臨床検体を用いたRNAiスクリーニングによる骨髄異形成症候群進展機序の網羅的解析

• 研究課題/領域番号: 25670445
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 血液内科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 黒川 峰夫 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (80312320)
• 連携研究者: 片岡 圭亮 東京大学, 医学部附属病院, 特任助教 (90631383)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2013年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
• キーワード: 骨髄異形成症候群 / 治療抵抗性 / RNAiスクリーニング / 網羅的ゲノム解析

研究概要

本研究の目的はRNAiスクリーニングを用いて、骨髄異形成症候群(MDS)の病態進展・治療抵抗性機序を網羅的に解析することである。
本研究で我々はヒト遺伝子に対するプール型shRNAプラスミドライブラリーであるCellecta社のDECIPHERをMDS由来細胞株に導入し、Azacitidineで30日間処理した。処理後の細胞のDNAを次世代シークエンサーでシークエンスし、各shRNAコンストラクトに特異的なバーコード配列の頻度をAzacitidine処理群とControl群で比較した。その機能喪失によりAzacitidine耐性が誘導される候補遺伝子として158個の遺伝子を抽出することができた。

研究成果

• [雑誌論文] NF-κB/TNF-α positive feedback loop with active proteasome machinery supports myeloid leukemia initiating cell capacity (2014)
  • 著者名/発表者名: Kagoya Y, Yoshimi A, Kataoka K, Nakagawa M, Kumano K, Arai S, Kobayashi H, Saito T, Iwakura Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: J Clin Invest 巻: 124(2) ページ: 528-542
• [雑誌論文] Catheter-related septic shock by Micrococcus in an autologous hematopoietic stem cell transplantation recipient. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kogure Y, Nakamura F, Nukina A, Kamikubo Y, Ichikawa M, Kamikubo Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Am J Infect Control 巻: 42(1) ページ: 87-87
• [雑誌論文] Distribution of serum erythropoietin levels in lower risk myelodysplastic syndrome cases with anemia (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakazaki K, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 99(1) ページ: 53-6
• [雑誌論文] Single-cell gene expression analysis reveals clonal architecture of blast-phase chronic myeloid leukaemia (2014)
  • 著者名/発表者名: Nukina A, Kagoya Y, Watanabe-Okochi N, Arai S, Ueda K, Yoshimi A, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Br J Haematol 巻: (Epub ahead of print)
• [雑誌論文] Intracellular reactive oxygen species mark and influence the megakaryocyte-erythrocyte progenitor fate of common myeloid progenitors (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinohara A, Imai Y, Nakagawa M, Takahashi T, Ichikawa M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Stem Cells 巻: 32 ページ: 548-57
• [雑誌論文] MALT lymphoma of the small bowel with protein-losing enteropathy (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsukamoto A, Nakamura F, Nannya Y, Kobayashi Y, Shibahara J, Ichikawa M, Fukayama M, Koike K, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: Jan 7 (Epub ahead of print)
• [雑誌論文] Pulmonary lymphocyte-rich classical Hodgkin lymphoma with early response to ABVD therapy. (2014)
  • 著者名/発表者名: Honda A, Nakamura F, Nannya Y, Shintani Y, Fukayama M, Ichikawa M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Annals of Hematology 巻: 93 号: 6 ページ: 1073-1074
  • DOI: 10.1007/s00277-013-1935-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positive feedback between NF-κB and TNF-α promotes leukemia-initiating cell capacity. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kagoya Y, Yoshimi A, Kataoka K, Nakagawa M, Kumano K, Arai S, Kobayashi H, Saito T, Iwakura Y, Kurokawa M.
