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EGFR天然変性ドメインの構造変化ダイナミクスの1分子FRET計測

研究課題

研究課題/領域番号 26440088
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

岡本 憲二  国立研究開発法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 専任研究員 (40402763)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード1分子計測 / FRET / 天然変性蛋白質 / 分子構造変化ダイナミクス / 上皮成長因子受容体分子 / 分子構造ダイナミクス / EGFR / 1分子計測 (SMD) / 天然変性タンパク質 / 1分子計測(SMD)
研究成果の概要

上皮成長因子受容体の天然変性C-末端ドメインのみ断片化した分子(EGFR-CT)を用いて試験管中1分子FRET計測実験をおこない、構造変化ダイナミクスの測定を試みた。イメージング実験では天然変性の構造揺らぎを直接捉えることができなかったが、FRET分布が溶液条件(イオン強度)に依存して変化することが分かった。そこで拡散分子のバースト計測により溶液条件への依存性を調べたところ、イオン強度より変性剤濃度に強く依存してFRETが変化する結果を得た。天然変性蛋白質では一般的に電荷相互作用が構造に影響すると考えられるが、EGFR-CTではむしろ局所的な2次構造形成が重要であることが明らかになった。

報告書

(5件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] State transition analysis of spontaneous branch migration of the Holliday junction by photon-based single-molecule fluorescence resonance energy transfer.2016

    • 著者名/発表者名
      Okamoto, K. and Sako, Y.
    • 雑誌名

      Biophys. Chem.

      巻: 209 ページ: 21-27

    • DOI

      10.1016/j.bpc.2015.11.004

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] EGF受容体C-末端天然変性ドメインの1分子FRET計測2017

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule FRET measurement for conformational dynamics and in-cell structural states of biomolecules2017

    • 著者名/発表者名
      Kenji Okamoto
    • 学会等名
      International Nanophotonics Symposium
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 単一分子計測で明らかにする細胞中の分子動態2017

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二、廣島通夫、日比野佳代、佐甲靖志
    • 学会等名
      レーザー学会学術講演会第37回年次大会
    • 発表場所
      徳島大学常三島キャンパス(徳島県徳島市)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] In-cell Single-molecule FRET Measurement of Cytosolic Proteins2017

    • 著者名/発表者名
      Kenji Okamoto
    • 学会等名
      Protein & Peptide Conference-2017
    • 発表場所
      ヒルトン福岡シーホーク(福岡県福岡市)
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Raf の生細胞内構造分布を明らかにする1分子 FRET 計測2015

    • 著者名/発表者名
      岡本 憲二、日比野 佳代、佐甲 靖志
    • 学会等名
      第53回 日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県・金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 上皮成長因子受容体(EGFR)の膜貫通および膜近傍ドメインの構造ダイナミクス解析2015

    • 著者名/発表者名
      前田 亮、佐藤 毅、岡本 憲二、稲葉 岳彦、佐甲 靖志
    • 学会等名
      第53回 日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県・金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Holliday junction DNA の自発的 branch migration 過程の FRET による解析2014

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二、佐甲靖志
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 生体分子の1分子FRET計測:分子構造の分布とダイナミクス2014

    • 著者名/発表者名
      岡本憲二、日比野佳代、佐甲靖志
    • 学会等名
      第8回分子科学討論会
    • 発表場所
      広島大学(広島県東広島市)
    • 年月日
      2014-09-21 – 2014-09-24
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2019-03-29  

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