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Chromothripsis、その新たなるゲノム構造異常の生成機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25640062
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 腫瘍生物学
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

稲澤 譲治  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)

連携研究者 井上 純  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 講師 (50568326)
谷本 幸介  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教 (60611613)
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2013年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードChromothripsis / 染色体粉砕 / ゲノム再構成 / ゲノム不安定性 / マイクロビーム照射装置 / DNA二重鎖切断 / 口腔がん / 次世代シークエンサー / HOC313 / 次世代型シークエンサー / がん / 全ゲノムシークエンス / chromothripsis
研究成果の概要

がんの全ゲノムシークエンス解析によりchromothripsis(染色体粉砕)という新たなゲノム構造異常が発見された。その生成機構を知るため、口腔がん株細胞核にマイクロビーム照射装置 (SPICE)で陽子線照射しchromothrpsisの誘発を調べた。特定染色体に限局した構造異常が観察されDNA二重鎖切断の頻度増加と連続する異常修復の関与が示唆された。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 12件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (24件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Integrated genomic and functional analyses reveal glyoxalase I as a novel metabolic oncogene in human gastric cancer.2014

    • 著者名/発表者名
      Hosoda F, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      Oncogene.

      巻: in press 号: 9 ページ: 1196-206

    • DOI

      10.1038/onc.2014.57

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NF-κB Inducing Kinase, a Central Signaling Component of the Non-Canonical Pathway of NF-κB, Contributes to Ovarian Cancer Progression.2014

    • 著者名/発表者名
      Uno M, Saitoh Y, Mochida K, Tsuruyama E, Kiyono T, Imoto I, Inazawa J, Yuasa Y, Kubota T, Yamaoka S.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9(2) 号: 2 ページ: e88347-e88347

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0088347

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genetic variants in C5 and poor response to eculizumab.2014

    • 著者名/発表者名
      Nishimura J, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      N Engl J Med.

      巻: 370 号: 7 ページ: 632-9

    • DOI

      10.1056/nejmoa1311084

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] γ-Glutamylcyclotransferase as a novel immunohistochemical biomarker for the malignancy of esophageal squamous tumors.2014

    • 著者名/発表者名
      Takemura K, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      Hum Pathol.

      巻: 45 号: 2 ページ: 331-41

    • DOI

      10.1016/j.humpath.2013.09.009

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Significance of Akt activation and AKT gene increases in soft tissue tumors.2014

    • 著者名/発表者名
      Dobashi Y, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      Hum Pathol.

      巻: 45 号: 1 ページ: 127-36

    • DOI

      10.1016/j.humpath.2013.06.024

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The impact of miRNA-based molecular diagnostics and treatment of NRF2-stabilized tumors.2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto S, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      Mol Cancer Res.

      巻: 12 号: 1 ページ: 58-68

    • DOI

      10.1158/1541-7786.mcr-13-0246-t

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide association study of breast cancer in the Japanese population.2013

    • 著者名/発表者名
      Low SK, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      PLoS One.

      巻: 8 号: 10 ページ: e76463-e76463

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0076463

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Significance of GSTP1 for predicting the prognosis and chemotherapeutic efficacy in esophageal squamous cell carcinoma.2013

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Y, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      Oncol Rep.

      巻: 30 号: 4 ページ: 1687-94

    • DOI

      10.3892/or.2013.2606

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] miR-655 is an EMT-suppressive microRNA targeting ZEB1 and TGFBR2.2013

    • 著者名/発表者名
      Harazono Y, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      PLoS One.

      巻: 8 号: 5 ページ: e62757-e62757

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0062757

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Tumor-suppressive mir-497-195 cluster targets multiple cell-cycle regulators in hepatocellular carcinoma.2013

    • 著者名/発表者名
      Furuta M
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 3 ページ: e60155-e60155

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0060155

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Potential of tumor-suppressive miR-596 targeting LGALS3BP as a therapeutic agent in oral cancer.2013

    • 著者名/発表者名
      Endo H, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      Carcinogenesis.

      巻: 34 号: 3 ページ: 560-9

    • DOI

      10.1093/carcin/bgs376

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Esophageal Squamous Cell Carcinoma Developed 11 Years After Allogeneic Bone Marrow Transplantation for Acute Lymphatic Leukemia.2013

    • 著者名/発表者名
      Miyawaki Y, Inazawa J, et al.
    • 雑誌名

      Jpn J Clin Oncol.

      巻: 43 号: 1 ページ: 69-73

    • DOI

      10.1093/jjco/hys184

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Exploration of mechanisms for chromothripsis by irradiation2015

    • 著者名/発表者名
      18.Morishita M. Muramatsu T. Hayashi S. Hirai M. Suto Y. Konishi T. Moriyama K. Inazawa J
    • 学会等名
      AACR Annual Meeting
    • 発表場所
      Philadelphia, USA
    • 年月日
      2015-04-18 – 2015-04-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Pathogenic CNVs and causative gene analysis by SNP arrays as the third screening for 646 patients with intellectual disability and multiple congenital anomalies of unknown etiology.2013

    • 著者名/発表者名
      D.T.Uehara、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics 63th annual meeting.
    • 発表場所
      Boston, USA.
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Genetic and epigenetic aberrations of autophagy-related genes in human cancers.

