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青色光受容タンパク質によるDNA修復機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25870400
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生体関連化学
生物物理学
研究機関大阪大学

研究代表者

山元 淳平  大阪大学, 基礎工学研究科, 助教 (90571084)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードDNA修復 / DNA損傷 / 光生物 / 光反応 / 酵素反応機構 / 酵素
研究成果の概要

(6-4)光回復酵素は太陽光中の青色光を用いて、がん化の原因となる紫外線損傷DNAの一つである(6-4)光産物を直接修復することのできるタンパク質である。しかし、(6-4)光回復酵素の機能は完全に解明されていなかった。そこで、本研究課題では、(6-4)光回復酵素の修復反応機構を調べるため、酵素のアミノ酸変異体を用いた分子科学研究を行った。その結果、 (6-4)光回復酵素による損傷DNAの認識および修復に関するアミノ酸側鎖を新たに同定した。今後、(6-4)光回復酵素と相同性の高い、概日時計を司るクリプトクロムの研究へと展開されることが期待される。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Analysis of structural flexibility of damaged DNA using thiol-tethered oligonucleotide duplexes2015

    • 著者名/発表者名
      Masashi Fujita, Shun Watanabe, Mariko Yoshizawa, Junpei Yamamoto, Shigenori Iwai
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 10 号: 2 ページ: e0117798-e0117798

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0117798

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] FTIR study of CPD photolyase with substrate in single strand DNA2015

    • 著者名/発表者名
      I M. M. Wijaya, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, E. D. Getzoff, H. Kandori*
    • 雑誌名

      BIOPHYSICS

      巻: 11 号: 0 ページ: 39-45

    • DOI

      10.2142/biophysics.11.39

    • NAID

      130004940808

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deformable nature of various damaged DNA duplexes estimated by an electrochemical analysis on electrodes2014

    • 著者名/発表者名
      J. Chiba, S. Aoki, J. Yamamoto, S. Iwai, and M. Inouye
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 50 号: 76 ページ: 11126-11128

    • DOI

      10.1039/c4cc04513k

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] FAD Chromophore Charge Controls the Conformation of CPD-Photolyase α-Helices2014

    • 著者名/発表者名
      I M. M. Wijaya, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, E. D. Getzoff, J. T. M. Kennis, T. Mathes, H. Kandori*
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 53 号: 37 ページ: 5864-5875

    • DOI

      10.1021/bi500638b

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A cyclobutane thymine-N4-methylcytosine dimer is resistant to hydrolysis but strongly blocls DNA synthesis.2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto J, Oyama T, Kunishi T, Masutani C, Hanaoka F, Iwai S
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 42 号: 3 ページ: 2075-2084

    • DOI

      10.1093/nar/gkt1039

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] "Detection of distinct α-helical rearrangements of CPD photolyase upon substrate binding by FTIR spectroscopy"2013

    • 著者名/発表者名
      I M. M. Wijaya, Y. Zhang, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, E. D. Getzoff and H. Kandori
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 52 号: 6 ページ: 1019-1027

    • DOI

      10.1021/bi3016179

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Strand breakage of (6-4) photoproduct-containing DNA at neutral pH and its repair by the ERCC1-XPF protein complex2013

    • 著者名/発表者名
      Arichi N, Yamamoto J, Takahata C, Masuda Y, Kuraoka I, Iwai S
    • 雑誌名

      Org. Biomol. Chem.

      巻: 11 号: 21 ページ: 3526-3534

    • DOI

      10.1039/c3ob00012e

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Repair of the (6-4) photoproduct by DNA photolyase requires two photons2013

    • 著者名/発表者名
      Junpei Yamamoto, Ryan Martin, Shigenori Iwai, Pascal Plaza, and Klaus Brettel
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 52 号: 29 ページ: 7432-7436

    • DOI

      10.1002/anie.201301567

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Synthesis of oligonucleotides containing chain-terminating antiviral drugs and their use in biochemical analysis2014

    • 著者名/発表者名
      Junpei Yamamoto and Shigenori Iwai
    • 学会等名
      The 41th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      北九州国際会議場
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of the two photon DNA repair by the (6-4) photolyase2014

    • 著者名/発表者名
      山元淳平、清水幸平、藤原智子、藤堂剛、Pascal Plaza、Klaus Brettel、岩井成憲
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗ウイルス剤を末端に含むオリゴヌクレオチドの化学合成とそれを用いた生化学解析2014

    • 著者名/発表者名
      山元淳平、岩井成憲
    • 学会等名
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学津島キャンパス
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 紫外線損傷DNAの化学合成及びその修復反応・変異機構解析2014

    • 著者名/発表者名
      山元淳平
    • 学会等名
      変異機構研究会 第27回夏の学校
    • 発表場所
      愛知県小牧勤労センター
    • 年月日
      2014-06-21 – 2014-06-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A two photon DNA repair mechanism of the (6-4) photolyase2013

    • 著者名/発表者名
      Junpei Yamamoto, Ryan Martin, Shigenori Iwai, Pascal Plaza, and Klaus Brettel
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Biochemical and thermodynamic properties of a cyclobutane thymine-N4-methylcytosine dimer2013

    • 著者名/発表者名
      Junpei Yamamoto, Tomoko Oyama, Tomohiro Kunishi, and Shigenori Iwai
    • 学会等名
      The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2013
    • 発表場所
      神奈川大学(神奈川県横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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