遺伝子発現エントロピー解析による腫瘍不均一性の検証

• 研究課題/領域番号: 25430139
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 腫瘍診断学
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 涌井 昌俊 慶應義塾大学, 医学部, 講師 (90240465)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: がんの個性診断 / 腫瘍不均一性 / 遺伝子発現 / エントロピー / 情報理論 / 代謝経路 / トランスクリプトーム / シャノンのエントロピー / 相互情報量 / ヒトがん細胞株 / 癌

研究成果の概要

シャノンのエントロピーや相互情報量に代表される情報理論を応用して、個々の生物学的経路ごとのトランスクリプトームに反映される腫瘍不均一性を定量することに成功した。事実、複数のヒトがん細胞株の間や異なる酸素環境条件の培養の間で、腫瘍不均一性に富む代謝経路および乏しい代謝経路が検出された。これらの結果は代謝生物学的見地からの腫瘍不均一性への洞察を与え、診断・治療への応用の可能性を示唆する。

研究成果

• [雑誌論文] nnate Response to Human Cancer Cells with or without IL-2 Receptor Common γ-Chain Function in NOD Background Mice Lacking Adaptive Immunity. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nishime C, Kawai K, Yamamoto T, Katano I, Monnai M, Goda N, Mizushima T, Suemizu H, Nakamura M, Murata M, Suematsu M, Wakui M.
  • 雑誌名: J Immunol 巻: 195 号: 4 ページ: 1883-1890
  • DOI: 10.4049/jimmunol.1402103
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Bevacizumab terminates homeobox B9-induced tumor proliferation by silencing microenvironmental communication. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshinori Hoshino, Tetsu Hayashida, Akira Hirata, Hidena Takahashi, Naokazu Chiba, Mitsuyo Ohmura, Masatoshi Wakui, Hiromitsu Jinno, Hirotoshi Hasegawa, Shyamala Maheswaran, Makoto Suematsu, Yuko Kitagawa,
  • 雑誌名: Molecular Cancer 巻: 13(1) 号: 1 ページ: 102-102
  • DOI: 10.1186/1476-4598-13-102
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Lewis Lung Carcinoma Progression Is Facilitated by TIG-3 Fibroblast Cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi Y, Izumi Y, Asakura K, Kawai K, Wakui M, Ohmura M, Suematsu M, Nomori H
  • 雑誌名: Anticancer Res. 巻: 33 ページ: 3791-3798
  • 査読あり
• [学会発表] Innate Effector Mechanisms for Elimination of Human Cancer Cells in the NOD-Background Mice Lacking Adaptive Immunity. (2016)
  • 著者名/発表者名: Nishime C, Wakui M, Kawai K, Yamamoto T, Katano I, Monnai M, Goda N, Mizushima T, Suemizu H, Nakamura M, Murata M, Suematsu M
  • 学会等名: 5th International Workshop on Humanized Mice (IWHM5)
  • 発表場所: チューリッヒ（スイス）
  • 年月日: 2016-01-28
  • 国際学会