伝学研究所研究集会「新機能獲得の分子進化」
    • 発表場所
      三島市
    • 年月日
      2013-08-17
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] パラログ形成に伴うシス調節配列の進化2013

    • 著者名/発表者名
      荻野肇
    • 学会等名
      第3回Tokyo Vertebrate Morphology Meeting
    • 発表場所
      東京都慈恵医科大学
    • 年月日
      2013-08-10
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Role of Six1 in evolution of vertebrate primary sensory system2013

    • 著者名/発表者名
      Kawakami K
    • 学会等名
      第46回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      松江市
    • 年月日
      2013-05-29
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] The cis-regulatory evolution for developmental robustness and stress response2013

    • 著者名/発表者名
      Ochi H
    • 学会等名
      第46回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      松江市
    • 年月日
      2013-05-29
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 組織特異的なサイレンサーの獲得によるパラログの発現パターンの多様化2012

    • 著者名/発表者名
      荻野肇
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡市
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ゲノム倍化が引き起こす遺伝子発現調節機構の進化2012

    • 著者名/発表者名
      荻野肇
    • 学会等名
      第24回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • 発表場所
      長野県伊那市
    • 年月日
      2012-08-23
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] パラログ形成にともなうシス調節機構の進化2012

    • 著者名/発表者名
      越智陽城
    • 学会等名
      日本進化学会14回大会
    • 発表場所
      東京都八王子市
    • 年月日
      2012-08-23
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of paralogues2012

    • 著者名/発表者名
      Ogino H
    • 学会等名
      第45回日本発生生物学会・第64回日本細胞生物学会合同大会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 年月日
      2012-05-31
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Paralogous enhancers:a crossover point between developmental robustness and stress response2012

    • 著者名/発表者名
      Ochi H
    • 学会等名
      第45回日本発生生物学会・第64回日本細胞生物学会合同大会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 年月日
      2012-05-29
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Conservation and diversification of cis-regulatory mechanisms of the pax2/5/8 paralog group in chordates2011

    • 著者名/発表者名
      Ochi H
    • 学会等名
      American Society for Cell Biology Annual Meeting
    • 発表場所
      Denver Colorado USA
    • 年月日
      2011-12-04
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Scarless wound healing of Xenopus laevis -as a prerequisite for epimorphic regeneration2011

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama H
    • 学会等名
      日本発生生物学会第44回大会
    • 発表場所
      沖縄県宜野湾市
    • 年月日
      2011-05-19
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] A H3K27 demethylase Jmjd3, is essential for Xenopus eye development2011

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi A
    • 学会等名
      日本発生生物学会第44回大会
    • 発表場所
      沖縄県宜野湾市
    • 年月日
      2011-05-18
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Conservation and diversification of cis-regulatory mechanisms of the pax2/5/8 paralog group in chordates.2011

    • 著者名/発表者名
      Ochi, H., Tamai, T., Kawaguchi, A., Sudou, N. and Ogino, H.
    • 学会等名
      American Society for Cell Biology Annual Meeting
    • 発表場所
      Denver, Colorado, USA
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] エピジェネティック因子Jmjd3による異所的な細胞分化と器官形成の促進.2011

    • 著者名/発表者名
      須藤則広,越智陽城,川口 茜,荻野 肇
    • 学会等名
      第5回日本ツメガエル研究集会
    • 発表場所
      静岡県熱海市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] ツメガエルの初期発生におけるヒストンH3メチル化因子と脱メチル化因子の機能解析.2011

    • 著者名/発表者名
      川口 茜,越智陽城,須藤則広,荻野 肇
    • 学会等名
      第5回日本ツメガエル研究集会
    • 発表場所
      静岡県熱海市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 組織特異的サイレンサーの獲得によるパラログ遺伝子の発現の多様化.2011

    • 著者名/発表者名
      越智陽城,玉井智子,長野紘樹,川口 茜,須藤則広,荻野 肇
    • 学会等名
      第5回日本ツメガエル研究集会
    • 発表場所
      静岡県熱海市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Scarless wound healing of Xenopus laevis -as a prerequisite for epimorphic regeneration.2011

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama, H., Maruoka, T., Ochi, H., Aruga, A., Amano, T., Shiroishi, T., Ogino, H. and Tamura, S.
    • 学会等名
      日本発生生物学会第44回大会
    • 発表場所
      沖縄県宜野湾市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] A H3K27 demethylase, Jmjd3, is essential for Xenopus eye development.2011

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, A., Ochi, H., Sudou, N. and Ogino, H.
    • 学会等名
      日本発生生物学会第44回大会
    • 発表場所
      沖縄県宜野湾市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] A pair of duplicated enhancers controls both a fail-safe regulation for development and adaptation to environmental stress.2011

    • 著者名/発表者名
      Ochi, H., Uchiyama, C., Kawaguchi, A., Tamai, T. and Ogino, H.
    • 学会等名
      日本発生生物学会第44回大会
    • 発表場所
      沖縄県宜野湾市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of paralogues.

