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ヒラメにおけるウイルス耐病性遺伝子の単離

研究課題

研究課題/領域番号 25292118
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 水圏生産科学
研究機関東京海洋大学

研究代表者

坂本 崇  東京海洋大学, その他部局等, 教授 (40313390)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円)
2015年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2014年度: 8,840千円 (直接経費: 6,800千円、間接経費: 2,040千円)
2013年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
キーワードウイルス / 耐病性 / 遺伝子 / ゲノム / 育種 / ヒラメ / マーカー選抜 / SNP / マーカー選抜育種 / MAS
研究成果の概要

ヒラメは、日本、韓国、中国などで重要な養殖魚類である。リンホシスチス病は、ヒラメ養殖に損失を与えており、対策が必要な疾病の一つである。本研究課題では、連鎖解析法、遺伝子発現法、塩基配列解析法を用いて、本疾病に対する耐病性候補遺伝子の単離を行った。連鎖解析法により、リンホシスチス耐病性遺伝子座は、1.1cM (約134kb)まで限局化することが出来た。リンホシスチス耐病性遺伝子座から、11遺伝子のcDNAを単離した。遺伝子発現解析法および塩基配列解析法の結果、2遺伝子が耐病性候補遺伝子として考えられた。耐病性候補遺伝子に関連すると考えられるSNPの天然集団における保有率は約2%と考えられた。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Yellow Sea Fisheries Research Institute(China)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Genome-Wide SNP Identification for the Construction of a High-Resolution Genetic Map of Japanese Flounder (Paralichthys olivaceous): applications to QTL Mapping of Vibrio anguillarum Disease Resistance and Comparative Genomic Analysis.2015

    • 著者名/発表者名
      C. Shao, Y. Niu, P. Rastas, Y. Liu, Z. Xie, H. Li, L. Wang, Y. Jiang, S. Tai, Y. Tian, T. Sakamoto and S. Chen.
    • 雑誌名

      DNA Research

      巻: 22 (2) 号: 2 ページ: 161-170

    • DOI

      10.1093/dnares/dsv001

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 養殖魚類における遺伝情報を活用したゲノム育種研究の現状と展望2016

    • 著者名/発表者名
      坂本崇
    • 学会等名
      魚類防疫士連絡協議会 講演会
    • 発表場所
      東京都中央区
    • 年月日
      2016-03-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒラメのリンホシスチス病抵抗性候補領域内に存在する遺伝子の単離と配列解析2015

    • 著者名/発表者名
      中嶋彩奈・法橋亜矢子・佐野元彦・坂本崇
    • 学会等名
      日本水産学会
    • 発表場所
      宮城県仙台市(東北大学)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] CONVENIENT PHYSICAL GENOME MAP OF FLOUNDER. A PRACTICAL WHOLE- GENOME RADIATION HYBRID MAP OF JAPANESE FLOUNDER.2015

    • 著者名/発表者名
      Okamoto H., Aoki J., Nozaki T., Ozaki A., Uji S., Fuji K., Sakamoto T., Okamoto N., Kawai J., Araki K., Ekker M.
    • 学会等名
      THE INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GENETICS IN AQUACULTURE XII
    • 発表場所
      SANTIAGO DE COMPOSTELA, SPAIN
    • 年月日
      2015-06-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒラメリンホシスチス病抵抗性遺伝子座領域に存在する候補遺伝子の発現解析2014

    • 著者名/発表者名
      法橋亜矢子、杉森信哉、長谷川理、Changwei Shao、 Songlin Chen、佐野元彦、坂本崇
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会第15回大会
    • 発表場所
      埼玉県和光市(理化学研究所)
    • 年月日
      2014-10-31 – 2014-11-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2013-05-21   更新日: 2019-07-29  

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