癌関連疾患予測システムの開発と疾患パスウェイの研究

• 研究課題/領域番号: 24590704
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 満山 進 慶應義塾大学, 医学部, 特任助教 (30296727)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 癌 / タンパク質 / 遺伝子 / 疾患 / 相互作用 / パスウェイ / データベース / 予測システム / 蛋白質

研究成果の概要

癌関連タンパク質/遺伝子相互作用データベースCancerProView (http://cancerproview.dmb.med.keio.ac.jp)のデータとしてSMARTとNCBI Refseqからタンパク質ドメインの取得を行った。その後、疾患未同定なタンパク質について疾患関連タンパク質とのドメイン比較を行うことにより疾患の可能性を推測するプログラムの開発を行った。本研究の成果は、癌疾患の基礎研究や診断、治療などの分野で活用されると期待される。

研究成果

• [雑誌論文] CancerProView: a graphical image database of cancer-related genes and proteins. (2012)
  • 著者名/発表者名: Susumu Mitsuyama, Nobuyoshi Shimizu
  • 雑誌名: Genomics 巻: 100 号: 2 ページ: 81-92
  • DOI: 10.1016/j.ygeno.2012.05.011
  • 査読あり
• [学会発表] がん関連タンパク質／遺伝子データベースCancerProView (2014)
  • 著者名/発表者名: 満山 進, 清水信義
  • 学会等名: 第37回日本分子生 物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] CancerProView: がん関連疾患遺伝子／タンパク質相互作用データベース (2014)
  • 著者名/発表者名: 満山 進, 清水信義
  • 学会等名: 生命医薬情報学連合大会2014
  • 発表場所: 仙台国際センター
  • 年月日: 2014-10-02 – 2014-10-04
• [学会発表] CancerProViewのさらなる機能拡張 (2014)
  • 著者名/発表者名: 満山 進, 清水信義
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-09-25
• [学会発表] がん関連疾患遺伝子／タンパク質相互作用データベース CancerProView (2013)
  • 著者名/発表者名: 満山 進, 清水信義
  • 学会等名: 第 20回日本遺伝子診療学会大会
  • 発表場所: アクトシティ浜松コングレスセンター
• [学会発表] CancerProView: The cancer-related gene/protein interaction pathway image database system. (2013)
  • 著者名/発表者名: Susumu Mitsuyama, Nobuyoshi Shimizu
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] New features of cancer-related protein / gene database "CancerProView" (2013)
  • 著者名/発表者名: Susumu Mitsuyama, Nobuyoshi Shimizu
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] Comparative analysis of the functional domains of various cancer-related proteins by CancerProView (2012)
  • 著者名/発表者名: Susumu Mitsuyama, Nobuyoshi Shimizu
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
• [備考] CancerProView
  • URL: http://cancerproview.dmb.med.keio.ac.jp