| 研究課題/領域番号 |
23700353
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
生体生命情報学
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| 研究機関 | 独立行政法人理化学研究所 (2013)
立命館大学 (2011-2012) |
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研究代表者 |
遠里 由佳子 独立行政法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員 (80346171)
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| 研究期間 (年度) |
2011 – 2013
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2013年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2012年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2011年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
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| キーワード | バイオインフォマティクス / マイクロアレイ / 表現型 / 数理モデル / 統計解析 / 感度解析 / 代謝 / 国際情報交流 / 頑強性 / オミックスデータ解析 / 大腸菌 / 線虫 / Phenotype MicroArray / 2D-DIGE |
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| 研究概要 |
大腸菌の遺伝子機能を解析するためには、その遺伝子が欠失したときの表現型や、遺伝子と表現型がどのようなネットワークにより制御されているかを知ることが重要である。しかし、従来の表現型解析はグルコースやLBなどの限られた培地条件でしかおこなわれていない。そこで（１）Phenotype MicroArray で測定された1920種類の培地環境における大腸菌の野生株と一遺伝子欠失株の細胞増殖の違いを統計的に解析し、（２）大規模な中央代謝の数理モデルの構築することで、培地条件によって遺伝子の必要性が変化する「遺伝子の環境依存性」の解析を試みた。
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