Sox転写因子とmicroRNAが構成する遺伝子制御ネットワークの解明

• 研究課題/領域番号: 25290066
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 高知工科大学 (2015-2016); 大阪大学 (2013-2014)
• 研究代表者: 蒲池 雄介 高知工科大学, 環境理工学部, 教授 (90263334)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 18,330千円 (直接経費: 14,100千円、間接経費: 4,230千円); 2015年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2014年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円); 2013年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
• キーワード: 転写因子 / microRNA / 遺伝子 / 発生・分化 / ゲノム

研究成果の概要

microRNAは機能性小分子RNAで、細胞の分化や増殖に重要な役割を持つが、この遺伝子群の発現が胚発生過程でどのように制御されているのかは多くの場合不明である。本研究では、脊椎動物の胚発生に必須であるとともに、がんmicroRNAとしても注目されているmir-17-92クラスター遺伝子を中心にしてmicroRNA遺伝子群の発現制御機構を調べ、複数のmicroRNA遺伝子の発現制御にSox転写因子群が関係していることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Regulation of trunk neural crest delamination by δEF1 and Sip1 in the chicken embryo (2016)
  • 著者名/発表者名: Yasumi, T., Inoue, M., Maruhashi, M., Kamachi, Y., Higashi, Y., Kondoh, H., Uchikawa, M.
  • 雑誌名: Dev. Growth. Differ. 巻: 58 号: 2 ページ: 205-214
  • DOI: 10.1111/dgd.12256
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sox proteins: regulators of cell fate specification and differentiation (2013)
  • 著者名/発表者名: Kamachi Y, Kondoh H
  • 雑誌名: Development 巻: 140 号: 20 ページ: 4129-4144
  • DOI: 10.1242/dev.091793
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nano-analysis of DNA conformation changes induced by transcription factor complex binding using plasmonic nanodimers (2013)
  • 著者名/発表者名: Morimura H, Tanaka S, Ishitobi H, Mikami T, Kamachi Y, Kondoh H, Inouye Y.
  • 雑誌名: ACS Nano 巻: 7 号: 12 ページ: 10733-10740
  • DOI: 10.1021/nn403625s
  • 査読あり
• [学会発表] Cooperative activation of Sall4 and Sox8 transcription factors in the regulation of the chicken Sox3 gene during inner ear development (2017)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, Y.,, Nishimura, N., Matsuda K., Ranawakage, D., Kamachi, Y., Kondoh, H., and Uchikawa, M.
  • 学会等名: Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biology
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2017-05-10
• [学会発表] ゼブラフィッシュの眼とヒレの発生におけるSox11転写因子の役割 (2014)
  • 著者名/発表者名: 蒲池 雄介
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Molecular functions of Sox11 in zebrafish development: focus on retina and fin development (2014)
  • 著者名/発表者名: Kamachi, Yusuke
  • 学会等名: 4th International SOX Research Conference
  • 発表場所: Cleveland, USA
  • 年月日: 2014-09-09 – 2014-09-12
• [学会発表] Sox11 に依存した miRNA-17-92 クラスター発現の制御機構
  • 著者名/発表者名: 川合 杏奈, 近藤 寿人, 蒲池 雄介
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県）
• [図書] Sox2: Biology and Role in Development and Disease. (Editors: Kondoh and Lovell-Badge) (2015)
  • 著者名/発表者名: Kamachi, Y. (Chapter 6: Evolution of Sox2 and Functional Redundancy in Relation to Other SoxB1 Genes)
  • 総ページ数: 344
  • 出版者: Elsevier
• [図書] Sox2: Biology and Role in Development and Disease. (Editors: Kondoh and Lovell-Badge) (2015)
  • 著者名/発表者名: kondoh, H. and Kamachi, Y. (Chapter 8: SOX2-Partner Factor Interactions and Enhancer Regulation)
  • 総ページ数: 344
  • 出版者: Elsevier