| 研究課題/領域番号 |
23710085
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
環境技術・環境材料
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| 研究機関 | 東北大学 |
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研究代表者 |
畑山 正美 東北大学, 大学院・環境科学研究科, 助教 (30447148)
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| 連携研究者 |
西郷 浩人 九州工業大学, 生命情報工学科, 准教授 (90586124)
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| 研究期間 (年度) |
2011 – 2012
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| 研究課題ステータス |
完了 (2012年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2011年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
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| キーワード | 環境浄化技術 / ファイトレメディエーション / 次世代シークエンシング解析 / Pteris vittata / ヒ素 / 環境修復技術 / トランスクリプトーム / 次世代シークエンス解析 |
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| 研究概要 |
次世代シークエンサー(Roche社454FLX Titanium)を用いたヒ素超蓄積植物の転写産物の網羅的解析行った。ヒ酸暴露有無条件下でインキュベートした後、羽片(葉)、根よりTotalRNAを調製した。Roche社454FLX Titaniumより263Mbのシークエンシングが行われた。アセンブル解析の結果10,000以上のlarge contigが得られた。Blast等の解析を行い、ヒ素を液胞輸送、または細胞外へ排出する輸送体遺伝子の候補遺伝子の情報を得た。さらに、3'フラグメントライブラリ解析により、シダ暴露有無における羽片・根各部における全発現遺伝子の定量発現解析を行った。その結果いくつかの遺伝子にヒ素暴露による、大きな発現の差異を見出した。現在発現結果の網羅的解析と輸送体候補遺伝子の詳細な解析を行っている。
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