始原生殖細胞の潜在的多能性を司る基盤転写因子ネットワークの解明

• 研究課題/領域番号: 25650065
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 細胞生物学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 栗本 一基 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (20415152)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: ChIP-seq / OCT4 / 始原生殖細胞 / 多能性幹細胞 / Oct3/4 / PGC

研究成果の概要

精子や卵子の源である始原生殖細胞は、胎児の中で一過的に形成される細胞種であり、全ての細胞に分化しうる能力（多能性）を潜在的に保持する。多能性幹細胞などの顕在化した多能性は奇形種の原因となり生体に有害であるが、多能性を潜在化させる転写制御メカニズムは未解明である。研究代表者は近年、少数細胞における転写因子の結合部位を同定することのできる微量ChIP-seq法を開発した。本研究では、始原生殖細胞における多能性の形成・維持を司る写因子群の結合部位の解析への応用を検討し、始原生殖細胞様細胞において、OCT4の結合パターンが多能性幹細胞と異なり、特有の転写ネットワークを形成する可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Persistent requirement and alteration of the key targets of PRDM1 during primordial germ cell development in mice. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamashiro C, Hirota T, Kurimoto K, Nakamura T, Yabuta Y, Nagaoka SI, Ohta H, Yamamoto T, Saitou M.
  • 雑誌名: Biology of Reproduction 巻: 94 号: 1 ページ: 7-15
  • DOI: 10.1095/biolreprod.115.133256
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Robust In Vitro Induction of Human Germ Cell Fate from Pluripotent Stem Cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Sasaki, K., Yokobayash, S., Nakamura, T., Okamoto, I., Yabuta, Y., Kurimoto, K., Ohta, H., Moritoki, Y., Iwatani, C., Tsuchiya, H., Nakamura, S., Sekiguchi, K., Sakuma, T., Yamamoto, T., Mori, T., Woltjen, K., Nakagawa, M., Yamamoto, T., Takahashi, K., Yamanaka, S., Saitou, M.
  • 雑誌名: Cell Stem Cell 巻: 17 号: 2 ページ: 178-94
  • DOI: 10.1016/j.stem.2015.06.014
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanism and Reconstitution In Vitro of Germ Cell Development in Mammals (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K., Saitou, M.
  • 雑誌名: Cold Spring Harb Symp Quant Biol 巻: LXXX ページ: 1-7
  • DOI: 10.1101/sqb.2015.80.027425
• [雑誌論文] 始原生殖細胞の試験管内再構成系とその応用：エピゲノムイリプログラミング機構の解明に向けて (2015)
  • 著者名/発表者名: 栗本一基, 斎藤通紀
  • 雑誌名: 日本生殖内分泌学会雑誌 巻: 20 ページ: 7-13
• [雑誌論文] Quantitative Dynamics of Chromatin Remodeling during Germ Cell Specification from Mouse Embryonic Stem Cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K., Yabuta, Y., Hayashi, K., Ohta, H., Kiyonari, H., Mitani, T., Moritoki, Y., Kohri, K., Kimura, H., Yamamoto, T., Katou, Y., Shirahige, K., Saitou, M.
  • 雑誌名: Cell Stem Cell 巻: 16 号: 5 ページ: 517-532
  • DOI: 10.1016/j.stem.2015.03.002
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] SC3-seq: a method for highly parallel and quantitative measurement of single-cell gene expression (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, T., Yabuta, Y., Okamoto, I., Aramaki, S., Yokobayashi, S., Kurimoto, K., Sekiguchi, K., Nakagawa, M., Yamamoto, T., Saitou, M.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: - 号: 9 ページ: e60-e60
  • DOI: 10.1093/nar/gkv134
  • NAID: 120005825922
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Paternal nucleosomes: are they retained in developmental promoters or gene deserts? (2014)
  • 著者名/発表者名: Saitou, M., Kurimoto, K.
  • 雑誌名: Dev Cell 巻: 30 号: 1 ページ: 6-8
  • DOI: 10.1016/j.devcel.2014.06.025
• [雑誌論文] CCR1-mediated accumulation of myeloid cells in the liver microenvironment promoting mouse colon cancer metastasis (2014)
  • 著者名/発表者名: Hirai H, Fujishita T, Kurimoto K, Miyachi H, Kitano S, Inamoto S, Itatani Y, Saitou M, Maekawa T, Taketo MM
  • 雑誌名: Clin Exp Metastasis 巻: 31 号: 8 ページ: 977-989
  • DOI: 10.1007/s10585-014-9684-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Cell-to-cell expression variability followed by signal reinforcement progressively segregates early mouse lineages (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohnishi, Y., Huber, W., Tsumura, A., Kang, M., Xenopoulos, P., Kurimoto, K., Oles, A. K., Arauzo-Bravo, M. J., Saitou, M., Hadjantonakis, A. K., Hiiragi, T.
  • 雑誌名: Nat Cell Biol 巻: 16 号: 1 ページ: 27-37
  • DOI: 10.1038/ncb2881
  • 査読あり
• [雑誌論文] A mesodermal factor, T, specifies mouse germ cell fate by directly activating germline determinants (2013)
  • 著者名/発表者名: Aramaki, S., Hayashi, K., Kurimoto, K., Ohta, H., Yabuta, Y., Iwanari, H., Mochizuki, Y., Hamakubo, T., Kato, Y., Shirahige, K., and Saitou, M
  • 雑誌名: Developmental Cell 巻: 27 号: 5 ページ: 516-529
  • DOI: 10.1016/j.devcel.2013.11.001
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Induction of mouse germ-cell fate by transcription factors in vitro. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakaki F, Hayashi K, Ohta H, Kurimoto K, Yabuta Y, Saitou M.
  • 雑誌名: Nature 巻: 501 号: 7466 ページ: 222-226
  • DOI: 10.1038/nature12417
  • 査読あり
• [学会発表] 単一細胞遺伝子発現解析によるマウス始原生殖細胞の発生機構の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 栗本一基, 薮田幸宏, 斎藤通紀
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] Quantitative Dynamics of Chromatin-State Reprogramming of Mouse Germ Cell Specification Pathway In Vitro (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K
  • 学会等名: Gordon Research Conference, Germinal Stem Cell Biology
  • 発表場所: The Chinese University of Hong Kong
  • 年月日: 2015-06-03
  • 国際学会 / 招待講演