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トランスクリプトーム解析によるエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24870002
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 生態・環境
研究機関北海道大学

研究代表者

松波 雅俊  北海道大学, 大学院水産科学研究院, 博士研究員 (60632635)

研究期間 (年度) 2012-08-31 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードバイオインフォマティクス / 生態発生学 / 表現型可塑性 / 両生類 / 個体群生態学 / サンショウウオ / RNA-seq / 捕食者・被食者
研究概要

同一のゲノム情報をもつにも関わらず、環境の変化に応じて表現型を変化させる表現型可塑性と呼ばれる。北海道に生息する有尾両生類であるエゾサンショウウオ(Hynobius retardatus)の幼生は、被食者であるカエル幼生・捕食者であるヤゴの存在や個体群密度に応じて、明瞭な表現型可塑性を示す。本研究では、このエゾサンショウウオをモデルとして、表現型可塑性の分子基盤を解明することを目的とした。上記の目的を達成するために、生態学的な野外におけるサンプルの採集から、トランスクリプトーム解析まで一通りの実験をおこなった。この実験を通して、可塑性の原因となる可能性がより高い候補遺伝子が明らかになった。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 学会発表 (22件)

  • [学会発表] Eco-evo-devo study of phenotypic plasticity in the Hokkaido salamander (Hynobius retardatus)2014

    • 著者名/発表者名
      Matsunami M, Kishida O, Kitano J, Nozawa M, Igawa T, Michimae H, Miura T, Nishimura K
    • 学会等名
      International Symposium"Frontiers in Amphibian Biology : Endangered Species Conservation and Genome Editing"
    • 発表場所
      Hiroshima (Japan)(P-26)
    • 年月日
      2014-03-27
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2014

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,岸田治,北野潤,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      日本生態学会第61回全国大会
    • 発表場所
      広島(広島)(D2-08)
    • 年月日
      2014-03-18
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2014

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,岸田治,北野潤,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      第5回生命情報科学若手の会
    • 発表場所
      検見川(千葉)(LT2)
    • 年月日
      2014-02-18
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2014

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      第5回生命情報科学若手の会
    • 発表場所
      東京大学検見川セミナーハウス(千葉県千葉市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2014

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      日本生態学会第61回全国大会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島県広島市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Eco-evo-devo study of phenotypic plasticity in the Hokkaido salamander (Hynobius retardatus).2014

    • 著者名/発表者名
      Matsunami M, Kishida O, Kitano J, Nozawa M, Igawa T, Michimae H, Miura T, Nishimura K
    • 学会等名
      International Symposium “Frontiers in Amphibian Biology: Endangered Species Conservation and Genome Editing”
    • 発表場所
      Hiroshima University (Hiroshima, Japan)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム情報から探る脊椎動物の進化2013

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      第8回EZOゼミ
    • 発表場所
      札幌(北海道)
    • 年月日
      2013-10-31
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,岸田治,北野潤,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      第29回個体群生態学会大会
    • 発表場所
      堺(大阪)(P04)
    • 年月日
      2013-10-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,岸田治,北野潤,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      NGS現場の会第3回研究会
    • 発表場所
      神戸(兵庫)(3-24-A)
    • 年月日
      2013-09-04
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,岸田治,北野潤,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      日本進化学会第15回大会
    • 発表場所
      つくば(茨城)(3B-04)
    • 年月日
      2013-08-30
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Transcriptome analysis of predator- and prey-induced phenotypic plasticity in the Hokkaido Salamander (Hynobius retardatus)2013

    • 著者名/発表者名
      Matsunami M, Kishida O, Kitano J, Michimae H, Miura T, Nishimura K
    • 学会等名
      XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology
    • 発表場所
      Lisbon (Portugal)
    • 年月日
      2013-08-22
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で明らかになったエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,岸田治,北野潤,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      日本生態学会第60回全国大会
    • 発表場所
      静岡(静岡)(W34)
    • 年月日
      2013-03-07
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で明らかになったエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,岸田治,北野潤,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      第4回生命情報科学若手の会
    • 発表場所
      岡崎(愛知)(LT2)
    • 年月日
      2013-03-02
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Transcriptome analysis of predator- and prey-induced phenotypic plasticity in the Hokkaido Salamander (Hynobius retardatus)2013

    • 著者名/発表者名
      Matsunami M, Kishida O, Kitano J, Michimae H, Miura T, Nishimura K.
    • 学会等名
      XIV Congress of the European Society for Evolutionary Biology
    • 発表場所
      University of Lisbon (Lisbon, Portugal)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      日本進化学会第15回大会
    • 発表場所
      筑波大学(茨城県つくば市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      NGS現場の会第3回研究会
    • 発表場所
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で迫るエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      第29回個体群生態学会大会
    • 発表場所
      大阪府立大学(大阪府堺市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム情報から探る脊椎動物の進化2013

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊
    • 学会等名
      第8回EZOゼミ
    • 発表場所
      北海道大学(北海道札幌市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で明らかになったエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      第4回生命情報科学若手の会
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で明らかになったエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      日本生態学会第60回全国大会
    • 発表場所
      グランシップ静岡(静岡県静岡市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析によるエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構の解明2012

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊,北野潤,岸田治,道前洋史,三浦徹,西村欣也
    • 学会等名
      平成24年度新学術領域「ゲノム・遺伝子相関」若手の会
    • 発表場所
      米原(滋賀)(#22)
    • 年月日
      2012-11-01
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析によるエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構の解明2012

    • 著者名/発表者名
      松波 雅俊, 岸田 治, 北野 潤, 道前 洋史, 三浦 徹, 西村 欣也
    • 学会等名
      平成24年度新学術領域「ゲノム・遺伝子相関」若手の会
    • 発表場所
      エクシブ琵琶湖(滋賀県米原市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-11-27   更新日: 2019-07-29  

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