新規ゲノム不安定性としてのコピー数多型部位の変異の解析とその病的意義の解明

• 研究課題/領域番号: 26640121
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 村上 善則 東京大学, 医科学研究所, 教授 (30182108)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円); 2015年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: コピー数多型 / 乳がん / DNA コピー数多型 / 胆道がん / 不安定性 / がん遺伝子 / 癌細胞 / コピー数異常 / ゲノム不安定性 / 染色体不安定性 / 乳癌

研究成果の概要

申請者らは新規ゲノム多型であるコピー数多型(Copy Number Variation:CNV)部位での体細胞変異を腫瘍組織で解析し、CNVの実態の解明と意義、起因する遺伝子異常の同定を目的とし、CNV特異的DNAアレイを用いて、乳がん、胆道がん、舌がん、膀胱がん、計52例における腫瘍、非腫瘍部のCNVを網羅的に解析した。この結果、10kb以下の短い断片でのみコピー数増減を示す新たな異常を見出し、CNV不安定性と定義した。CNV不安定性は腫瘍の10-20%、特に悪性例に認められた。また、乳がんでCNV体細胞異常に起因する遺伝子異常を網羅的に解析し、多数の候補遺伝子群を得た。

研究成果

• [国際共同研究] Johns Hopkins University/Texas University/University of Utah(米国)
• [国際共同研究] Khon Kaen University(Thailand)
• [雑誌論文] NECAB3 Promotes Activation of Hypoxia-inducible factor-1 during Normoxia and Enhances Tumourigenicity of Cancer Cells (2016)
  • 著者名/発表者名: 1.Nakaoka HJ, Hara T, Yoshino S, Kanamori A, Matsui Y, Shimamura T, Sato H, Murakami Y, Seiki M, Sakamoto T
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 6 号: 1 ページ: 22784-22784
  • DOI: 10.1038/srep22784
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CRTAM determines the CD4+ cytotoxic T lymphocyte lineage. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi, A., Badr Mel, S., Miyauchi, K., Ishihara, C., Onishi, R., Guo, Z., Sasaki. Y., Ike, H., Takumi, A., Tsuji, NM., Murakami, Y., Katakai, T., Kubo, M. and Saito, T.
  • 雑誌名: J. Exp. Med. 巻: 213 号: 1 ページ: 123-138
  • DOI: 10.1084/jem.20150519
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Frequent copy gain of the MET gene in hypopharyngeal and larynxeal cancer in the Japanese population (2015)
  • 著者名/発表者名: Akashi K, Ebihara Y, Omura G, Saito Y, Yoshida M, Ando M, Asakage T, Yamasoba T, Murakami Y
  • 雑誌名: Journal of Cancer Therapy 巻: 6 号: 12 ページ: 1093-1102
  • DOI: 10.4236/jct.2015.612119
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A measles virus selectively blind to signaling lymphocytic activation molecule shows anti-tumor activity against lung cancer cells. (2015)
  • 著者名/発表者名: Fujiyuki T, Yoneda M, Amagai Y, Obayashi K, Ikeda F, Shoji K, Murakami Y, Sato H, Kai C.
  • 雑誌名: Oncotarget, 巻: 6 号: 28 ページ: 24895-24903
  • DOI: 10.18632/oncotarget.4366
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dynamic Regulation of a Cell Adhesion Protein Complex Including CADM1 by Combinatorial Analysis of FRAP with Exponential Curve-fitting (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakurai-Yageta, M., Maruyama,T., Suzuki, T., Ichikawa, K., and Murakami, Y.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 10 号: 3 ページ: 0116637-0116637
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0116637
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Promoter Methylation of the CADM1 and 4.1B Genes Occurs Independently of the EGFR or the KRAS2 Mutation in Non-Small Cell Lung Cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Kogai, Shinji Kikuchi, Takashi Obana, Yumi Tsuboi, Tomoko Maruyama, Mika Sakurai-Yageta, Hisao Asamura, Yae Kanai, Yoshinori Murakami.
  • 雑誌名: Journal of Cancer Therapy. 巻: 6 号: 03 ページ: 273-285
  • DOI: 10.4236/jct.2015.63030
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Immunohistochemical analysis of the expression of E-cadherin and ZEB1 in non-small cell lung cancer. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsubara D, Kishaba Y, Yoshimoto T, Sakuma Y, Sakatani T, Tamura T, Endo S, Sugiyama Y, Murakami Y, Niki T
  • 雑誌名: Pathology International 巻: 64 号: 11 ページ: 560-568
  • DOI: 10.1111/pin.12214
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] High incidence of null-type mutations of the TP53 gene in Japanese patients with head and neck squamous cell carcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ebihara Y, Iwai M, Akashi K, Ito T, Omura G, Saito Y, Yoshida M, Ando M, Asakage T, Yamasoba T, Murakami Y.
  • 雑誌名: Journal of Cancer Therapy 巻: 5 ページ: 664-671
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Detection of lung tumors in mice using a 1-Tesla compact magnetic resonance imaging system. (2014)
  • 著者名/発表者名: Wang F, Akashi K, Murakami Y, Inoue Y, Furuta T, Yamada H, Ohtomo K, Kiryu S.
  • 雑誌名: PLoS One, 巻: 9 号: 4 ページ: e94945-e94945
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0094945
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Expression of PRMT5 in lung adenocarcinoma and its significance in epithelial-mesenchymal transition. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ibrahim R, Matsubara D, Osman W, Morikawa T, Goto A, Morita S, Ishikawa S, Aburatani H, Takai D, Nakajima J, Fukayama M, Niki T, Murakami Y
  • 雑誌名: Hum Pathol. 巻: 45 号: 7 ページ: 1397-405
  • DOI: 10.1016/j.humpath.2014.02.013
