内在性小分子siRNA前駆体の成熟化プロセスの解明

• 研究課題/領域番号: 23770210
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 三好 智博 新潟大学, 研究推進機構超域学術院, 助教 (60534550)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2011年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: RNA / siRNA / 小分子RNA / RNAサイレンシング / non-coding RNA / miRNA / プロセシング / Dicer

研究概要

細胞内では、タンパク質をコードしていない短鎖RNAが機能的にはたらいている。この短鎖RNAの一つに内在性siRNAと呼ばれるものがあるが、この生合成過程は不明であった。本研究では、細胞内に存在する内在性siRNA前駆体の検出に成功した。また、内在性siRNA生合成には、新たに発見された細胞質構造体が機能的に重要であることを明らかにした。さらに、このRNAの生合成機構に関与している新規タンパク質を同定することが出来た。

研究成果

• [雑誌論文] Roles of R2D2, a cytoplasmic D2 body component, in the endogenous siRNA pathway in Drosophila. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishida, KM.
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 49 号: 4 ページ: 680-691
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.12.024
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of chimeric ribosomal stalk complexes from eukaryotic and bacterial sources: structural features responsible for specificity of translation factors (2012)
  • 著者名/発表者名: Mochizuki, M. 他
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 17 号: 4 ページ: 273-284
  • DOI: 10.1111/j.1365-2443.2012.01586.x
  • 査読あり
• [学会発表] The C-terminal region of the ribosomal stalk protein is required for depurination at the SRL region of rRNA (2012)
  • 著者名/発表者名: Yusa K , Miyoshi T , Lee KM ,Maruyama R,Ohno M,Ito K,Wong KB,Uchiumi T.
  • 学会等名: 2012 Niigata Graduate Research Forum Research Camp
  • 発表場所: 朱鷺メッセ
• [学会発表] Evidence for Interaction of the C-terminal Region Shared by Human Ribosomal Stalk Proteins P0/P1/P2 with eEF-1A/eEF-2 (2012)
  • 著者名/発表者名: Onozuka M, Baba K, Miyoshi T, Ito K,Uchiumi T.
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡
• [学会発表] The Hinge Regions of Eukaryotic Ribosomal Stalk Proteins are Indispensable for Efficient Depurination of 28S rRNA by Ribotoxins (2012)
  • 著者名/発表者名: Yusa K, Ohno M, Miyoshi T, Ito K, Uchiumi T.
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡
• [学会発表] Construction of in vitro Translation Elongation System with Archaeal Elongation Factors and Hybrid Ribosomes:Control of Interaction aEF-1A and Stalk aP1 by aEF-1B (2012)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T, Honda T, Sato S, Miyoshi T, Ito K, Uchiumi T.
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡
• [学会発表] リボトキシンによるリボソーム不活性化作用への動物リボソームstalkタンパク質の関与 (2012)
  • 著者名/発表者名: 遊佐 和之，三好 智博，Ka-Ming Lee，大野 萌，伊東 孝祐，Kam-Bo Wong，内海 利男
  • 学会等名: 新潟生化学懇話会
  • 発表場所: 新潟大学（新潟市）
• [学会発表] Evidence for Interaction of the C-terminal Region Shared by Human Ribosomal Stalk Proteins P0/P1/P2 with eEF-1A/eEF-2 (2012)
  • 著者名/発表者名: Onozuka, M., Baba, K., Miyoshi, T., Ito, K., Uchiumi, T.
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡（福岡市）
• [学会発表] The Hinge Regions of Eukaryotic Ribosomal Stalk Proteins are Indispensable for Efficient Depurination of 28S rRNA by Ribotoxins (2012)
  • 著者名/発表者名: Yusa, K., Ohno, M., Miyoshi, T., Ito, K., Uchiumi, T.
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡（福岡市）
• [学会発表] Construction of in vitro Translation Elongation System with Archaeal Elongation Factors and Hybrid Ribosomes: Control of Interaction aEF-1A and Stalk aP1 by aEF-1B (2012)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Honda, T., Sato, S., Miyoshi, T., Ito, k., Uchiumi,. T.
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、マリンメッセ福岡（福岡市）
• [学会発表] ショウジョウバエsmallRNA生合成機構の解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 三好智博
  • 学会等名: 新潟生化学懇話会
  • 発表場所: 新潟薬科大学
  • 年月日: 2011-06-25
• [学会発表] リボトキシンによるリボソーム不活性化作用への動物リボソームstalkタンパク質の関与 (2011)
  • 著者名/発表者名: 遊佐和之,三好智博,Ka-MingLee,大野萌,伊東孝祐,Kam-BoWong,内海利男
  • 学会等名: 新潟生化学懇話会
  • 発表場所: 新潟大学
• [学会発表] リボトキシンによるrRNA機能部位の脱プリン作用にはリボソームstalkタンパク質のC末端部位が関与する (2011)
  • 著者名/発表者名: 遊佐和之、三好智博、Ka-Ming Lee、円山亮、大野萌、伊東孝祐、Kam-Bo Wong、内海利男
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] Introduction of a Lepidoptera-specific sequence within the GTPase-associated center of 28S rRNA into Escherichia coli 23S rRNA: Effects of the mutations (2011)
  • 著者名/発表者名: Ryo Maruyama, Kazuyuki Yusa, Masahiro Mochizuki, Tomohiro Miyoshi, Kosuke Ito, Takaomi Nomura, Uchiumi Toshio
  • 学会等名: 日本RNA学会
  • 発表場所: 京都国際会議場
• [備考]
  • URL: http://www.sc.niigata-u.ac.jp/biologyindex/uchiumi-ito/index.html