RabとSNAREの局在化メカニズムの構造基盤平成25年6月6日現在

• 研究課題/領域番号: 23770107
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 伊藤 桜子 東京大学, 放射光連携研究機構, 特任助教 (60597152)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2011年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
• キーワード: X線結晶構造解析 / タンパク質 / 生体膜 / 立体構造解析 / 膜融合 / X線結晶解析 / 小胞輸送

研究概要

RabとSNAREは、真核生物の膜系の融合を制御する因子である。Rabは翻訳後に付加される脂質基によって膜に挿入されるが、この膜挿入をGDFという膜タンパク質が触媒すると言われている。本研究では、GDFとSNARE(VAMP2)が相互作用するという報告に基づき、X線結晶構造解析によりGDFとSNAREの協働機構を解明することを目指した。これまでに、GDFの結晶化に成功し、現在は分解能を向上させることを目指している。また、GDFとVAMP2が複合体を形成する条件も並行して検討している。

研究成果

• [雑誌論文] Crystallographic and mutational studies on the tRNA thiouridine synthetase TtuA (2013)
  • 著者名/発表者名: Hirofumi Nakagawa
  • 雑誌名: Proteins:Structure, function, and bioinformatics 巻: Epub ahead of print 号: 7 ページ: 1232-1244
  • DOI: 10.1002/prot.24273
  • 査読あり
• [雑誌論文] Get1 stabilizes an open dimer conformation of get3 ATPase by binding two distinct interfaces. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota K, Yamagata A, Sato Y, Goto-Ito S, Fukai S.
  • 雑誌名: J Mol Biol. 巻: 422(3) 号: 3 ページ: 366-75
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2012.05.045
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular basis of Lys-63-linked polyubiquitination inhibition by the interaction between human deubiquitinating enzyme OTUB1 and ubiquitin-conjugating enzyme UBC13. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Yamagata A, Goto-Ito S, Kubota K, Miyamoto R, Nakada S, Fukai S.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 巻: 287(31) 号: 31 ページ: 25860-8
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.364752
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differentiating analogous tRNA methyltransferases by fragments of the methyl donor. (2011)
  • 著者名/発表者名: Lahoud G, Goto-Ito S, Yoshida K, Ito T, Yokoyama S
  • 雑誌名: Hou YM.RNA. 巻: 17(7) 号: 7 ページ: 1236-46
  • DOI: 10.1261/rna.2706011
  • 査読あり
• [学会発表] Get3 による翻訳後膜埋込み機構の構造学的基盤 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山形敦史
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