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構造情報を基盤としたFMN結合反応の多重解析と分子進化的考察

研究課題

研究課題/領域番号 26450131
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関大阪市立大学

研究代表者

北村 昌也  大阪市立大学, 大学院工学研究科, 教授 (20244634)

研究分担者 中西 猛  大阪市立大学, 大学院工学研究科, 講師 (20422074)
研究協力者 津本 浩平  
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードフラボタンパク質 / タンパク質工学 / 構造機能相関 / 補因子 / 国際情報交換
研究成果の概要

FMN結合タンパク質(FMN-bp)における補因子との結合反応解析を行った。補因子との結合強度は、蛍光法に加えて、表面プラズモン共鳴法および等温滴定型熱量測定法により、熱力学的に解析した。補因子との解離定数はリン酸イオン濃度には影響されなかった。アポタンパク質の調製法を変更することにより、結合活性を有するアポFMN-bpを大量に得ることができるようになり、その立体構造を決定できた。これらの結果を他のフラボタンパク質と比較し、アポFMN-bpとFMNの結合機構について、新たな提案を行った。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (5件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Mahasarakham University/Rajabhat University/Chulalongkorn University(Thailand)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Mahasarakham University/Rajabhat University/Chulalongkorn University(Thailand)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [国際共同研究]

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Photoinduced electron transfer from aromatic amino acids to the excited isoalloxazine in single mutated flavin mononucleotide binding proteins: Effect of the dimer formation on the rate and the electrostatic energy inside the proteins2017

    • 著者名/発表者名
      Nadtanet Nunthaboot,Kiattisak Lugsanangarm, Arthit Nueangaudom, Somsak Pianwanit ,Sirirat Kokpol, Fumio Tanaka, Seiji Taniguchi, Haik Chosrowjan, Takeshi Nakanishi, Masaya Kitamura
    • 雑誌名

      Computational and Theoretical Chemistry

      巻: 1108 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.comptc.2017.03.005

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Conformational Difference between Two Subunits in Flavin Mononucleotide Binding Protein Dimers from Desulfovibrio vulgaris (MF): Molecular Dynamics Simulation2016

    • 著者名/発表者名
      Nadtanet Nunthaboot, Kiattisak Lugsanangarm, Somsak Pianwanit, Sirirat Kokpol, Fumio Tanaka, Takeshi Nakanishi, Masaya Kitamura
    • 雑誌名

      Computational Biology and Chemistry

      巻: 64 ページ: 113-125

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Photoinduced electron transfer from aromatic amino acids to the excited isoalloxazine in flavin mononucleotide binding protein. Is the rate in the inverted region of donor – acceptor distance not real?2016

    • 著者名/発表者名
      N. Nunthaboot, K. Lugsanangarm, A. Nueangaudom, S. Pianwanit, S. Kokpol, F. Tanaka, S. Taniguchi, H. Chosrowjan, T. Nakanishi, M. Kitamura
    • 雑誌名

      Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry

      巻: 326 ページ: 60-68

    • DOI

      10.1016/j.jphotochem.2016.04.005

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] FMN結合タンパク質の補因子結合反応におけるFMNリン酸基の寄与2016

    • 著者名/発表者名
      小田 真大、中西 猛、北村 昌也
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Clostridium acetobutylicum ATCC 824 由来FMN 結合タンパク質の生産とその性質2016

    • 著者名/発表者名
      多良 将吾、張 霜玉、中西 猛、北村 昌也
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 表面プラズモン共鳴法を用いたFMN 結合反応解析2016

    • 著者名/発表者名
      山口 亮、張 霜玉、高木 利佳子、中西 猛、北村 昌也
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Pseudomonas aeruginosa由来フラボドキシンの変異体の性質と構造2015

    • 著者名/発表者名
      岡田 大規、荻野 公美子、中西 猛、北村 昌也
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸コンベンションセンター(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-02
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] FMN-binding property and crystal structure of YviC from Lactococcus lactis2014

    • 著者名/発表者名
      Rikako Takagi, Takeshi Nakanishi, Takuma Maeda, Nobunari Satake, Kentaro Watanabe, Yoshitaka Moriwaki, Tohru Terada, Kentaro Shimizu, and Masaya Kitamura
    • 学会等名
      IUBMB SYMPOSIUM, 18th International Symposium on Flavins and Flavoproteins
    • 発表場所
      Phetchaburi (Thailand)
    • 年月日
      2014-07-27 – 2014-08-01
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [図書] カラー生化学第4版2015

    • 著者名/発表者名
      石浦章一、板部洋之、高木正道、中谷一泰、水島昇、横溝岳彦(監訳)
    • 総ページ数
      1193
    • 出版者
      西村書店
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 研究内容/生物分子工学分野 北村研究室

    • URL

      http://www.bioa.eng.osaka-cu.ac.jp/bic/research.html

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書 2014 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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