染色体相互認識に寄与する染色体集積RNAの作用機構解析

• 研究課題/領域番号: 25291079
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 遺伝・染色体動態
• 研究機関: 国立研究開発法人情報通信研究機構
• 研究代表者: 丁 大橋 国立研究開発法人情報通信研究機構, 未来ICT研究所フロンティア創造総合研究室, 主任研究員 (50359080)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円); 2016年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円); 2015年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2014年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2013年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
• キーワード: 染色体 / 減数分裂 / 対合 / 非コードRNA / 分裂酵母

研究成果の概要

減数分裂における相同染色体の対合は相同組み換えと還元型染色体分配にとって非常に重要である。減数分裂時における相同組換えには、まず相同染色体が互いに見つけて対合することが必要である。しかし、相同染色体同士が如何にしてお互いを認識するのかは全く解明されていない。本研究では、分裂酵母における相同染色体の対合にロバストな対合サイト、sme2対合サイトに寄与するタンパク質因子を複数同定した。さらにそれらの対合に寄与するタンパク質因子の染色体結合サイトを同定した上、ゲノムワイドのlacOアレー挿入ライブラリを作成することによって新規のncRNAによって制御される対合サイトを同定した。

研究成果

• [雑誌論文] A cohesion-based platform for homologous chromosome pairing in meiosis (2016)
  • 著者名/発表者名: Da-Qiao Ding, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
  • 雑誌名: Current Genetics 巻: 印刷中 号: 3 ページ: 499-502
  • DOI: 10.1007/s00294-016-0570-x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meiotic cohesion-based chromosome structure is essential for homologous chromosome pairing in Schizosaccharomyces pombe (2015)
  • 著者名/発表者名: Ding DQ, Matsuda A, Okamasa K, Nagahama Y, Haraguchi T, Hiraoka Y
  • 雑誌名: Chromosoma 巻: special issue 号: 2 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1007/s00412-015-0551-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Highly condensed chromatins are formed adjacent to subtelomeric and decondensed silent chromatin in fission yeast. (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsuda A, Chikashige Y, Ding DQ, Ohtsuki C, Mori C, Asakawa H, Kimura H, Haraguchi T, Hiraoka Y.
  • 雑誌名: Nature Communication 巻: 6 号: 1 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1038/ncomms8753
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The role of chromosomal retention of noncoding RNA in meiosis (2013)
  • 著者名/発表者名: Ding DQ, Haraguchi T, Hiraoka Y.
  • 雑誌名: Chromosome Res. 巻: 21 号: 6-7 ページ: 665-672
  • DOI: 10.1007/s10577-013-9389-1
  • 査読あり
• [学会発表] 減数分裂期前期相同染色体対合に寄与する因子の特定と解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋、岡正華澄、長濱有紀、原口徳子、平岡 泰
  • 学会等名: 酵母遺伝学フォーラム第49回研究報告会
  • 発表場所: シーサイドホテル舞子ビラ、神戸市垂水区、兵庫県
• [学会発表] 減数分裂期前期相同染色体対合に寄与する ncRNA及び制御因子の特定と解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋、岡正華澄、長濱有紀、原口徳子、平岡 泰
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜市西区、神奈川県
• [学会発表] 3D-SIM Analysis of Meiotic Chromosome Structure in Live Cells of S. pombe (2015)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋
  • 学会等名: EMBO Conference on Meiosis
  • 発表場所: University of Oxford, Oxford, UK
  • 年月日: 2015-09-01
  • 国際学会
• [学会発表] 相同染色体認識における 非コードDNAの役割 (2015)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋
  • 学会等名: 第9回 非コードDNA班会議 ＆ 第2回 国際シンポジウム
  • 発表場所: 兵庫県淡路市夢舞台 淡路夢舞台国際会議場
  • 年月日: 2015-08-05
• [学会発表] 3D-SIM Analysis of Meiotic Chromosome Structure in Live Cells of S.pombe (2015)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋
  • 学会等名: Pombe 2015 8TH INTERNATIONAL FISSION YEAST MEETING
  • 発表場所: 兵庫県神戸市中央区 生田神社会館
  • 年月日: 2015-06-22
  • 国際学会
• [学会発表] A role for chromosomal RNA bodies in fission yeast meiosis (2014)
  • 著者名/発表者名: 平岡 泰
  • 学会等名: 第３７回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神奈川県横浜市みなとみらい
  • 年月日: 2014-11-27
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: 第３７回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神奈川県横浜市みなとみらい
  • 年月日: 2014-11-26
• [学会発表] 相同染色体対合における非コードDNAの役割 (2014)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: 新学術領域研究 「ゲノムを支える非コードDNA領域の機能」 2014年第7回領域会議
  • 発表場所: 神奈川県湯河原温泉ホテルあかね
  • 年月日: 2014-07-14
• [学会発表] Fine structures of meiosis-specific chromosome and homologous chromosome pairing in S. pombe (2014)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: Gordon Research Conferences Meiosis
  • 発表場所: Colby-Saweyer College, New London, NH, USA
  • 年月日: 2014-06-02
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の３D-SIM解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: 「ゲノムを支える非コードＤＮＡ領域の機能」公開シンポジウム インターメアによる染色体制御機構
  • 発表場所: 東京大学山上会館、東京都文京区
• [学会発表] 相同染色体認識における 非コードDNAの役割 (2013)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: 「ゲノムを支える非コードDNA 領域の機能」 第5回領域会議
  • 発表場所: 湘南国際村、神奈川県三浦郡葉山町
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の３D-SIM解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: 第31回染色体ワークショップ・第12回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ホテルおかだ、神奈川県足柄下郡
• [学会発表] Fine structures of meiosis-specific chromosome and homologous chromosome pairing in S. pombe (2013)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: Pombe 2013 (7th International Fission Yeast Meeting)
  • 発表場所: University of London, UK
• [学会発表] Live and 3D structured illumination microscopy revealed dynamic and highly organized meiotic specific chromosome architectures in fission yeast (2013)
  • 著者名/発表者名: 丁 大橋
  • 学会等名: The 4th Xiamen Winter Symposium
  • 発表場所: Xiamen University,Xiamen,China
  • 招待講演
• [図書] Visualization of a Specific Genome Locus by the lacO/Lacl-GFP System. In Fission Yeast: A Laboratory Manual (2016)
  • 著者名/発表者名: Ding DQ, Hiraoka Y
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: Cold Spring Harbor Laboratory Press
• [図書] Microscopic Observation of Living Cells Stained with Fluorescent Probes. In Fission Yeast: A Laboratory Manual (2016)
  • 著者名/発表者名: Asakawa H, Ding DQ, Haraguchi T, Hiraoka Y
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: Cold Spring Harbor Laboratory Press
• [備考] Cell Magic
  • URL: http://www2.nict.go.jp/frontier/seibutsu/CellMagic/index.html
• [備考] Cell Magic
  • URL: http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/index.html
• [備考] Cell Magic
  • URL: http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/
• [備考] CellMagic
  • URL: http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/