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ブール代数的パターン認識によるゲノムデータと臨床データを統合した肝癌再発予測

研究課題

研究課題/領域番号 24500206
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 知覚情報処理・知能ロボティクス
研究機関山口大学

研究代表者

浜本 義彦  山口大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90198820)

研究分担者 飯塚 徳男  山口大学, 医学部付属病院, 准教授 (80332807)
藤田 悠介  山口大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (40509527)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード癌 / パターン認識 / 診断
研究成果の概要

本研究では血液検査により肝癌の再発予測システムの開発を目的とする。このため、ゲノムデータと臨床データを統合して2値パターンとし、2値パターンを識別する新しいブール識別器を開発した。実験では肝癌を手術で完全に切除した患者を訓練サンプル40とテストサンプル33として用いた。特徴には、ゲノムデータとしてSPINTとSRDというメチル化遺伝子を、また臨床データとして肝癌の代表的な腫瘍マーカーであるAFPとPIVKAを用いた。ブール識別器を用いて、テストサンプルの血液検査で感度64%, 特異度65%、Youden-index0.29という高精度で肝癌の再発を予測できたことから、臨床応用の見通しを得た。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] An accurate prognostic staging system for hepatocellular carcinoma patients after curative hepatectomy2015

    • 著者名/発表者名
      Y. Tokumitsu
    • 雑誌名

      International Journal of Oncology

      巻: 46 号: 3 ページ: 944-952

    • DOI

      10.3892/ijo.2014.2798

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Comparative Study of Classifiers for Prediction of Recurrence of Liver Cancer Using Binary Patterns2014

    • 著者名/発表者名
      荻原 宏是
    • 学会等名
      27th International Conference on Industrial, Engineering & Other Applications of Applied Intelligent Systems
    • 発表場所
      Kaohsiung, Taiwan
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Classification Based on Boolean Algebra and Its Application to the Prediction of Recurrence of Liver Cancer2013

    • 著者名/発表者名
      荻原 宏是
    • 学会等名
      Workshop on Recent Advances in Computer Vision and Pattern Recognition
    • 発表場所
      ロワジールホテル那覇(那覇市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 統計的パターン認識による肝癌再発予測2013

    • 著者名/発表者名
      浜本 義彦
    • 学会等名
      第28回信号処理シンポジウム
    • 発表場所
      海峡メッセ下関(下関市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ブール代数に基づく識別とその肝癌診断への応用2013

    • 著者名/発表者名
      荻原宏是
    • 学会等名
      情報処理学会第75回全国大会
    • 発表場所
      東北大学
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [産業財産権] 情報処理装置と情報処理プログラム並びに情報処理方法2014

    • 発明者名
      浜本義彦,飯塚徳男
    • 権利者名
      国立大学法人 山口大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2014-147690
    • 出願年月日
      2014-07-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [産業財産権] 情報処理装置と情報処理プログラム並びに情報処理方法2014

    • 発明者名
      浜本義彦,飯塚徳男
    • 権利者名
      国立大学法人 山口大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2014-07-18
    • 取得年月日
      2014-12-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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