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マウス視覚野におけるMecp2とFoxg1の標的ゲノム領域探索

研究課題

研究課題/領域番号 23681041
研究種目

若手研究(A)

配分区分補助金
研究分野 ゲノム医科学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

ARNER Erik (ARNER ERIK)  独立行政法人理化学研究所, LSA 情報基盤施設, 研究員 (20571839)

研究協力者 CARNINCI Piero  独立行政法人理化学研究所, ゲノム機能研究チーム, チームリーダー (10333296)
FORREST Alistair  独立行政法人理化学研究所, LSA 情報基盤施設, 施設長 (40569084)
SAXENA Alka  独立行政法人理化学研究所, ゲノム機能研究チーム, 上級研究員 (20618772)
FAGIOLINI Michela  Children's Hospital Boston, Assistant Professor of Neurology
研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2012年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
キーワードRett Syndrome / Mecp2 / FoxG1 / ChIP Sequencing / Transcriptome Analysis / ChIP sequencing / Transcriptome analysis / レット症候群
研究概要

レット症候群のマウスモデルについてChIP 配列決定を行い、野生型(WT)とMecp2 欠損(KO)マウスの視覚野におけるMecp2 とFoxg1 の標的を特定。キャップによる遺伝子発現解析(CAGE)でKO の標的の発現レベルを評価した。WT とKO で発現の異なる遺伝子は主に発生後期に見られ、その多くは呼吸鎖等のミトコンドリア・プロセスに関連しており、レット症候群におけるミトコンドリアの関与を示唆している。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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