  • 雑誌名: J Clin Invest. 巻: 124 号: 2 ページ: 528-542
  • DOI: 10.1172/jci68101
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of serum erythropoietin levels in lower risk myelodysplastic syndrome cases with anemia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakazaki K, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 99(1) 号: 1 ページ: 53-56
  • DOI: 10.1007/s12185-013-1485-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Serial Profile of Vitamins and Trace Elements during the Acute Phase of Allogeneic Stem Cell Transplantation. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nannya Y, Shinohara A, Ichikawa M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Biology of Blood and Marrow Transplantation 巻: 20 号: 3 ページ: 430-434
  • DOI: 10.1016/j.bbmt.2013.12.554
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of hairy cell leukemia in familial platelet disorder with predisposition to acute myeloid leukemia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Toya T, Yoshimi A, Morioka T, Arai S, Ichikawa M, Usuki K, Kurokawa M
  • 雑誌名: Platelets 巻: 25 号: 4 ページ: 300-302
  • DOI: 10.3109/09537104.2013.818636
  • 査読あり
• [雑誌論文] MALT lymphoma of the small bowel with protein-losing enteropathy. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsukamoto A, Nakamura F, Nannya Y, Kobayashi Y, Shibahara J, Ichikawa M, Fukayama M, Koike K, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: International Journal of Hematology 巻: 99 号: 2 ページ: 198-201
  • DOI: 10.1007/s12185-013-1492-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pulmonary lymphocyte-rich classical Hodgkin lymphoma with early response to ABVD therapy (2013)
  • 著者名/発表者名: Honda A, Nakamura F, Nannya Y, Shintani Y, Fukayama M, Ichikawa M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Ann Hematol 巻: Oct 31 (Epub ahead of print)
• [雑誌論文] Serial Profile of Vitamins and Trace Elements during the Acute Phase of Allogeneic Stem Cell Transplantation (2013)
  • 著者名/発表者名: Nannya Y, Shinohara A, Ichikawa M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Biol Blood Marrow Transplant 巻: (Epub ahead of print)
• [雑誌論文] A mixed-type autoimmune hemolytic anemia with immune thrombocytopenia related with myositis and post-transplantation lymphoproliferative disorder (2013)
  • 著者名/発表者名: Ogura M, Ichikawa M, Masuda A, Kandabashi K, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Ann Hematol 巻: (Epub ahead of print)
• [雑誌論文] Development of hairy cell leukemia in familial platelet disorder with predisposition to acute myeloid leukemia (2013)
  • 著者名/発表者名: Toya T, Yoshimi A, Morioka T, Arai S, Ichikawa M, Usuki K, Kurokawa M.
  • 雑誌名: Platelets Platelets 巻: Aug 23 (Epub ahead of print)
• [雑誌論文] Transcription factor RUNX1 promotes survival of acute myeloid leukemia cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Goyama S, Schibler J, Cunningham L, Zhang Y, Rao Y, Nishimoto N, Nakagawa M, Olsson A, Wunderlich M, Link KA, Mizukawa B, Grimes HL, Kurokawa M, Liu PP, Huang G, and Mulloy JC.
  • 雑誌名: J Clin Invest. 巻: 123 ページ: 3876-88
• [雑誌論文] A role for RUNX1 in hematopoiesis and myeloid leukemia (2013)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa M, Yoshimi A, Nakagawa M, Nishimoto N, Watanabe-Okochi N, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 97 ページ: 726-34
  • NAID: 10031183728
• [雑誌論文] Acute myeloid leukemia with cryptic CBFB-MYH11 type D (2013)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T, Ichikawa M, Kamikubo Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Clin Exp Pathol 巻: 6 ページ: 110-2
• [雑誌論文] The effect of decreased-dose idarubicin for elderly patients with acute myeloid leukemia (2013)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T, Ichikawa M, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Jpn J Clin Oncol 巻: 43 ページ: 1047-51
• [雑誌論文] Generation of iPS cells from normal and malignant hematopoietic cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Kumano K, Arai S, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 98 ページ: 145-52
