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ミクロゲノミクスとミクロプロテオミクスから、癌前駆細胞マーカーを見つけ出す

研究課題

研究課題/領域番号 25430142
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 腫瘍診断学
研究機関日本大学

研究代表者

江角 真理子  日本大学, 医学部, 准教授 (10147019)

研究分担者 杉谷 雅彦  日本大学, 医学部, 教授 (40187654)
連携研究者 高山 忠利  日本大学, 医学部, 教授 (30280994)
黒田 和道  日本大学, 医学部, 准教授 (50215109)
山口 裕美  日本大学, 医学部, 研究員 (90547118)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワードレーザーマイクロダイセクション / プロテオミクス / 微小環境 / 再発肝癌 / ゲノミクス / 次世代シーケンサー / ホルマリン固定パラフィン包埋切片 / レーザーマイクロダイセク ション
研究成果の概要

がんの発生と進展過程を分子レベルで捉えるため、顕微鏡下で各段階の細胞や組織を採取し、その超微量検体から包括的にタンパク質や遺伝子の異常を見つけ比較した。その結果は次のとおりである。(1)肝がんの発生や転移のしやすさは、がん化する細胞の周囲=微小環境が関与する。(2)癌とも正常ともいえない病変部(異形成)は、がんと共通する遺伝子変異があり、がん発生の起源といえる。そこからがんは、異なる遺伝子変異で複数か所に発生し、起源は異なることがある。(3)2cm以下の早期がんでも場所により遺伝子変異が異なり、がん多様性の開始は早い。(4)肝発がんモデルでは、がん化を決める遺伝子変異の数は少なかった。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (17件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Pitfalls of DNA quantification using DNA-binding fluorescent dyes and suggested solutions2016

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Y, Yamaguchi H, Einaga N, Esumi M
    • 雑誌名

      PLos One

      巻: 11 号: 3 ページ: e0150528-e0150528

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0150528

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Transmembrane serine protease TMPRSS2 activates hepatitis C virus infection.2015

    • 著者名/発表者名
      Esumi M, Ishibashi M, Yamaguchi H, Nakajima S, Tai Y, Kikuta S, Sugitani M, Takayama T, Tahara M, Takeda M, Wakita T
    • 雑誌名

      Hepatology

      巻: 61(2) 号: 2 ページ: 438-47

    • DOI

      10.1002/hep.27426

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] CLEC4M-positive and CD81-negative Huh7 cells are not susceptible to JFH-1 HCVcc infection but mediate transinfection.2014

    • 著者名/発表者名
      Ishibashi M, Morita N, Nomura-Kawaguchi C, Shimizu Y, Wakita T, Esumi M.
    • 雑誌名

      Archives of Virology

      巻: 159 号: 11 ページ: 2949-2955

    • DOI

      10.1007/s00705-014-2150-z

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Protein from the fraction remaining after RNA extraction is useful for proteomics but care must be exercised in its application.2013

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H, Hasegawa K, Esumi M.
    • 雑誌名

      Experimental and Molecular Pathology

      巻: 95巻 ページ: 46-50

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] β-Glucuronidase is a suitable internal control gene for mRNA quantitation in pathophysiological and non-pathological livers.2013

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H, Matsumoto S, Ishibashi M, Hasegawa K, Sugitani M, Takayama T, Esumi M.
    • 雑誌名

      Experimental and Molecular Pathology

      巻: 95巻 号: 2 ページ: 131-135

    • DOI

      10.1016/j.yexmp.2013.06.005

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] TMPRSS2 is an activating protease for respiratory parainfluenza viruses.2013

    • 著者名/発表者名
      Abe M, Tahara M, Sakai K, Yamaguchi H, Kanou K, Shirato K, Kawase M, Noda M, Kimura H, Matsuyama S, Fukuhara H, Mizuta K, Maenaka K, Ami Y, Esumi M, Kato A, Takeda M.
    • 雑誌名

      J Virol

      巻: 87 号: 21 ページ: 11930-11935

    • DOI

      10.1128/jvi.01490-13

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ミトコンドリアDNA多型と癌関連遺伝子体細胞突然変異解析を併用した乳管癌小葉癌併存症例の分子系統樹解析2016

    • 著者名/発表者名
      野田博子、江角眞理子、中井登紀子、増田しのぶ
    • 学会等名
      第105回日本病理学会総会
    • 発表場所
      宮城県・仙台・仙台国際センター
    • 年月日
      2016-05-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 口腔癌の遺伝子変異解析によるintratumoral heterogeneityと形態学的特徴.2016

    • 著者名/発表者名
      末光正昌、山本泰、飯塚普子、山口桜子、小宮正道、野田博子、山口裕美、江角眞理子、久山佳代
    • 学会等名
      第70回日本口腔科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡県・福岡市・福岡県歯科医師会館
    • 年月日
      2016-04-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 様々な条件のゲノムDNAが示すquality control値の落とし穴2015

    • 著者名/発表者名
      中山裕貴、山口裕美、栄永直樹、江角眞理子
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      兵庫県・神戸市・神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 早期再発肝癌に亢進していたTransglutaminase 2 (TGM2)と上皮間葉転換(EMT)とは関連するか?2015

