次世代シークエンサーを用いた死後microRNAの網羅的検索とその法医学的応用

• 研究課題/領域番号: 25460860
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 法医学
• 研究機関: 関西医科大学
• 研究代表者: 橋谷田 真樹 関西医科大学, 医学部, 准教授 (40374938)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2013年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: マイクロRNA / ラット / 次世代シークエンサー / 死後のストレスマーカー / 死後経過時間推定 / microRNA / 死後経過時間 / TaqMan法

研究成果の概要

1本鎖のノンコーディングRNAであるmicroRNA(miRNA)は，鎖長が約20塩基と非常に短いため，死後，安定して残存するものがある．そこで本研究ではラットを用いた動物実験により，死後経過時間と生前のストレス程度を反映する生体マーカーとなるmiRNAの探索を行った．心臓ではmiR-16，肝臓ではmiR-21，血液ではmiR-451を内部標準とすると，死後経過時間と不安定な細胞質RNAとの間に良い相関が得られた．また，ラットにストレス（飲酒・運動・拘束）を与えて次世代シークエンサーで解析したところ，ストレスで増減する数種類のmiRNAが検出された．

研究成果

• [雑誌論文] The comprehensive analysis of microRNA in hearts of stress model rat. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Tadashi Hosoya, Atsushi Akane, Tomohiro Matsumoto, Sumitaka Yoshimura, Takuma Tokiyasu, Masato Funayama.
  • 雑誌名: Forensic Science International: Genetics Supplement Series 巻: 5 ページ: e557-e558
  • DOI: 10.1016/j.fsigss.2015.09.220
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 死後経過時間に伴うラット血中micro RNA (miRNA) の挙動. (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 赤根敦, 吉田学, 吉村澄孝, 時安太久磨, 細谷直, 舟山眞人.
  • 雑誌名: DNA多型 巻: 23 ページ: 169-170
  • 査読あり
• [雑誌論文] 食餌性イレウスを引き起こした原因物質のDNAバーコードによる同定. (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 赤根敦, 松本智寛, 吉村澄孝, 時安太久磨, 松井俊樹, 那谷雅之.
  • 雑誌名: 法医学の実際と研究 巻: 58 ページ: 155-159
  • 査読あり
• [雑誌論文] 異同識別におけるY-STR一致の意味とその評価. (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 赤根敦, 吉田学, 吉村澄孝, 時安太久磨, 真鍋翔, 玉木敬二.
  • 雑誌名: DNA鑑定 巻: 7 ページ: 19-25
  • NAID: 40020708402
  • 査読あり
• [雑誌論文] 合成カンナビノイド中毒と交通事故. (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本智寛, 橋谷田真樹, 赤根敦.
  • 雑誌名: 中毒研究 巻: 28 ページ: 333-338
  • NAID: 40020680915
  • 査読あり
• [雑誌論文] 2.死後経過時間推定マーカーとしてのmicroRNA(miRNA)の評価 (2014)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹，臼井聖尊，大内 司，林崎義映，細谷 直，池田知哉，猪狩 由，荒牧友美，境 純，舟山眞人．
  • 雑誌名: DNA多型 巻: 22 ページ: 178-180
  • 査読あり
• [学会発表] 法遺伝学における最近のトピック (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹
  • 学会等名: DNA鑑定学会第８回大会
  • 発表場所: 発明会館，東京
  • 年月日: 2015-12-09
  • 招待講演
• [学会発表] ストレスモデルラットにおけるmicroRNA（miRNA）の発現変化. (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 赤根敦, 松本智寛, 吉村澄孝, 時安太久磨, 細谷直, 舟山眞人.
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第24回学術集会
  • 発表場所: 岡山大学創立五十周年記念館，岡山
  • 年月日: 2015-11-19
• [学会発表] The comprehensive analysis of microRNA in hearts of stress model rat. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Tadashi Hosoya, Atsushi Akane, Tomohiro Matsumoto, Sumitaka Yoshimura, Takuma Tokiyasu, Masato Funayam
  • 学会等名: The final Annual Meeting of Molecular Imaging Center of Diseases
  • 発表場所: Kansai Medical University, HIrakata, Japan.
  • 年月日: 2015-11-13
• [学会発表] The comprehensive analysis of microRNA in hearts of stress model rat. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masaki Hashiyada, Tadashi Hosoya, Atsushi Akane, Tomohiro Matsumoto, Sumitaka Yoshimura, Takuma Tokiyasu, Masato Funayam
  • 学会等名: 26th Congress of the International Society for Forensic Genetics
  • 発表場所: The Auditorium Maximum of the Jagiellonian University, Krakow, Poland.
  • 年月日: 2015-09-01
  • 国際学会
• [学会発表] 次世代シークエンサー（Ion PGM^TM）の物体鑑定への応用. (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹, 赤根敦, 吉田学, 松本智寛.
  • 学会等名: 第99次日本法医学会学術全国集会
  • 発表場所: 高知市文化プラザ かるぽーと，高知
  • 年月日: 2015-06-10
• [学会発表] 死亡直前のCT検査で診断された硬膜下血腫が認められなかった剖検例. (2015)
  • 著者名/発表者名: 赤根敦, 橋谷田真樹, 松本智寛, 吉村澄孝, 時安太久磨, 吉田学.
  • 学会等名: 第99次日本法医学会学術全国集会
  • 発表場所: 高知市文化プラザ かるぽーと，高知
  • 年月日: 2015-06-10
• [学会発表] ギ酸アンモニウム，酢酸アンモニウムを用いた親水性有機溶媒の二相分離液-液抽出法の検討. (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉田学, 赤根敦, 松本智寛, 時安太久磨, 吉村澄孝, 橋谷田真樹.
  • 学会等名: 第99次日本法医学会学術全国集会
  • 発表場所: 高知市文化プラザ かるぽーと，高知
  • 年月日: 2015-06-10
• [学会発表] 死後経過時間に伴うラット血中micro RNA(miRNA)の挙動 (2014)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹，赤根 敦，吉田 学，吉村澄孝，時安太久磨，細谷 直，舟山眞人
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第22回学術集会
  • 発表場所: 愛知県産業労働センター ウインクあいち，名古屋
  • 年月日: 2014-11-27 – 2014-11-28
• [学会発表] Acute physical and restraint stress increases miR-16 expression in rat hearts (2014)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Hosoya, Tomomi Aramaki, Tomoya Ikeda, Yui Igari, Yoshie Hayashizaki, Tsukasa Ohuchi, Kiyotaka Usui, Masaki Hashiyada, Masato Funayama
  • 学会等名: International Symposium on Advances in Legal Medicine
  • 発表場所: Fukuoka International Congress Center, Fukuoka
  • 年月日: 2014-06-16 – 2014-06-20
• [学会発表] 興奮性譫妄をモデル化したストレス環境下におけるラット全血のmicroRNA(miRNA)の挙動 (2013)
  • 著者名/発表者名: 細谷直，猪狩由，林崎義映，境純，臼井聖尊，橋谷田真樹，舟山眞人
  • 学会等名: 第97次日本法医学会学術全国集会
  • 発表場所: ロイトン札幌
• [学会発表] 死後経過時間推定マーカーとしてのmicroRNA(miRNA)の評価 (2013)
  • 著者名/発表者名: 橋谷田真樹，臼井聖尊，大内司，林崎義映，細谷直，池田知哉，猪狩由，荒巻友美，境純，舟山眞人
  • 学会等名: 日本DNA多型学会第22回学術集会
  • 発表場所: 仙台市立戦災復興記念館