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実験とシミュレーションによるNFkBシグナル伝達システムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 25890025
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 システムゲノム科学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

井上 健太郎  独立行政法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 特別研究員 (80708529)

研究期間 (年度) 2013-08-30 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードNF-kB / シグナル伝達システム / シミュレーション / モデリング / NFkB / システム生物学 / シグナル伝達
研究成果の概要

転写因子NF-kBは細胞運命決定や疾患に関与しており、NF-kBシグナル伝達システムの数理モデルによる解析はNF-kB活性化の制御メカニズムの理解に役立つ。これまでNF-kB活性化システムのモデリングはNF-kB活性の振動を再現できる一部分のモデルの構築に留まっていたが、本研究では、振動に加えてスイッチライク応答も再現でき、これまでで最も多くの実験を説明できるNF-kBシステムのモデルを構築した。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 学会発表 (9件) 備考 (1件)

  • [学会発表] BCRシグナリングによるNFkBの振動とスイッチライク応答のシステム解析2015

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 篠原久明, 岡田眞里子
    • 学会等名
      生命動態合同シンポジウム
    • 発表場所
      京都大学、京都府
    • 年月日
      2015-03-15 – 2015-03-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] System analysis for oscillation and switch-like response of NF-kappaB in B cell2015

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama
    • 学会等名
      The Third BMIRC International Symposium
    • 発表場所
      のがみプレジデントホテル、福岡県
    • 年月日
      2015-03-05 – 2015-03-06
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] NF-kBシグナル伝達経路のモデリング2015

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎
    • 学会等名
      第7回定量生物学の会
    • 発表場所
      九州大学、福岡県
    • 年月日
      2015-01-11 – 2015-01-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 動力学モデルによる転写因子NFkB活性の振動およびデジタル応答の制御メカニズム解明2014

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 篠原久明, 岡田眞里子
    • 学会等名
      第3回生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      仙台国際センター、宮城県
    • 年月日
      2014-10-02 – 2014-10-04
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Kinetic modeling of NF-kappaB signaling pathway2014

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Marcelo Behar, Alexander Hoffmann, Mariko Okada-Hatakeyama
    • 学会等名
      22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2014)
    • 発表場所
      John B. Hynes Memorial Convention Center,Boston
    • 年月日
      2014-07-13 – 2014-07-15
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic modeling of NF-kB signaling system in B cell2014

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎、篠原久明、岡田眞里子
    • 学会等名
      The Second BMIRC International Symposium
    • 発表場所
      飯塚研究開発センター, 福岡県
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic modeling of NF-kB signaling system in B cell2013

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎、篠原久明、岡田眞里子
    • 学会等名
      Genome Informatics Workshop (GIW2013)
    • 発表場所
      National University of Singapore, Singapore
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic modeling for NF-kB signal transduction system2013

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎, 篠原久明, Marcelo Behar, Alexander Hoffmann, 岡田眞里子
    • 学会等名
      第36回分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場、兵庫県
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] System analysis for NF-kB signal transduction pathway2013

    • 著者名/発表者名
      井上健太郎、篠原久明、岡田眞里子
    • 学会等名
      第2回生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      タワーホール船橋、東京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 統合細胞システム研究チームホームページ

    • URL

      http://csb.rcai.riken.jp/?lang=ja

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-09-12   更新日: 2019-07-29  

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