    • 著者名/発表者名
      山口裕美、黒田和道、廣谷ゆかり、杉谷雅彦、長谷川潔、高山忠利、江角眞理子
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      兵庫県・神戸市・神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 肝臓HCV量の違いでみられる、肝組織免疫応答系の違いとは?2015

    • 著者名/発表者名
      石橋真理子、山口裕美、廣谷ゆかり、杉谷雅彦、高山忠利、江角眞理子
    • 学会等名
      第63回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      福岡県・福岡市・福岡国際会議場
    • 年月日
      2015-11-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 乳管乳管癌と小葉癌併存症例の分子系統樹解析: FFPE/レーザーマイクロダイセクションサンプルのミトコンドリアDNA多型から2015

    • 著者名/発表者名
      野田博子、江角眞理子、山口裕美、増田しのぶ
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      愛知県・名古屋市・名古屋国際会議場
    • 年月日
      2015-10-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] がんおよびがん関連組織の分子進化: FFPE/レーザーマイクロダイセクションサンプルのゲノム比較解析から2015

    • 著者名/発表者名
      江角眞理子、野田博子、末光正昌、久山佳代、増田しのぶ
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      愛知県・名古屋市・名古屋国際会議場
    • 年月日
      2015-10-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Long Evans Cinnamon (LEC) ratの肝臓癌ゲノム解析2015

    • 著者名/発表者名
      山口裕美、栄永直樹、中山裕貴、川路美子、江角眞理子
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      愛知県・名古屋市・名古屋国際会議場
    • 年月日
      2015-10-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織DNAのゲノム解析に問題はないか?2015

    • 著者名/発表者名
      栄永直樹、山口裕美、中山裕貴、川路美子、佐々木泰史、時野隆至、江角眞理子
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      愛知県・名古屋市・名古屋国際会議場
    • 年月日
      2015-10-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織DNAの変異解析について2014

    • 著者名/発表者名
      栄永直樹、山口裕美、吉田明生、末光正昌、野田博子、川路美子、廣谷ゆかり、江角眞理子
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Golgi membrane protein 1(GOLM1)はC型肝炎ウイルス感染に関与するか?2014

    • 著者名/発表者名
      山口裕美、 黒田和道、脇田隆字、江角眞理子
    • 学会等名
      第62回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-11-11
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 多臓器に転移した肺小細胞がんのゲノム比較解析:レーザーマイクロダイセクション/FFPEサンプルを用いて.2014

    • 著者名/発表者名
      吉田明生、尾花ゆかり、長岡正宏、徳橋泰明、江角眞理子
    • 学会等名
      第73回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Role of Golgi Membrane Protein 1 in Hepatitis C Virus Replication.2014

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H, Kuroda K, Wakita T, Esumi M.
    • 学会等名
      21th International Symposium in Hepatitis C Virus and Related Viruses.
    • 発表場所
      The Fairmont Banff Springs (Banff, Canada)
    • 年月日
      2014-09-08
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] レーザーマイクロダイセクションとプロテオミクスの融合解析から肝細胞癌再発(発癌)に関連する微小環境因子を探る.

    • 著者名/発表者名
      江角 眞理子、山口 裕美、 黒田 和道、 尾花 ゆかり、 渕之上 史、 杉谷 雅彦、 藤原 恭子、 高山 忠利.
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Liver microenvironment related to hepatitis C virus loads examined by proteomics of laser-microdissected tissue samples.

    • 著者名/発表者名
      Esumi M, Yamaguchi H, Kuroda K, Obana Y, Sugitani M, Takayama T.
    • 学会等名
      20th International Symposium in Hepatitis C Virus and Related Viruses
    • 発表場所
      Melbourne Convention and Exhibition Centre (Melbourne, Australia)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] C型肝炎ウイルス感染量と関連するヒト肝組織微小環境と肝実質のheterogeneity:レーザーマイクロダイセクション・プロテオミクスから.

    • 著者名/発表者名
      江角眞理子、山口裕美、黒田和道、尾花ゆかり、杉谷雅彦、高山忠利
    • 学会等名
      第61回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 様々な条件のホルマリン固定パラフィン包埋組織から抽出されたDNAの質的量的評価について.

    • 著者名/発表者名
      江角眞理子、吉田明生、遠藤美智子、山口裕美、栄永直樹、尾花ゆかり、増田しのぶ、徳橋泰明
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [図書] E型肝炎の疫学.新ウイルス性肝炎学 -最新の基礎・臨床研究情報- 日本臨床73巻(増刊号)2015

    • 著者名/発表者名
      江角眞理子
    • 出版者
      日本臨床社
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] 「ミクロゲノミクス」から、がんheterogeneityの分子基盤を解明する. 日本大学医学部総合医学研究所紀要2015

    • 著者名/発表者名
      江角眞理子、山口裕美、栄永直樹、中山裕貴、高山忠利、杉谷雅彦、野田博子、増田しのぶ、末光正昌、久山佳代、吉田明生、徳橋泰明
    • 出版者
      日本大学医学部総合医学研究所
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 日本大学医学部病態病理学系形態機能病理学分野ホームページ

    • URL

      http://www.med.nihon-u.ac.jp/department/pathol_m/

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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