研究課題/領域番号 |
25850033
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研究種目 |
若手研究(B)
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配分区分 | 基金 |
研究分野 |
植物保護科学
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研究機関 | 独立行政法人農業生物資源研究所 |
研究代表者 |
川原 善浩 独立行政法人農業生物資源研究所, ゲノムインフォマティクスユニット, 主任研究員 (30546370)
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研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2014年度)
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配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
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キーワード | 植物ー病原菌相互作用 / イネ / いもち病菌 / RNA-Seq / de novoゲノムアセンブル / 遺伝子発現プロファイル / 植物ー病原体相互作用 / RNA-Seq解析 / de novoゲノムアセンブル解析 |
研究成果の概要 |
いもち病菌に対して異なる病害抵抗性を示す3つのイネ品種(罹病性、真性抵抗性、圃場抵抗性)の感染後0、24、36、48時間のイネの葉を対象にし、イネといもち病菌の双方の感染時系列遺伝子発現プロファイル比較解析をDual RNA-Seq法を用いて行った。その結果、抵抗性反応の違いに依って、イネの感染時応答遺伝子の発現誘導のタイミングが異なること、およびいもち病菌の感染時応答遺伝子の発現も抵抗性反応に依って異なることを明らかにした。ゲノムや遺伝子アノテーションと共に感染時の遺伝子発現プロファイルが俯瞰可能なゲノムブラウザやゲノムや転写産物に対するBLAST検索機能をもったデータベースの構築を行った。
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