転写因子-DNA間相互作用と転写活性化の同時測定法の確立

• 研究課題/領域番号: 23770169
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 三國 新太郎 北海道大学, 大学院・医学研究科, 特任助教 (40435954)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2011年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
• キーワード: タンパク質 / 核酸の構造・動態・機能 / 転写因子 / バイオイメージング / 分子間相互作用 / 生物物理 / 核酸 / 蛋白質 / 転写活性 / 相関解析 / 相互作用 / 一分子計測 / FCS / FCCS / 核内受容体 / DNA

研究概要

本研究ではこれまでにない「転写因子-DNA間相互作用」と「転写活性化」の同時定量化法の構築を目指した。結果、転写因子の精製法を確立し、蛍光相互相関分光法を用いた転写因子-DNA間相互作用の定量化に成功した。また、蛍光相互相関分光法を用いることで転写因子が認識するDNA配列内の一塩基変異の差異を解離定数の違いとして認識できることが確認された。さらに、転写活性化の定量化につながるRNA特異的結合タンパク質-RNA間相互作用の定量化に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Nonmuscle myosin II folds into a 10S form via two portions of tail for dynamic subcellular loacalization. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kiboku T.
  • 雑誌名: Genes to Cells. 巻: 18(2) 号: 2 ページ: 90-109
  • DOI: 10.1111/gtc.12021
  • 査読あり
• [雑誌論文] Virus-like particles with removable cyclodextrins enable glutathione-triggered drug release in cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Niikura K.
  • 雑誌名: Mol Biosyst. 巻: 9(3) 号: 3 ページ: 501-507
  • DOI: 10.1039/c2mb25420d
  • 査読あり
• [雑誌論文] Monitoring the caspase cascade in single apoptotic cells using a three-color fluorescent protein substrate (2011)
  • 著者名/発表者名: Fan Sun, Shintaro Mikuni, Masataka Kinjo
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: Volume 404, Issue 2 号: 2 ページ: 706-710
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2010.12.047
  • NAID: 120002834708
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rab6a releases LIS1 from a dynein idling complex and activates dynein for retrograde movement.
  • 著者名/発表者名: Yamada M, Kumamoto K, Mikuni S, Arai Y, Kinjo M, Nagai T, Tsukasaki Y, Watanabe TM, Fukui M, Jin M, Toba S, Hirotsune S.
  • 雑誌名: Scientific reports
  • 査読あり
• [学会発表] 蛍光相関分光法を用いたDNA-転写因子相互作用と転写活性化同時定量法の開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 三國新太郎
  • 学会等名: 先端的光イメージング拠点形成プロジェクト・成果報告シンポジウム
  • 発表場所: 北海道大学(札幌市)
  • 年月日: 2013-03-18
• [学会発表] Determination of dissociation constant between glucocorticoid receptor and DNA using FCCS (2012)
  • 著者名/発表者名: Mikuni S and Kinjo M
  • 学会等名: 第50回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 名古屋大学(名古屋市)
• [学会発表] Training course for FCS and FCCS Fluorescence Microscopy: from Basics toAdvanced (2012)
  • 著者名/発表者名: Kinjo M and Mikuni S
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学(恩納村)
• [学会発表] Determination of dissociation constant between glucocorticoid receptor and DNA using FCCS (2012)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Mikuni
  • 学会等名: The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋市）
• [学会発表] Training course for FCS and FCCS (2012)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Mikuni
  • 学会等名: Fluorescence Microscopy: from Basics to Advanced
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学（恩納村）
• [学会発表] Analysis for the relationship of intranuclear diffusional landscape and transcriptional activity of glucocorticoid receptor (2011)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Mikuni
  • 学会等名: International Symposium on Photonic Bioimaging
  • 発表場所: 京王プラザホテル（札幌市）
• [学会発表] 蛍光相関分光法を用いたDNA-転写因子相互作用と転写活性化同時定量法の開発
  • 著者名/発表者名: 三國 新太郎
  • 学会等名: 先端的光イメージング拠点形成プロジェクト・成果報告シンポジウム
  • 発表場所: 北海道大学（札幌市）
• [備考]
  • URL: http://www.lfsci.hokudai.ac.jp/labs/infmcd/index.html
• [備考] 細胞機能科学研究室
  • URL: http://www.lfsci.hokudai.ac.jp/labs/infmcd/index.html