Ｖｉｇｎａ属遺伝資源の栽培化による環境適応性作物の開発

• 研究課題/領域番号: 23688002
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 独立行政法人農業生物資源研究所
• 研究代表者: 内藤 健 独立行政法人農業生物資源研究所, 多様性活用研究ユニット, 研究員 (20581705)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 26,780千円 (直接経費: 20,600千円、間接経費: 6,180千円); 2013年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2012年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円); 2011年度: 13,520千円 (直接経費: 10,400千円、間接経費: 3,120千円)
• キーワード: Vigna属 / ゲノム / 遺伝学 / 栽培化 / 環境ストレス / 突然変異 / 育種 / 遺伝資源 / 遺伝 / アズキ / QTL

研究概要

本研究計画では、まずマーカーを充実するため、次世代シーケンサーによる全ゲノム解読を行い、アズキゲノムの9割以上のアセンブルを得た。
アズキゲノムからマーカーを設計し、Vigna属の遺伝資源の交雑集団のファインマッピングを行い、種子の大きさを2倍にするmog遺伝子および裂莢性を支配するptw遺伝子を同定した。
さらに、病害虫に強く、栽培が用意な野生種V. stipulaceaのEMS処理集団から変異選抜を行い、種子大型化および非裂莢性の変異体を得ることができた。

研究成果

• [雑誌論文] De novo assembly of the complete organelle genome sequences of azuki bean (Vigna angularis) using next-generation sequencers (2013)
  • 著者名/発表者名: Ken Naito, Akito Kaga, Norihiko Tomooka, and Makoto Kawase
  • 雑誌名: Breeding Science 巻: 63 ページ: 176-182
  • NAID: 10031173709
• [雑誌論文] Agriculture : Feeding the future (2013)
  • 著者名/発表者名: Susan McCouch and Ken Naito et al
  • 雑誌名: Nature 巻: 499 ページ: 23-24
• [雑誌論文] De novo assembly of the complete organelle genome sequences of azuki bean (Vigna angularis) using next-generation sequencers. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ken Naito, Akito Kaga, Norihiko Tomooka, Makoto Kawase
  • 雑誌名: Breeding Science 巻: 63 ページ: 176-182
  • NAID: 10031173709
  • 査読あり
• [雑誌論文] De novo assembly of the complete organelle genome sequences of azuki bean (Vigna angularis) using next-generation sequencers (2013)
  • 著者名/発表者名: Ken Naito
  • 雑誌名: Breeding Science 巻: in press
  • NAID: 10031173709
  • 査読あり
• [学会発表] The Vigna Genome Project (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Sakai, Ken Naito, Eri Ogiso, Akito Kaga, Takeshi Itoh and Norihiko Tomooka
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XXII
• [学会発表] The Vigna Genome Project (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Sakai, Ken Naito, Eri Ogiso, Akito Kaga, Takeshi Itoh and Norihiko Tomooka
  • 学会等名: CSHL Plant Genomes & Biotechnology Meeting
• [学会発表] Vigna属野生種のNeo-domestication (2013)
  • 著者名/発表者名: 高橋有、内藤健、伊勢村武久、武藤千秋、坂井寛章、加賀秋人、Natesan Senthil、Muthaiyan Pandiyan、友岡憲彦
  • 学会等名: 第124回日本育種学会講演会
• [学会発表] The Vigna Genome Project (2013)
  • 著者名/発表者名: Ken Naito, Hiroaki Sakai, Eri Ogiso, Akito Kaga and Norihiko Tomooka
  • 学会等名: 3^<rd> International Symposium of Genomics of Plant Genetic Resources
• [学会発表] アズキ裂莢性遺伝子のファインマッピング (2013)
  • 著者名/発表者名: 内藤健、武藤千秋、小木曽映理、加賀秋人、友岡憲彦
  • 学会等名: 第123回日本育種学会講演会
• [学会発表] The Vigna Genome Project (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Sakai, Ken Naito, Eri Ogiso, Akito Kaga, Takeshi Itoh and Norihiko Tomooka
  • 学会等名: 2013 CSHL Plant Genomes & Biotechnology Meeting
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory,
• [学会発表] Vigna属野生種のNeo-domestication (2013)
  • 著者名/発表者名: 高橋有、内藤健、伊勢村武久、武藤千秋、坂井寛章、加賀秋人、Natesan Senthil、Muthaiyan Pandiyan、友岡憲彦
  • 学会等名: 第123回日本育種学会講演会
  • 発表場所: 鹿児島大学
• [学会発表] The Vigna Genome Project (2013)
  • 著者名/発表者名: Ken Naito, Hiroaki Sakai, Eri Ogiso, Akito Kaga and Norihiko Tomooka
  • 学会等名: 3rd International Symposium of Genomics of Plant Genetic Resources
  • 発表場所: 韓国チェジュ島
• [学会発表] アズキ裂莢性遺伝子のファインマッピング (2013)
  • 著者名/発表者名: 内藤健
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 東京農業大学
• [学会発表] アズキのオルガネラゲノム (2012)
  • 著者名/発表者名: 内藤健
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 宇都宮大学
  • 年月日: 2012-03-29
• [学会発表] 多器官大型化突然変異遺伝子の同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 内藤健、平野久美、加賀秋人、白澤健太、磯部祥子、友岡憲彦
  • 学会等名: 第122回日本育種学会講演会
• [学会発表] アズキのオルガネラゲノム (2012)
  • 著者名/発表者名: 内藤健、加賀秋人、Duncan Vaughan、友岡憲彦
  • 学会等名: 第121回日本育種学会講演会
• [学会発表] 多器官大型化遺伝子の同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 内藤健
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 京都産業大学
• [学会発表] Vigna属野生種のNeo-domesticationを目指した栽培化遺伝子のファインマッピング (2011)
  • 著者名/発表者名: 内藤健
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 福井県立大学
  • 年月日: 2011-09-24
• [学会発表] Vigna属野生種のNeo-domesticationを目指した栽培化遺伝子のファインマッピング (2011)
  • 著者名/発表者名: 内藤健、加賀秋人、磯部祥子、白澤健太、平川英樹、田畑哲之、友岡憲彦
  • 学会等名: 第120回育種学会講演会
• [備考]
  • URL: http://www.nias.affrc.go.jp/org/GR/Biodiversity/page01.html