    • 著者名/発表者名
      Ogino, H.
    • 学会等名
      International symposium: Frontiers in Amphibian biology: Endangered species conservation and genome editing
    • 発表場所
      広島県東広島市 広島大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Six2とLhx1の腎幹細胞での発現を調節するシス配列の探索.

    • 著者名/発表者名
      佐々木裕子,田村友佳,星島和幸,荻野 肇,越智陽城
    • 学会等名
      第7回日本ツメガエル研究集会
    • 発表場所
      山口県美祢市 秋吉台国際芸術村
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] パラログ形成に伴うシス調節配列の進化.

    • 著者名/発表者名
      荻野 肇
    • 学会等名
      国立遺伝学研究所 研究集会「新機能獲得の分子進化」
    • 発表場所
      静岡県三島市 国立遺伝学研究所
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] パラログ形成に伴うシス調節配列の進化.

    • 著者名/発表者名
      荻野 肇
    • 学会等名
      第3回 Tokyo Vertebrate Morphology Meeting
    • 発表場所
      東京都 慈恵医科大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Role of Six1 in evolution of vertebrate primary sensory system.

    • 著者名/発表者名
      Kawakami, K., Yajima, H., Suzuki, M., Ochi, H., Ikeda, K., Sato, S., Ogino, H. and Ueno, N.
    • 学会等名
      第46回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      島根県松江市 くにびきメッセ
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] The cis-regulatory evolution for developmental robustness and stress response.

    • 著者名/発表者名
      Ochi, H., Kawaguchi, A., Sudou, N., Hoshijima, K. and Ogino, H.
    • 学会等名
      第46回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      島根県松江市 くにびきメッセ
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 組織特異的なサイレンサーの獲得によるパラログの発現パターンの多様化

    • 著者名/発表者名
      荻野 肇
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ゲノム倍化が引き起こす遺伝子発現調節機構の進化

    • 著者名/発表者名
      荻野 肇
    • 学会等名
      第24回 高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • 発表場所
      長野県伊那市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] パラログ形成にともなうシス調節機構の進化

    • 著者名/発表者名
      越智陽城
    • 学会等名
      日本進化学会第14回東京大会
    • 発表場所
      東京都八王子市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of paralogues.

    • 著者名/発表者名
      Ogino, Hajime
    • 学会等名
      第45回日本発生生物学会・第64回日本細胞生物学会合同大会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Paralogous enhancers: a crossover point between developmental robustness and stress response.

    • 著者名/発表者名
      Ochi, Haruki
    • 学会等名
      第45回日本発生生物学会・第64回日本細胞生物学会合同大会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] New Principles in Developmental Processes, Springer2014

    • 著者名/発表者名
      Ochi, H, Kawaguchi A, and Ogino, H
    • 出版者
      Differential use of paralogous genes via evolution of cis-regulatory elements for divergent expression specificities
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] New Principles in Developmental Processes2014

    • 著者名/発表者名
      Ochi, H., Kawaguchi, A. and Ogino, H.
    • 総ページ数
      317
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] Methods in Molecular Biology, Xenopus Protocols, 2nd edition:Post-Genomic Approaches, Humana press2012

    • 著者名/発表者名
      Ogino H, Ochi H, Uchiyama C, Louie S, and Grainger R M
    • 出版者
      Comparative genomics-based identification and analysis of cis-regulatory elements
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] Comparative genomics-based identification and analysis of cis-regulatory elements (in Methods in Molecular Biology, Vol. 917, Xenopus Protocols, 2nd edition: Post-Genomic Approaches)2012

    • 著者名/発表者名
      Ogino, Hajime
    • 出版者
      Humana press
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [備考] 長浜バイオ大学教員の紹介(荻野 肇)

    • URL

      http://www.nagahama-i-bio.ac.jp/guide/kyoin/detail/post-10.html

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 報道関連情報 雑誌論文③(Nature Communications誌に発表したゲノム倍化と遺伝子進化の研究) の意義を伝えた記事

    • URL

      http://sankei.jp.msn.com/west/west_life/news/120525/wlf12052516310018-n1.htm

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 教員の紹介(荻野 肇)|長浜バイオ大学

    • URL

      http://www.nagahama-i-bio.ac.jp/guide/kyoin/detail/post-10.html

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://bsgcoe.naist.jp/ogino/

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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