  • NAID: 10031194728
• [雑誌論文] Moxifloxacin is more effective than tosufloxacin in reducing chemotherapy-induced febrile neutropneia in patients with hematological malignancies (2013)
  • 著者名/発表者名: Shinohara A, Yoshiki Y, Masamoto Y, Hangaishi A, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Leuk Lymphoma 巻: 54 ページ: 794-8
• [雑誌論文] Simultaneous increase in 1,3-β-D-glucan and procalcitonin levels in Pseudomonas aeruginosa infection (2013)
  • 著者名/発表者名: Koya J, Nannya Y, Kobayashi H, Okugawa S, Moriya K, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: J Infect 巻: 67 ページ: 164-6
• [雑誌論文] Simple but powerful prognostic scoring model for MALT lymphoma : a retrospective study. (2013)
  • 著者名/発表者名: Morita K, Nannya Y, Yoshizato T, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Ann Hematol 巻: 92 ページ: 421-3
• [雑誌論文] Unique association of Waldenstrom macroglobulinemia with optic neuritis and monoclonal T cell expansion. (2013)
  • 著者名/発表者名: Morita K, Yoshimi A, MasudaA, Ichikawa M, Yatomi Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 98 ページ: 247-9
  • NAID: 10031194743
• [雑誌論文] A case of Schizophyllum commune sinusitis following unrelated cord blood transplantation for acute lymphoblastic leukemia (2013)
  • 著者名/発表者名: Toya T, Shinohara A, Tatsuno K, Seo S, Nannya Y, Ichikawa M, Makimura K, Moriya K, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 98 ページ: 261-3
  • NAID: 10031194746
• [雑誌論文] Successful treatment with recombinant thrombomodulin for B-cell lymphoma-associated hemophagocytic syndrome complicated by disseminated intravascular coagulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Uni M, Yoshimi A, Maki H, Maeda D, Nakazaki K, Nakamura F, Fukayama M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Clin Exp Pathol 巻: 6 ページ: 1190-4
  • NAID: 120007089059
• [雑誌論文] Transformation of follicular lymphoma in the retroperitoneal muscles demonstrated by CT-guided needle biopsy of FDG-avid lesions; case series (2013)
  • 著者名/発表者名: Uni M, Nakamura F, Yoshimi A, Shinozaki-Ushiku A, Hosoi A, Nakazaki K, Nannya Y, Fukayama M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Clin Exp Pathol 巻: 7 ページ: 402-6
• [雑誌論文] Catheter-related septic shock by Micrococcus in an autologous hematopoietic stem cell transplantation recipient (2013)
  • 著者名/発表者名: Kogure Y, Nakamura F, Nukina A, Kamikubo Y, Ichikawa M, Kurokawa M, Kamikubo Y, Kurokawa M
  • 雑誌名: Am J Infect Control. 巻: 42 号: 1 ページ: 87-87
  • DOI: 10.1016/j.ajic.2013.07.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-cell gene expression analysis reveals clonal architecture of blast-phase chronic myeloid leukaemia. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nukina A, Kagoya Y, Watanabe-Okochi N, Arai S, Ueda K, Yoshimi A, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Br J Haematol 巻: In Press 号: 3 ページ: 580-91
  • DOI: 10.1111/bjh.12726
  • 査読あり
• [雑誌論文] A mixed-type autoimmune hemolytic anemia with immune thrombocytopenia related with myositis and post-transplantation lymphoproliferative disorder. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ogura M, Ichikawa M, Masuda A, Kandabashi K, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Ann Hematol. 巻: In Press 号: 5 ページ: 869-871
  • DOI: 10.1007/s00277-013-1887-x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intracellular reactive oxygen species mark and influence the megakaryocyte-erythrocyte progenitor fate of common myeloid progenitors. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shinohara A, Imai Y, Nakagawa M, Takahashi T, Ichikawa M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Stem Cells 巻: 32 号: 2 ページ: 548-557
  • DOI: 10.1002/stem.1588
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcription factor RUNX1 promotes survival of acute myeloid leukemia cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Goyama S, Schibler J, Cunningham L, Zhang Y, Rao Y, Nishimoto N, Nakagawa M, Olsson A, Wunderlich M, Link KA, Mizukawa B, Grimes HL, Kurokawa M, Liu PP, Huang G, and Mulloy JC.