    • 著者名/発表者名
      稲澤譲治
    • 学会等名
      2013 SNUCRI & SNUCH Cancer Symposium.
    • 発表場所
      Phooenixisland,Jeju, Korea.
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Investigation of CASK gene aberrations in 38 patients with severe intellectual disability, microcephaly and disproportionate pontine and cerebellar hypoplasia (MICPCH).

    • 著者名/発表者名
      林深、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics 63th annual meeting.
    • 発表場所
      Boston, USA.
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 癌治療におけるオートファジー活性の評価.

    • 著者名/発表者名
      井上純、稲澤譲治
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Eカドヘリン・プロモーター活性を指標としたEMT抑制性microRNAの機能的探索.

    • 著者名/発表者名
      小崎健一、稲澤譲治
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] がん抑制型マイクロRNAの探索.

    • 著者名/発表者名
      稲澤譲治
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第58回大会
    • 発表場所
      江陽グランドホテル.宮城
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Chromosome 19 amplicon in oral cancer cell line have the potential to promote metastasis via Rho signaling pathway.

    • 著者名/発表者名
      村松智輝、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      平成25年度文部科学省科学研究費補助金・新学術領域研究「がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動」. がん若手研究者ワークショップ
    • 発表場所
      蓼科グランドホテル滝の湯.長野
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] がん抑制型マイクロRNAの探索.

    • 著者名/発表者名
      稲澤譲治
    • 学会等名
      第9回トランスレーショナルリサーチワークショップ
    • 発表場所
      都市センターホテル.東京
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 癌ゲノム研究と個別化医療.

    • 著者名/発表者名
      稲澤譲治
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] がんと遺伝疾患のゲノム・エピゲノム解析.

    • 著者名/発表者名
      稲澤譲治
    • 学会等名
      第439回日本皮膚科学会大阪地方会/第20回小林浩記念講演
    • 発表場所
      朝日生命ホール.大阪
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 口腔・食道扁平上皮癌の統合的ゲノム・エピゲノム解析.

    • 著者名/発表者名
      稲澤譲治
    • 学会等名
      第37回日本頭頸部癌学会
    • 発表場所
      京王プラザホテル.東京
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 食道扁平上皮癌におけるリンパ節転移予測マーカー同定を目指した網羅的DNAメチル化探索.

    • 著者名/発表者名
      永田啓明、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] オートファジー障害を持つ癌細胞における化合物スクリーニング.

    • 著者名/発表者名
      岩舘怜子、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] NRF2活性化癌に対するMicroRNAを基盤とした診断・治療.

    • 著者名/発表者名
      山本信祐、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 食道癌におけるLAPTM5遺伝子の発現低下.

    • 著者名/発表者名
      Michelle Nuylan、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Inherent resistance to eculizumab in PNH.

    • 著者名/発表者名
      山本正樹、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第75回日本血液学会学術総会
    • 発表場所
      さっぽろ芸文館.北海道
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 口腔扁平上皮癌患者のゲノム構造異常解析による治療抵抗性予測.

    • 著者名/発表者名
      森田圭一、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第51回日本癌治療学会学術集会
    • 発表場所
      国立京都国際会館.京都
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 口腔扁平上皮癌患者のゲノム構造異常解析による治療抵抗性予測.

    • 著者名/発表者名
      森田圭一、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第37回日本頭頸部癌学会
    • 発表場所
      京王プラザホテル.東京
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 骨軟部腫瘍におけるAktの活性化と遺伝子増加の意義.

    • 著者名/発表者名
      土橋洋、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 口腔がん細胞株に認められた19番染色体の増幅領域に座位する遺伝子は、Rhoシグナル経路を介して転移に寄与している可能性がある.

    • 著者名/発表者名
      村松智輝、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 複数癌腫における、MicroRNA-634による細胞死誘導機構.

    • 著者名/発表者名
      藤原直人、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜.神奈川
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたGorlin症候群患者におけるhedgehog pathwayのゲノム解析.

    • 著者名/発表者名
      森田圭一、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      第58回日本口腔外科学会学術総会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡.福岡
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたGorlin症候群患者におけるhedgehog pathwayのゲノム解析.

    • 著者名/発表者名
      森田圭一、稲澤譲治 他
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第58回大会
    • 発表場所
      江陽グランドホテル.宮城
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] CGH Data Base

    • URL

      http://www.cghtmd.jp/CGHDatabase/index_j.jsp

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] MCG CNV database

    • URL

      http://www.cghtmd.jp/CNVDatabase/top.action

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 東京医科歯科大学難治疾患研究所分子細胞遺伝ホームページ

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/cgen/framepage.htm

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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