細胞内ゆらぎを考慮した細胞周期におけるタンパク質ネットワーク推定法

• 研究課題/領域番号: 23760382
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 制御工学
• 研究機関: 宇都宮大学
• 研究代表者: 東 剛人 宇都宮大学, 工学研究科, 准教授 (60308179)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円); 2012年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: システムバイオロジー / システム制御 / 細胞周期 / タンパク質ネットワーク / システム科学 / システム同定 / タンパク質ネットワーク推定

研究概要

本研究では,周期信号に対する最小二乗法に基づいた,細胞周期に関連する6次元タンパク質ネットワークの推定法を提案し,その有効性を数値シミュレーションで検証した.さらに,ゆらぎを含む6次元タンパク質ネットワークの推定問題に取り組んだ.そして,推定されたタンパク質ネットワークのロバストネスを周期感度解析手法で確認した.

研究成果

• [雑誌論文] Robustness Analysis of10-dimensional Cell Cycle Systems based on Periodic Sensitivity (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma
  • 雑誌名: Proceedings of the 6th International Conference on Sensing Technology 巻: Vol. 1 ページ: 506-511
  • 査読あり
• [雑誌論文] Robustness Analysis of 10-dimensional Cell Cycle Systems based on Periodic Sensitivity (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma
  • 雑誌名: The 6th International Conference on Sensing Technology 巻: 1 ページ: 506-511
  • 査読あり
• [雑誌論文] An approach to estimating protein networks of cell cycle based on least-squares methods for periodic Signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 雑誌名: Proceeding of2011 Fifth International Conference onSensing Technology 巻: Vol. 1 ページ: 484-489
  • 査読あり
• [雑誌論文] Estimation of Protein Networks Based on Least-squares Method for Pseudo Periodic Signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Noriko Takahashi, Takehito Azuma, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 雑誌名: Proceedings of the13th IASTED International Conference onIntelligent Systems and Control 巻: Vol. 1 ページ: 48-54
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Least-squares Method for Periodic Signals of Cell Cycle to Estimate Protein Networks (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma, Noriko Takahashi, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 雑誌名: Proceedings of the 8th Asian Control Conference ページ: 482-487
  • 査読あり
• [雑誌論文] An approach to estimating protein networks of cell cycle based on least-squares methods for periodic signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 雑誌名: Proceeding of 2011 Fifth International Conference on Sensing Technology 巻: 1 ページ: 484-489
  • 査読あり
• [雑誌論文] Estimation of Protein Networks Based on Least-squares Method for Pseudo Periodic Signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Noriko Takahashi, Takehito Azuma, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 雑誌名: Proceedings of the 13th IASTED International Conference on Intelligent Systems and Control 巻: 1 ページ: 48-54
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cdh1とCdc20タンパク質の結合を考慮した9次元細胞周期システムのロバストネス解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤まゆ美，東 剛人，高橋 知子，足立修一
  • 雑誌名: 第11回制御部門大会 巻: 1
• [雑誌論文] 疑似周期信号に対する最小二乗法を用いた細胞周期のタンパク質ネットワークの推定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高橋知子，東 剛人，足立修一
  • 雑誌名: 第11回制御部門大会 巻: 1
• [雑誌論文] セルサイクルにおけるCdc20の結合を考慮したタンパク質ネットワークのロバストネス解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤まゆ美，東 剛人，足立修一
  • 雑誌名: 第40回制御理論シンポジウム 巻: 1 ページ: 9-14
• [学会発表] Robustness Analysis of10-dimensional Cell Cycle Systems based on Periodic Sensitivity (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma
  • 学会等名: The 6th International Conference on Sensing Technology
  • 発表場所: Kolkata(India)
  • 年月日: 2012-12-18
• [学会発表] An approach to estimating protein networks of cell cycle based on least-squares methods for periodic Signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 学会等名: The fifth International Conference on Sensing Technology
  • 発表場所: Palmerston North(New Zealand)
  • 年月日: 2011-12-01
• [学会発表] セルサイクルにおけるCdc20の結合を考慮したタンパク質ネットワークのロバストネス解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 伊藤まゆ美,東剛人,足立修一
  • 学会等名: 第40回制御理論シンポジウム
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2011-09-26
• [学会発表] Estimation of Protein Networks Based on Least-squares Method for Pseudo Periodic Signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Noriko Takahashi, Takehito Azuma, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 学会等名: The 13th IASTED International Conference onIntelligent Systems and ControlJuly
  • 発表場所: Cambridge(United Kingdom)
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] A Least- squares Method for Periodic Signals of Cell Cycle to Estimate Protein Networks (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma, Noriko Takahashi, Mayumi Ito, Shuichi Adachi
  • 学会等名: The 8th Asian Control Conference
  • 発表場所: Kaohsiung(Taiwan)
  • 年月日: 2011-05-15
• [学会発表] An approach to estimating protein networks of cell cycle based on least-squares methods for periodic signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma
  • 学会等名: Fifth International Conference on Sensing Technology
  • 発表場所: Palmerston North
• [学会発表] Estimation of Protein Networks Based on Least-squares Method for Pseudo Periodic Signals (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma
  • 学会等名: 13th IASTED International Conference on Intelligent Systems and Control
  • 発表場所: Cambridge
• [学会発表] A Least-squares Method for Periodic Signals of Cell Cycle to Estimate Protein Networks (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehito Azuma
  • 学会等名: 8th Asian Control Conference
  • 発表場所: Kaohsiung