  • 雑誌名: J Clin Invest 巻: 123 号: 9 ページ: 3876-3888
  • DOI: 10.1172/jci68557
  • 査読あり
• [雑誌論文] A role for RUNX1 in hematopoiesis and myeloid leukemia. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa M, Yoshimi A, Nakagawa M, Nishimoto N, Watanabe-Okochi N, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 97 号: 6 ページ: 726-734
  • DOI: 10.1007/s12185-013-1347-3
  • NAID: 10031183728
  • 査読あり
• [雑誌論文] Acute myeloid leukemia with cryptic CBFB-MYH11 type D. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T, Ichikawa M, Kamikubo Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: International Journal of Clinical and Experimental Pathology 巻: 6 ページ: 110-112
  • 査読あり
• [雑誌論文] The effect of decreased-dose idarubicin for elderly patients with acute myeloid leukemia. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T, Ichikawa M, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Jpn J Clin Oncol 巻: 43 号: 10 ページ: 1047-1051
  • DOI: 10.1093/jjco/hyt111
  • 査読あり
• [雑誌論文] Generation of iPS cells from normal and malignant hematopoietic cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kumano K, Arai S, Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol. 巻: 98 号: 2 ページ: 145-182
  • DOI: 10.1007/s12185-013-1385-x
  • NAID: 10031194728
  • 査読あり
• [雑誌論文] Moxifloxacin is more effective than tosufloxacin in reducing chemotherapy-induced febrile neutropneia in patients with hematological malignancies. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shinohara A, Yoshiki Y, Masamoto Y, Hangaishi A, Nannya Y, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: Leuk Lymphoma 巻: 54 号: 4 ページ: 794-798
  • DOI: 10.3109/10428194.2012.725848
  • 査読あり
• [雑誌論文] Simultaneous increase in 1,3-β-D-glucan and procalcitonin levels in Pseudomonas aeruginosa infection. (2013)
  • 著者名/発表者名: Koya J, Nannya Y, Kobayashi H, Okugawa S, Moriya K, Kurokawa M.
  • 雑誌名: J Infect 巻: 67 号: 2 ページ: 164-166
  • DOI: 10.1016/j.jinf.2013.03.017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Simple but powerful prognostic scoring model for MALT lymphoma: a retrospective study. (2013)
  • 著者名/発表者名: Morita K, Nannya Y, Yoshizato T, Kurokawa M.
  • 雑誌名: Ann Hematol 巻: 92 号: 3 ページ: 421-423
  • DOI: 10.1007/s00277-012-1585-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Unique association of Waldenström macroglobulinemia with optic neuritis and monoclonal T cell expansion. (2013)
  • 著者名/発表者名: Morita K, Yoshimi A, Masuda A, Ichikawa M, Yatomi Y, Kurokawa M.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 98 号: 2 ページ: 247-249
  • DOI: 10.1007/s12185-013-1372-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] A case of Schizophyllum commune sinusitis following unrelated cord blood transplantation for acute lymphoblastic leukemia. (2013)
  • 著者名/発表者名: Toya T, Shinohara A, Tatsuno K, Seo S, Nannya Y, Ichikawa M, Makirnura K Moriya K, Kurokawa M
  • 雑誌名: lnternational Journal of Hematology 巻: 98 号: 2 ページ: 261-263
  • DOI: 10.1007/s12185-013-1362-4
  • 査読あり
• [雑誌論文] Successful treatment with recombinant thrombomodulin for B-cell lymphoma-associated hemophagocytic syndrome complicated by disseminated intravascular coagulation. (2013)
  • 著者名/発表者名: Uni M, Yoshimi A, Maki H, Maeda D, Nakazaki K, Nakamura F, Fukayama M, and Kurokawa M.
  • 雑誌名: International Journal of Clinical and Experimental Pathology 巻: 6 ページ: 1190-1194
  • NAID: 120007089059
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transformation of follicular lymphoma in the retroperitoneal muscles demonstrated by CT-guided needle biopsy of FDG-avid lesions; case series. (2013)
  • 著者名/発表者名: Uni M, Nakamura F, Yoshimi A, Shinozaki-Ushiku A, Hosoi A, Nakazaki K, Nannya Y, Fukayama M, and Kurokawa M
  • 雑誌名: International Journal of Clinical and Experimental Pathology 巻: 7 ページ: 402-406
  • 査読あり