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] CRTAM controls residency of gut CD4+CD8+T cells in the steady state and maintenance of gut CD4 TH17 during parasitic infection. (2014)
  • 著者名/発表者名: Cortez VS, Cervantes-Barragan L, Song C, Gilfillan S, McDonald KG, Edelson BT, Murakami Y, Newberry RD, Sibley LD, Colonna M.
  • 雑誌名: J Exp. Med. 巻: 211 号: 4 ページ: 623-633
  • DOI: 10.1084/jem.20130904
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Trans-homophilic interaction of CADM1 activates PI3K by forming a complex with MAGuK-family proteins MPP3 and Dlg. (2014)
  • 著者名/発表者名: Murakami, S., Sakurai-Yageta, M. (equal contribution), Maruyama, T., Murakami, Y.
  • 雑誌名: PloS One 巻: 9(2) 号: 2 ページ: e82894-e82894
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0082894
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Mathematical analysis of the dynamics of CADM1 and its role in the MET-driven resistance against EGFR-TKI in lung adenocarcinoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Sakurai-Yageta M, Tsuchiya T, Kawasaki S, Ohba M, Ichikawa K, Suzuki T, Murakami Y.
  • 学会等名: The First JSPS Core-to-Core Seminar: Establishing Research Network of Mathematical Oncology.
  • 発表場所: 大和高原ボスコヴィラ(奈良県奈良市）
  • 年月日: 2016-03-08
  • 国際学会
• [学会発表] Dual roles of a Cell Adhesion Molecule CADM1 in Oncogenesis. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Tsuchiya T, Kumagai Y, Tsuboi Y, Sakurai-Yageta M, Oba M and Murakami Y.
  • 学会等名: The 10th AACR-JCA Joint Symposium of Cancer Research
  • 発表場所: Maui, Hawai, USA
  • 年月日: 2016-02-14
  • 国際学会
• [学会発表] Roles of a cell adhesion molecule CADM1 in apoptosis induction, invasion and metastasis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Murakami Y, Ito T, Kogai H, Sakurai-Yageta M, Kumagai Y, Matsubara D.
  • 学会等名: The 74th Annual Meeting of Japanese Cancer Association. Symposium
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-10-08
  • 招待講演
• [学会発表] Roles of a cell adhesion molecule CADM1 in apoptosis induction, invasion and metastasis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Murakami Y, Matsuda K, Kubo M.
  • 学会等名: 東京大学ゲノム医科学研究機構キックオフ・シンポジウム
  • 発表場所: 伊藤国際学術研究センター（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-08-29
  • 招待講演
• [学会発表] Analysis of the role of CADM1 in suppression of lung cancer using Cadm1-deficient mice. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Nagata M, Kawai T, Maruyama T, Sakurai-Yageta M, Ito A, Goto A, Matsubara D, Murakami Y.
  • 学会等名: AACR Annual Meeting
  • 発表場所: Philadelphia, PA, USA
  • 年月日: 2015-04-16
  • 国際学会
• [学会発表] Genomic and transcriptional alterations of cholangiocarcinoma. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Sakurai-Yageta M, Goto A, Murakami Y.
  • 学会等名: The 1st International Symposium for Biomarkers of Cholangiocarcinoma
  • 発表場所: 東京都新宿区
  • 年月日: 2015-01-24
  • 招待講演
• [学会発表] Involvement of CADM1 in apoptosis induction of detached epithelial cells as a new type of dependence receptor. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kogai H, Sakurai-Yageta M, Delloye-Bourgeois C, Tauszig-Delamasure S, Mehlen P, Murakami Y.
  • 学会等名: 4th France-Japan Cancer Workshop
  • 発表場所: 京都府京都市
  • 年月日: 2014-11-18 – 2014-11-21
  • 招待講演
• [学会発表] Involvement of a cell adhesion molecule CADM1 in oncogenesis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Murakami Y.
  • 学会等名: The 2nd International Alliance Research Internship Program Symposium of the University of Lyon.
  • 発表場所: フランス リヨン市
  • 年月日: 2014-11-03 – 2014-11-04
  • 招待講演
• [学会発表] Involvement of CADM1 in apoptosis induction of detached epithelial cells as a new type of dependence receptor. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kogai H, Sakurai-Yageta M, Tauszig-Delamasure S, Mehlen P, Murakami Y.
  • 学会等名: The 20th International Charles Heidelberger Symposium on Cancer Research、
  • 発表場所: チリ アリカ市
  • 年月日: 2014-10-08 – 2014-10-11
  • 招待講演
• [学会発表] Roles of a cell adhesion molecule CADM1 in epithelial integrity and malignant phenotype of cancer cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Murakami Y.
  • 学会等名: The 73rd Annual Meeting of Japanese Cancer Association
  • 発表場所: 神奈川県 横浜市
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] Context dependent features of a cell adhesion molecule CADM1 in human oncogenesis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Kogai H,Murakami S, Sakurai-Yageta M, Matsubara D, Murakami Y.
  • 学会等名: The 21st East Asia Joint Conference
  • 発表場所: 韓国 京城市
  • 年月日: 2014-07-15 – 2014-07-18
  • 招待講演
• [備考] 東京大学医科学研究所 人癌病因遺伝子分野
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/hitogan/index.html
• [備考] 東京大学医科学研究所人癌病因遺伝子分野
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/hitogan/index.html