| 研究課題/領域番号 |
25289172
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 一部基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
土木環境システム
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| 研究機関 | 愛媛大学 |
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研究代表者 |
渡辺 幸三 愛媛大学, 理工学研究科, 准教授 (80634435)
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| 研究分担者 |
大村 達夫 東北大学, 未来科学技術共同研究センター, 教授 (30111248)
加藤 幹男 大阪府立大学, 高等教育推進機構, 教授 (30204499)
三宅 洋 愛媛大学, 理工学研究科, 准教授 (90345801)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2015年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2014年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2013年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
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| キーワード | DNA種分類 / 次世代シークエンシング / 底生動物 / 河川 / 種多様性 / 系統発生 / 系統進化 / 生態学 / 遺伝子 / 進化 / 生物多様性 / 土木環境システム |
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| 研究成果の概要 |
愛媛県重信川の１０地点に生息する河川底生動物群集を対象に，大量のDNA塩基配列を一度に解読する次世代シークエンシング解析を活用し，迅速に種数を評価した．従来の顕微鏡を使った形態同定の結果，採取された8,921個体から64分類群が発見された．それに対して，ミトコンドリアDNAのCOI領域（658塩基長）を対象とした次世代シークエンシング解析で得られた165,508配列の内，DNAバーコーディングにより39,337配列から成る128種が同定された．また，各分類群における個体数とDNA配列数に正の相関が見られた．またDNA種分類法（PTPモデル）を適用した結果，298種の存在が推定された．
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