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ネギ属バイオリーソースを用いたオミクス統合解析のタマネギ育種への応用

研究課題

研究課題/領域番号 26292020
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 園芸科学
研究機関山口大学

研究代表者

執行 正義  山口大学, 創成科学研究科, 教授 (40314827)

研究分担者 澤田 有司  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (00415176)
伊藤 真一  山口大学, 農学部, 教授 (30243629)
佐藤 修正  東北大学, 生命科学研究科, 准教授 (70370921)
若生 忠幸  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 野菜茶業研究所, 研究員 (70414670)
連携研究者 平川 英樹  かずさDNA研究所, 植物ゲノム研究部, 主任研究員 (80372746)
中林 亮  理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (30586160)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円)
2016年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2015年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2014年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
キーワード染色体マーカー / 連鎖地図 / 植物病害抵抗性 / 単一異種染色体添加系統シリーズ / 倍加半数体 / ネギ類 / トランスクリプトーム解析 / メタボローム解析 / 機能性代謝物 / 健康機能性 / 染色体操作技術
研究成果の概要

ゲノム,トランスクリプトーム,メタボロームやフェノームを統合解析して代謝産物の量的変化や表現形質の発現に直接関与する遺伝子を明らかにすることをオミクス統合解析という.ネギ類において成分育種や耐病性育種を精密に行う場合には,この解析手法から得られる情報をバイオインフォマテックス手法により加工・標準化した統合データベースが必要となる。そこで本研究では,植物材料として,これまでにゲノムやフェノームの観点から変異の理解が進んでいる異種染色体添加系統や倍加半数体系統由来分離集団を用いてオミクス統合解析を行い,得られたメタデータから生物学的な意味を抽出してタマネギ育種ツールの開発に繋げることを試みた.

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [国際共同研究] ワーゲニンゲン大学(オランダ)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ネギ類オミクス研究の意義と今後の展望2017

    • 著者名/発表者名
      執行正義
    • 学会等名
      園芸学会平成29年度春季大会-第20回ネギ類研究小集会
    • 発表場所
      日本大学生物資源科学部(神奈川県藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ネギ類のオミクス解析におけるトランスクリプト―ムデータの活用2017

    • 著者名/発表者名
      佐藤修正
    • 学会等名
      園芸学会平成29年度春季大会-第20回ネギ類研究小集会
    • 発表場所
      日本大学生物資源科学部(神奈川県藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ネギ類におけるゲノム研究の進捗について2017

    • 著者名/発表者名
      藤戸聡史・若生忠幸
    • 学会等名
      園芸学会平成29年度春季大会-第20回ネギ類研究小集会
    • 発表場所
      日本大学生物資源科学部(神奈川県藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ネギ類におけるメタボロームデータの収集とその育種利用2017

    • 著者名/発表者名
      澤田有司
    • 学会等名
      園芸学会平成29年度春季大会-第20回ネギ類研究小集会
    • 発表場所
      日本大学生物資源科学部
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] タマネギ乾腐病菌の分子生物学的研究とその耐病性育種への応用2017

    • 著者名/発表者名
      佐々木一紀・伊藤真一
    • 学会等名
      園芸学会平成29年度春季大会-第20回ネギ類研究小集会
    • 発表場所
      日本大学生物資源科学部(神奈川県藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Clarification of Omics Concepts and Future Challenges for Molecular Breeding in the Pregenomic Era of Allium2016

    • 著者名/発表者名
      Masayoshi Shigyo
    • 学会等名
      The Second Asian Horticultural Congress
    • 発表場所
      Chegdu, China
    • 年月日
      2016-09-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ネギ属トランスクリプトームデータベースAllium TDBを活用したAllium cepa連鎖地図の構築2016

    • 著者名/発表者名
      藤戸聡史・山下謙一郎・若生忠幸・塚崎光・山北和香・佐藤修正・平川英樹・執行正義
    • 学会等名
      園芸学会平成28年度秋季大会
    • 発表場所
      名城大学(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2016-09-11
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Allium capa における超高密度連鎖地図作成の試み2016

    • 著者名/発表者名
      山北和香・竹富詩歩・佐藤修正・ 平田翔・平川英樹・田中啓介・峯洋子・山内直樹・執行正義
    • 学会等名
      園芸学会平成28年度春季大会
    • 発表場所
      東京農業大学 厚木キャンパス(神奈川県・厚木市)
    • 年月日
      2016-03-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ネギ属バイオリーソースを用いたトランスクリプトーム解析データの活用2015

    • 著者名/発表者名
      執行正義・佐藤修正・Abdelrahman, Mostafa ・ 平田翔・平川英樹・田中啓介・峯洋子・杉山信男・山内直樹
    • 学会等名
      園芸学会平成27年度秋季大会
    • 発表場所
      徳島大学 三島キャンパス(徳島県・徳島市)
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ネギ単一異種染色体添加系統のRNA-Sequencing によるシャロット染色体マーカーの大量取得2015

    • 著者名/発表者名
      山北和香・佐藤修正・Abdelrahman, Mostafa・平田翔・平川英樹・田中啓介・峯洋子・山内直樹・執行正義
    • 学会等名
      園芸学会平成27年度秋季大会
    • 発表場所
      徳島大学 三島キャンパス(徳島県・徳島市)
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] A NEW “OMICS” PLATFORM TECHNOLOGY FOR APPLIED CYTOGENETICS AND IMPLICATIONS FOR GERMPLASM ENHANCEMENT IN ALLIUM2015

    • 著者名/発表者名
      M. Shigyo, S. Hirata, M. Abdelrahman, H.Q. Vu, N.A. Ariyanti, N. Yamauchi
    • 学会等名
      7th International Symposium on Edible Alliaceae
    • 発表場所
      Nigde University, Nigde (Turkey)
    • 年月日
      2015-05-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ネギ属の代謝育種を目指した統合メタボローム解析2014

    • 著者名/発表者名
      澤田有司・中林亮・執行正義・佐藤修正・若生忠幸・佐藤心郎・山田豊・森哲哉・坂田あかね・斉藤和季・平井優美
    • 学会等名
      園芸学会平成26年度秋季大会
    • 発表場所
      佐賀大学
    • 年月日
      2014-09-27 – 2014-09-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ネギ類におけるオミクス研究資源の育種利用の可能性について2014

    • 著者名/発表者名
      執行正義
    • 学会等名
      第17回ネギ類研究小集会
    • 発表場所
      佐賀大学
    • 年月日
      2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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